| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,868,821 | T→G | 10.7% | S297A (TCG→GCG) | gllR → | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,868,821 | 0 | T | G | 10.7% | 588.3 / 11.1 | 235 | S297A (TCG→GCG) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (85/114); new base G (31/2); total (119/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.69e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2868673‑2868970 | tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc > 2:4260678/1‑150 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc > 2:2640720/1‑150 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGcc > 2:2924060/1‑150 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGcc > 2:1241090/1‑150 (MQ=255) tCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGcc > 1:1404396/1‑150 (MQ=255) cACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCGGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCg < 2:2212123/150‑1 (MQ=255) aCGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCgg < 1:3288458/150‑1 (MQ=255) aCGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCgg < 2:4277547/150‑1 (MQ=255) aCGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCgg > 1:1992479/1‑150 (MQ=255) gaatATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCAcgcccgcc > 1:640219/4‑150 (MQ=255) cTATGCCAGCGAGCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCACGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGCCCg < 2:4708941/150‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGt > 2:1254160/1‑150 (MQ=255) tATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCCCCCCgg > 2:3202491/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGAGCCGGCCCgcg < 2:3302401/150‑3 (MQ=255) tGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCa > 2:1056549/1‑150 (MQ=255) ccAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAgc < 2:1474693/150‑1 (MQ=255) aGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAgctg > 1:780086/1‑150 (MQ=255) gACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTc < 2:362463/150‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCGGCTCg > 1:1116526/1‑150 (MQ=255) tggtggGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCCTCAGCTGCTCGACa > 1:2879519/1‑150 (MQ=255) ggtggGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGGCGGGTCGCGGGCCCGGCAGCTGGTCGACaa > 1:1892323/1‑150 (MQ=255) gggCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTc < 1:4873141/148‑1 (MQ=255) gAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCCGCCCCACAGCAGCTCGACAACAGCtac > 1:3845584/1‑148 (MQ=255) atcaACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCGGCTCGACAACAGCTTCGCCGCcgcg > 2:2133756/1‑150 (MQ=255) caACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCggg < 2:668800/150‑1 (MQ=255) aaCGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGc < 1:951630/150‑1 (MQ=255) ggAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGAc > 1:887467/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAgc < 1:4277969/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGcc < 1:3444059/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGcc < 1:2684237/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGcc < 2:364708/150‑1 (MQ=255) tggtgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCTCCTGACGCTCTAGGGCGTGCACCTGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGt < 2:5586266/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCCGCCCCGCCGCGGCGCGCCAACAGCGTCGCCGCCGCGGGCCGGCCAGCGcccggg > 2:218331/1‑146 (MQ=255) 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gCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCgggg > 2:3145384/1‑148 (MQ=255) gCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGGGGCCgggg > 2:5409313/1‑148 (MQ=255) gCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCAGCTGCTCGACAACTCCGTCGACGCCGCGGGCCGGACAGCGCCGGGGCCggtg > 1:4018278/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCACGCCCGCCCCTCAGCAGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCCCCGGCCAGACACCGCCCTGGcccggg > 2:4093547/1‑146 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtggt < 1:5453659/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCggtggt < 2:1072265/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGtggtgg < 2:184143/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGGCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGACAGCGCCGGGGCCGGGGGTGGa > 1:4247272/1‑150 (MQ=255) gggggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACGAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCAGCAGGTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGacc > 1:4937960/1‑148 (MQ=255) gggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGGCCGCGGCGCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGTCCGCGCCGGGGCCGGGGGTGGGAAgc > 1:70654/1‑150 (MQ=255) ggCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAgcg < 1:1216772/150‑1 (MQ=255) gCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAgcgc < 2:760139/150‑1 (MQ=255) cccGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGGCGGCGCGCCGGCCCGGCAGCTGCGCGACCACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGGCAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAGCGCGCTGa > 1:2350238/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCGGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGTCAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGTCAGCGCCGTGGCGGGTGGTGGTAAGCGCTGATCt > 2:840036/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCCGCCCGTCCGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCGGACAGCCCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCGGATcg > 2:5245583/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCt < 2:1341334/149‑1 (MQ=255) tGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTgg < 1:4319387/150‑1 (MQ=255) ttGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCg < 1:2640720/150‑1 (MQ=255) tGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCgg < 1:2184425/150‑1 (MQ=255) tGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCgg < 1:1252855/150‑1 (MQ=255) 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cAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTTCGTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGt > 1:2758014/1‑150 (MQ=255) gggCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACACCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCAGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTAATCGTGCg > 1:1028707/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGt > 2:4548596/1‑150 (MQ=255) cGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTc < 2:3755851/150‑1 (MQ=255) tGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCgg < 1:2062141/150‑1 (MQ=255) acccagcgcgcCTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCGCGCCGGCCCGGCAGCTGCGCGGCAACTGCGTCGCCGCCGCGGGCCGGACAGCGCCGGGGCCGGGGGTGGACAGCGCTGCTCTGGCGGGTATCCGGGGCCTACTGGTGCGGGCGGAc > 2:3452955/6‑150 (MQ=255) aCCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACa > 1:5400622/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACAt < 1:1257558/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGGGGTGGCAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGgcggcg > 2:4820122/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGgt < 2:1547767/150‑1 (MQ=255) tgtTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGgtgt < 1:4419785/150‑1 (MQ=255) gtTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTc > 2:1970704/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGa > 2:2157866/1‑86 (MQ=255) tGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTg < 1:4678875/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTgcgc > 1:1120842/1‑150 (MQ=255) cgGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCAc < 2:892894/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCTCGCTGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa < 1:3868338/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCa < 1:3202491/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGt > 2:789445/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGtt > 2:4766420/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGtt < 1:2034876/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGtt < 1:3599067/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGtt > 1:3498208/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTg < 2:3845584/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTg < 2:3477132/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACAGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGc < 2:493983/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCt < 2:2009982/150‑1 (MQ=255) | GCCTCACGACTATGCCAGCGACCTGGTGGGCGAGCCGCTCATCAACGAGGAAATGGTGGTGCTGGCCCGTCGGGGGCACCCGCTGTTGCACACTCACCTGACGCTCAAGGGCGTGCACCAGGCGCG‑CTGGGTGTTGCCGCGGGCCGGCTCGCCGGCCCGTCAGCTGCTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCT > NC_002947/2868673‑2868970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |