Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,533,561 | T→A | 7.3% | L129Q (CTG→CAG) | dnaEB → | error‑prone DNA polymerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,533,561 | 0 | T | A | 7.3% | 788.3 / 37.7 | 248 | L129Q (CTG→CAG) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/103); new base A (14/4); total (139/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.24e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.40e-01 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GTGCGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTGGCGGCTG > NC_002947/3533412‑3533710 | gtgCGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCctgct < 1:4822428/150‑1 (MQ=255) tgCGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCctgctg < 1:4600334/150‑1 (MQ=255) tgCGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCctgctg > 1:1701635/1‑150 (MQ=255) cGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGc < 1:1539941/150‑1 (MQ=255) gACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCCGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGcc > 2:4061100/1‑150 (MQ=255) ggCCCACGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgt < 1:2029924/150‑1 (MQ=255) ggCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgt < 1:3860350/150‑1 (MQ=255) ggCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgt < 1:2789358/150‑1 (MQ=255) ggCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgt < 1:2764298/150‑1 (MQ=255) ggCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgt < 2:3744638/150‑1 (MQ=255) gCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTtgtg > 1:5465328/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCA‑CAAGGCCAGCAGGCCTtggtg < 2:5379890/150‑4 (MQ=255) ccAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTgtggg > 2:821838/1‑150 (MQ=255) ccAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTgtggg > 2:3650779/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTgtgggt > 1:3995886/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTgtgggt > 2:2083200/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTgtgggt < 2:453300/150‑1 (MQ=255) tgctgGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACa > 2:120052/1‑150 (MQ=255) tgctgGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACa < 1:3120960/150‑1 (MQ=255) ggTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGGGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTgg < 2:3094971/150‑1 (MQ=255) tCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCg < 1:2203121/150‑1 (MQ=255) cGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGa < 1:2402949/150‑1 (MQ=255) cGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGa < 2:4278174/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATa > 2:5237811/1‑150 (MQ=255) aaaaCCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATa < 1:4230629/150‑1 (MQ=255) aaaCCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATAc > 1:3058643/1‑150 (MQ=255) gACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTAc > 2:2989628/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTAcc > 1:3651754/1‑150 (MQ=255) cGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCg < 2:2445641/150‑1 (MQ=255) gTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGgcg > 2:4787092/1‑150 (MQ=255) ttACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGgcgc > 1:4574883/1‑150 (MQ=255) ttACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGgcgc < 2:2570544/150‑1 (MQ=255) ttACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGgcgc > 1:1884750/1‑150 (MQ=255) ccAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTg > 2:2138341/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTg > 2:1380142/1‑150 (MQ=255) aCCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTgc < 1:4302177/150‑1 (MQ=255) tgCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgt < 1:359770/150‑1 (MQ=255) tgCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgt < 1:3368152/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAACTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgtg < 2:4379520/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgtgt < 2:2232024/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgtgt < 2:514791/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgtgt < 2:514971/150‑1 (MQ=255) cgcTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAgtgtgt > 1:3774959/1‑150 (MQ=255) tGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCg > 2:4896228/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCt > 1:1630833/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCt > 1:5329119/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTAc > 2:2702228/1‑118 (MQ=255) cccGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAgc > 1:5151353/1‑150 (MQ=255) cGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTGGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAgcgc > 2:240779/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGTTGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGcca > 1:1159922/1‑149 (MQ=255) cggcggcggGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAgc > 2:2725675/1‑142 (MQ=255) cggcggcggGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGtgg < 1:2456908/150‑1 (MQ=255) cggcggGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGGTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGtggctg < 2:5595199/150‑1 (MQ=255) cAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGc < 2:5368310/150‑1 (MQ=255) agagAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCa > 1:3154610/1‑150 (MQ=255) agagAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCa < 1:1841288/150‑1 (MQ=255) gagaAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCAc < 2:3793337/150‑1 (MQ=255) gagaAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCAc > 2:609062/1‑150 (MQ=255) gaAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCt < 1:1287327/150‑1 (MQ=255) aGGGGGCGTTGCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGc < 1:4430551/150‑1 (MQ=255) aGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGc < 1:457962/150‑1 (MQ=255) ggggCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCAt > 2:2049880/1‑150 (MQ=255) gggCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATc > 1:4744740/1‑150 (MQ=255) ggCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCg < 2:792786/150‑1 (MQ=255) gTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCgggg < 2:855460/150‑1 (MQ=255) cAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGt > 2:2002652/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTg > 2:1640504/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTg > 2:1011146/1‑150 (MQ=255) gatgaCTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTg > 1:1052835/1‑150 (MQ=255) gatgaCTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTg > 1:991053/1‑150 (MQ=255) atgaCTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTgc > 2:4458950/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTg > 1:556421/1‑150 (MQ=255) tgctgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAAc < 1:1313171/150‑1 (MQ=255) tgctgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAAc > 1:1381780/1‑150 (MQ=255) tgctgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAAc > 1:5292139/1‑150 (MQ=255) tgctgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAAc < 1:4166103/150‑1 (MQ=255) gctgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACg > 2:2826073/1‑150 (MQ=255) tgcACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGt > 2:759663/1‑150 (MQ=255) cacccacaAGGCCAGCAGGCCTTGGTGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGt > 1:822914/7‑123 (MQ=39) cacccacaAGGCCAGCAGGCCTTGGTGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTg > 1:244159/7‑150 (MQ=255) cacccacaAGGCCAGCAGGCCTTGGTGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTg > 1:3973908/7‑150 (MQ=255) caccacCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGTATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTg > 2:4639546/1‑150 (MQ=255) caccacCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTg > 1:2383243/1‑150 (MQ=255) caccacCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTg > 1:2383318/1‑150 (MQ=255) accaccAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGc < 1:1926302/150‑1 (MQ=255) ccacaAGGCCAGCAGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCgg > 2:4829998/4‑150 (MQ=255) ccacaAGGCCAGCAGGCCTTGGGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCgg > 2:3242806/4‑150 (MQ=255) caccaAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCgg < 1:772653/150‑1 (MQ=255) caccaAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCgg > 1:2300340/1‑150 (MQ=255) accaAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCggg < 1:2061403/150‑1 (MQ=255) ccaAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGc > 2:2767629/1‑150 (MQ=255) ccaAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGc > 1:879137/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTg > 2:814507/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCCGCAACCGTTGCAGGcgcacg < 2:5465328/150‑6 (MQ=255) gCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCACCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTgg > 2:2214815/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTggc > 1:4663168/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTggcg > 1:496049/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTggcgg < 2:1279846/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTggcgg > 2:1097829/1‑150 (MQ=255) ctgGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTGGCGGCt > 1:2718779/1‑150 (MQ=255) | GTGCGACGGGCCCAAGCTGGTGCTGCTGGTCGAAAACCTGACGGGTTACCAGAACCTGTGCGCGCTGATCACCCGTGCCCGGCGGCGGGCAGAGAAGGGGGCGTACCAGCTGTTTCGTGATGACTTGCTGCTGCACCACCAAGGCCTGCTGGCCTTGTGGGTGGCCGCTGACAGTGGCGATACTGCTACCGGCGCGTGGCTGCGCAGTGTGTTCGCTGAGCGCCTGTGGCTGGCCGTGCACCTGCATCGGGGCAGTGACGATGCCGTGCGCCTGCAACGGTTGCGGGCACTGGCGGCTG > NC_002947/3533412‑3533710 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |