Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 295,681 | T→G | 7.0% | intergenic (+28/+114) | PP_0241 → / ← PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 295,681 | 0 | T | G | 7.0% | 830.4 / 36.7 | 253 | intergenic (+28/+114) | PP_0241/PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/122); new base G (8/9); total (115/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GGCTTCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATA > NC_002947/295533‑295830 | ggCTTCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTg < 1:364787/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTg < 2:1336863/150‑1 (MQ=255) cTTCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCa < 2:2382585/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAG > 1:918385‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAG < 1:679402‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAG > 2:4862438‑M1/1‑150 (MQ=255) tCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGC < 2:2184179‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCT < 1:5150396‑M1/150‑1 (MQ=255) tATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTC < 1:3534259‑M1/150‑1 (MQ=255) tATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTAGGGCTGCAAAGCAGCCCcaa < 1:2706685‑M1/150‑4 (MQ=255) gatCGTCACGTCGGGGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATGGCCTTTGTGAAGTCGACCGCAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTC < 2:3641235‑M1/149‑1 (MQ=255) tCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGC > 2:2879523‑M1/1‑150 (MQ=255) tCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGATTTGCAGGTGGGAAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTATATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCgg < 1:5339178/150‑1 (MQ=255) ttCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCgggcaag > 1:4243599‑M1/1‑143 (MQ=255) tCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGc < 2:2076038/150‑1 (MQ=255) ggTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGccc > 1:845492/1‑150 (MQ=255) tatTACCACGCGTTCCGTGCGGGTGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGACGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGATGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcaagcccgct < 1:2008170‑M1/149‑14 (MQ=255) gATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcaagcccgct > 2:4042574‑M1/1‑137 (MQ=255) ttACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTcc < 1:4948617/150‑1 (MQ=255) caccCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCcaca < 2:1051726/150‑1 (MQ=255) accCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAg > 2:3359903/1‑150 (MQ=255) tCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTc < 1:2925921/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCa < 2:1500941/150‑1 (MQ=255) gggAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCt < 2:4355776/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTcc < 1:3359903/150‑1 (MQ=255) aGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCa < 2:1990354/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAg > 1:277878/1‑150 (MQ=255) ggAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTc > 2:1390738/1‑136 (MQ=255) ttGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTgcgc < 2:5221463/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCgggcaagcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgc < 2:1275076‑M1/150‑46 (MQ=255) ggTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCggg < 2:5429118/150‑1 (MQ=255) tGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGct > 2:3672846/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGctct < 2:845492/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGctct < 2:4610452/150‑1 (MQ=255) cAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCtgt < 1:2579355/150‑1 (MQ=255) agtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCtgtg < 1:1937370/150‑1 (MQ=255) agtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACACCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCtgtg < 1:2305138/150‑1 (MQ=255) gtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcacgcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgg < 2:602763‑M1/150‑58 (MQ=255) gtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTgg < 2:872486/150‑1 (MQ=255) gtgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCgggcaagcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgg < 1:2600960‑M1/150‑58 (MQ=255) cgggtgttcgaagcgtatctggggttgtatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatcTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTgg > 1:1659597‑M1/70‑150 (MQ=255) tgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcacgcccgctcccacagagcccgcgccccccgtggagcttgcgagtacctgtggg < 1:2210459‑M1/150‑59 (MQ=255) tgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTggg < 1:5260158/150‑1 (MQ=255) tgaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTGCGCCGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGgggg > 2:5196663/1‑150 (MQ=255) gggtgttcgaagcgtatctgggggtgtatctgccgccgtttctggccaagcggtccagctgagaaatcTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTggg > 2:5023681‑M1/69‑150 (MQ=255) gaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcacgcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtggga < 2:3903488‑M1/150‑60 (MQ=255) gaagtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcacgcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtggga < 1:1367804‑M1/150‑60 (MQ=255) agtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcacgcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagc < 2:5117975‑M1/150‑62 (MQ=255) agtgaTTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGc < 2:905179/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCtt > 2:2702399/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGcc > 2:333532/1‑150 (MQ=255) tgtgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCcggcaagcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggc < 1:4042619‑M1/150‑74 (MQ=255) gtgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCgg < 2:4578352/139‑1 (MQ=255) gtgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCgg > 1:4578352/1‑139 (MQ=255) tgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCgcga < 2:1653152‑M2/150‑5 (MQ=255) tgAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCgcga < 2:2267776‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCgcgaagggc > 1:976316‑M2/1‑141 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCgg > 2:438869/1‑131 (MQ=255) gACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCgg < 1:438869/131‑1 (MQ=255) aCCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccgc > 1:1403552/1‑150 (MQ=255) aCCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccgc > 2:5623794/1‑150 (MQ=255) aCCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccgc < 1:2415989/150‑1 (MQ=255) tatctgccgccgtttctggccaagcgttccagctgagaaatcTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGgccgcc > 1:240907‑M1/43‑150 (MQ=255) tgtCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCCGCTTGGCGGCCCTTCGCgggcaagcccgctcccacagagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcag < 2:761475‑M1/150‑91 (MQ=255) tCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGcc > 1:5565921/1‑150 (MQ=255) tATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGcccc > 2:142829/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCa < 1:1721458/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCAGATTTGCAGCACTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGAGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCa > 1:3263617/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAg > 2:4159902/1‑150 (MQ=255) cGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGcccttcg < 1:5416548/150‑5 (MQ=255) gCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAt < 1:1055985/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAt > 1:5582153/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAttt > 2:4428286/1‑150 (MQ=255) aGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTtct < 2:4756146/150‑1 (MQ=255) tgtgATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAg > 1:4721004/1‑150 (MQ=255) tgtgATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAg > 2:3499379/1‑150 (MQ=255) tgtgATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAg > 2:3079793/1‑150 (MQ=255) agcgtcccagctgagaaatcTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCCCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGGGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGc > 1:87606‑M1/21‑150 (MQ=255) gcggcgGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGaa > 1:1578745/1‑150 (MQ=255) cggcggGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAAc < 2:692759/150‑1 (MQ=255) gggTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTATGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCtt < 1:432327/150‑1 (MQ=255) gTCTATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg < 1:498729/150‑1 (MQ=255) gTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTGCAGGGTGCGCGGGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg > 1:4010513/1‑150 (MQ=255) gTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg > 1:1913015/1‑150 (MQ=255) gTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTgg > 1:2349717/1‑150 (MQ=255) gATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCa > 2:5047967/1‑150 (MQ=255) tatTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGa > 1:2570354/1‑150 (MQ=255) gaaGGGCTGCAAAGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGaaa < 2:1752131‑M1/147‑1 (MQ=255) GGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcgg < 2:2579256‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcgg < 1:734060‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCgcgaagggccgccaagcggccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgataga < 2:1747693‑M2/150‑59 (MQ=255) GGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggc > 2:2795587‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggc > 2:1913015‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggc > 1:4862438‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggc > 2:4252311‑M1/1‑150 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACggcggc > 1:3035702/1‑150 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACggcggc > 2:375367/1‑150 (MQ=255) ctTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGAGTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAg > 1:4612801/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGAt < 2:2104647/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATa < 1:3148580/150‑1 (MQ=255) | GGCTTCGGGTATCGTCACTTCGGTGATTACCACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATA > NC_002947/295533‑295830 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |