| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,545,803 | T→A | 10.1% | intergenic (+24/+25) | PP_2232 → / ← PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,545,803 | 0 | T | A | 10.1% | 633.0 / 47.2 | 207 | intergenic (+24/+25) | PP_2232/PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/88); new base A (12/9); total (110/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGTCG > NC_002947/2545654‑2545952 | tcatcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCtgtg < 1:4243953/150‑1 (MQ=255) catcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGc < 1:3338631/150‑1 (MQ=255) atcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCa < 2:3956330/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGcc > 2:1004929/1‑150 (MQ=255) gagGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCa > 2:1443904/1‑150 (MQ=255) gagGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCa > 1:5625989/1‑150 (MQ=255) agGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGGTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaa < 2:3955635/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 1:1114616/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 2:5348107/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 2:418109/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 1:3424645/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 1:2175549/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 1:2554077/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg < 1:3434048/150‑1 (MQ=255) cGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGt < 2:3216587/150‑1 (MQ=255) gAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGtc > 1:713467/1‑150 (MQ=255) gAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCCGTGCAGCCCCAAAGGtc > 2:2329633/1‑150 (MQ=255) aGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGtct < 1:1230984/150‑1 (MQ=255) gCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGtctc < 1:5503740/150‑1 (MQ=255) cGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGc < 1:320678/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGTTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa < 2:4999729/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGTTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa < 2:4999843/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa > 1:1473075/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa < 2:2143971/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGAt < 1:1814804/150‑1 (MQ=255) ggTGGGGCAGTTCCATGTGGTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGc < 2:5248450/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCt > 1:209733/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCtttt > 1:5063701/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCCATGTGGTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCtttt < 1:2559703/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTc < 2:1967989/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 1:481569/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 1:1622739/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 2:1840633/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca < 1:4553744/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 2:5557773/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGAAGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 2:2478424/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGATTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcag < 1:5180084/150‑1 (MQ=255) aGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagc < 1:4446279/150‑1 (MQ=255) ttCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCTATCAGCTTTTcagcag > 1:2964237/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcg > 2:696686/1‑150 (MQ=255) tgtTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgtcg < 2:2222866/150‑1 (MQ=255) tgtTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgtcg < 2:1923947/150‑1 (MQ=255) ttCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGt > 1:4773387/1‑150 (MQ=255) ttCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGt > 1:3493110/1‑150 (MQ=255) gtCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGt < 2:5150574/149‑1 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCtt > 2:2884419/1‑150 (MQ=255) cAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCACAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTca > 2:3394458/1‑150 (MQ=255) cAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTca > 2:582619/1‑150 (MQ=255) gCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTg < 1:4329570/150‑1 (MQ=255) gTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGcct > 2:4984118/1‑148 (MQ=255) cGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgc < 2:742765/150‑1 (MQ=255) gTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgcc < 1:3528883/150‑1 (MQ=255) tAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgcca > 1:810283/1‑150 (MQ=255) tAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTATGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgcca < 2:2559956/150‑1 (MQ=255) aCGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgccaac < 1:4145480/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGAGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgccaacg > 2:4796544/1‑150 (MQ=255) gATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgccaacgc > 2:1215013/1‑150 (MQ=255) gATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgccaacgc > 2:1824133/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAAcgccg < 1:3011942/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCAt > 2:4390460/1‑150 (MQ=255) tggCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGTGCCTGCAGACTTTGGGGGTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCTGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGcc < 1:2387529/150‑1 (MQ=255) tggCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCACCATCGcc < 1:3683068/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTGTGCGCAATGTGGCTATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCGTCGCCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCa > 2:278494/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCAt < 1:138715/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCAt < 2:147899/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCAt < 1:4990104/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCACCGCCGCCATCGCCGAATCATGcc > 1:689046/1‑149 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGca > 1:2808310/1‑150 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGca > 2:4669258/1‑150 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGca < 1:2478424/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGca > 2:3524514/1‑150 (MQ=255) cgcAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAgc > 1:3207016/1‑150 (MQ=255) cgcAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAgc > 1:931460/1‑150 (MQ=255) gcAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAgcc < 2:4316843/150‑1 (MQ=255) agtgtgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAgccgc > 1:2396004/3‑150 (MQ=255) gtgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg < 1:1692531/150‑1 (MQ=255) gtgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg > 1:3948870/1‑150 (MQ=255) gtgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg < 1:1692238/150‑1 (MQ=255) ggCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCa > 2:3427221/1‑150 (MQ=255) ccgatcttGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCa > 2:1537267/7‑150 (MQ=255) gCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg > 2:4148107/1‑147 (MQ=255) gCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCAc > 2:2335817/1‑150 (MQ=255) tttGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGc < 1:4567784/150‑1 (MQ=255) tGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCtt < 1:3251174/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGc > 2:1046352/1‑150 (MQ=255) tGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTc > 2:4076634/1‑150 (MQ=255) gagaccTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAA‑GTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCAt < 2:1322022/112‑1 (MQ=38) gCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCg > 1:1419831/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGc > 2:4911813/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg > 1:2450521/1‑128 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:4534920/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:2996838/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:2727273/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:2288485/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:1741642/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGca > 1:4191674/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCa > 2:3561280/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAg > 2:3500825/1‑150 (MQ=255) tgctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGACAg > 1:4926673/1‑150 (MQ=255) gctgTGTAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAgg < 2:2905285/150‑1 (MQ=255) | ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGTCG > NC_002947/2545654‑2545952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |