Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,576,669 | C→G | 5.1% | R236G (CGC→GGC) | yneJ → | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,576,669 | 0 | C | G | 5.1% | 745.1 / 19.4 | 219 | R236G (CGC→GGC) | yneJ | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (111/96); new base G (3/9); total (114/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAGG > NC_002947/3576521‑3576817 | cGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCcgcg > 2:2190292/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCcgcg > 1:231350/1‑150 (MQ=255) cTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACGTCGAACACTGGGTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcag < 2:64099/150‑1 (MQ=255) ttCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcagc > 1:585709/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcagc < 2:4700653/150‑1 (MQ=255) ttCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcagc < 2:1867208/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCAt < 2:3992804/150‑1 (MQ=255) cgcgCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCATg < 2:3743354/150‑1 (MQ=255) cgcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGGGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCATggc < 1:5003578/150‑3 (MQ=255) gcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCATggcc < 2:691122/150‑4 (MQ=255) gcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTc < 1:3302118/150‑1 (MQ=255) gcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGGTCGTGCAGGACCAGGCGGGACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTc < 1:3644862/150‑1 (MQ=255) ccAACTCATCATACCGCCATCACGTCCAAAACAGGTTCCTCCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACCAAATGGAGTCGTACCACGGCATGATGGCCTGCGACAGTGCGGGTGCCGGCCTGCCCATGCTGCGCGGCAGCATggcca < 2:3211569/150‑5 (MQ=255) aaCTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGAc > 1:2969259/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGAc > 1:2969132/1‑150 (MQ=255) tGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAat > 1:927483/1‑150 (MQ=255) tGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAat > 1:2402974/1‑150 (MQ=255) ttCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAatat > 1:1471785/1‑150 (MQ=255) aTACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTc < 1:3241452/139‑1 (MQ=255) tACCGCCATCACTTCGAAAACTGGGTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGccc < 1:3977736/150‑1 (MQ=255) aCCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCg > 1:5495027/1‑150 (MQ=255) gCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGt > 2:2775410/1‑150 (MQ=255) gCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGt < 1:350510/150‑1 (MQ=255) aCTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgcagca > 2:4577005/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCAcc > 1:5064467/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCAcc > 2:1136964/1‑150 (MQ=255) cGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGTTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGt > 2:4934419/1‑150 (MQ=255) gAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTc > 2:2709721/1‑150 (MQ=255) gtgTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGcc > 2:1818086/3‑150 (MQ=255) ggTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCt < 2:4649728/150‑1 (MQ=255) gTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg > 1:1036256/1‑150 (MQ=255) gTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg < 2:154878/150‑1 (MQ=255) gTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg > 2:5102145/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCa > 2:2623759/1‑150 (MQ=255) gCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAAt < 1:2480224/150‑1 (MQ=255) gCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAAt > 1:5544135/1‑150 (MQ=255) aGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCAGGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGt < 2:4256895/150‑1 (MQ=255) ggACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTc > 2:276174/1‑150 (MQ=255) ggACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTc > 2:5184203/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 2:4019704/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 1:4286755/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga > 1:579766/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggag > 2:2040826/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggag > 2:1966011/1‑150 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAt > 2:2279627/1‑150 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAt < 1:4365309/150‑1 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAt < 1:3866780/150‑1 (MQ=255) caTTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATCCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGaa < 1:3738472/149‑1 (MQ=255) ttCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGaaaa < 1:4948974/150‑1 (MQ=255) tCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAc > 2:911227/1‑150 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACct > 1:805381/1‑150 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACct > 1:3441224/1‑150 (MQ=255) gAAATGGAGTCGGACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctgg < 2:4246851/150‑1 (MQ=255) aaaTGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggc < 1:1792710/150‑1 (MQ=255) aaaTGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggc > 1:1510087/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggct < 1:1139553/150‑1 (MQ=255) tGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggctgg < 1:1105782/150‑1 (MQ=255) ggAGTCGTACAACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGt < 2:4188167/150‑1 (MQ=255) aGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTAt < 1:1567633/150‑1 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcg > 1:1983070/1‑150 (MQ=255) aCCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgac > 1:1177576/1‑150 (MQ=255) ccACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacg > 1:2679824/1‑150 (MQ=255) ccACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacg > 1:3290914/1‑150 (MQ=255) cACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga > 2:1508063/1‑110 (MQ=255) cACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacga > 2:1317762/1‑150 (MQ=255) cACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacga > 2:4178021/1‑150 (MQ=255) cGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAgg > 1:531870/1‑150 (MQ=255) cATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTAc > 2:2333031/1‑150 (MQ=255) aTGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg < 1:2118074/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGtctc > 2:5432937/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGtctc > 2:3533253/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTcgc > 1:2702247/1‑150 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTcgcg > 1:2016656/1‑150 (MQ=255) gCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCa < 2:2660956/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGtt > 2:3585136/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGtt > 2:3407092/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGttt < 2:2969132/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGttt < 1:688133/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTg < 2:742918/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGa < 1:2893255/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAg < 2:3369188/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGc < 2:1052685/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCAt > 2:2925686/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCAt > 2:2925325/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCAt > 2:5386688/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTcat > 2:4909167/1‑148 (MQ=255) gCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGa < 1:682881/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAg > 1:5474428/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAc < 2:439837/94‑1 (MQ=255) tGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAc > 1:439837/1‑94 (MQ=255) tGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGt < 2:4283380/150‑1 (MQ=255) gagcATGCTGCGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGtt > 2:2473786/4‑150 (MQ=255) gcATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGc < 1:4796739/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCtt < 1:519946/150‑1 (MQ=255) gctgcCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTga < 1:3540835/150‑1 (MQ=255) gctgcCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTga < 2:2866234/150‑1 (MQ=255) tgcCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTgaag > 1:4869132/1‑150 (MQ=255) gcCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTgaaga > 1:3077272/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAgg > 1:2271676/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAgg > 1:2918213/1‑150 (MQ=255) | CGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAGG > NC_002947/3576521‑3576817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |