| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 297,351 | T→G | 5.1% | E218D (GAA→GAC) | gshA ← | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 297,351 | 0 | T | G | 5.1% | 832.5 / 20.2 | 244 | E218D (GAA→GAC) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (119/110); new base G (10/3); total (130/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.28e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TGCCCACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACT > NC_002947/297203‑297500 | cccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCg < 2:570410/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGa > 2:3651981/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTg < 1:1985625/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTCTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTg < 2:1231326/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCGAAGAGCTgg < 2:2462559/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgc > 2:2196616/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggcg < 2:5102272/150‑1 (MQ=255) aGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcgggcgg < 1:392556/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGcc < 1:1745766/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGcc > 1:2820695/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCATCGAGCTGGTGCGGGCGGCCAc > 1:1940752/1‑150 (MQ=255) tCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGc > 2:3043083/1‑150 (MQ=255) tgtAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGa < 2:1448454/150‑1 (MQ=255) gtAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGaa < 1:4518722/150‑1 (MQ=255) tAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAg > 2:911856/1‑150 (MQ=255) tAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAg < 2:2554736/150‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCt < 1:3732567/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCttt < 2:3960556/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTg < 1:1651786/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTc > 2:1131398/1‑150 (MQ=255) ttgttgTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAgg < 2:4583906/150‑1 (MQ=255) ttgttgGAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAgg < 2:5296867/150‑1 (MQ=255) tgttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAggg > 2:2734433/1‑150 (MQ=255) ttgtATCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGcc > 2:2777790/1‑150 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAggg > 2:4405662/1‑148 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAggg < 1:4405662/148‑1 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGcc > 2:4665780/1‑150 (MQ=255) ttgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGcc < 1:4788865/150‑1 (MQ=255) tgtAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCg < 1:1692318/150‑1 (MQ=255) aGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCg > 1:2389572/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGa < 2:2936472/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAg < 1:2814991/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAgg < 1:2452719/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGgcg > 1:4105832/1‑150 (MQ=255) ggCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGgcg > 1:1345039/1‑150 (MQ=255) gCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTgcggg < 1:3057540/110‑1 (MQ=255) tAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGa > 2:1901357/1‑150 (MQ=255) ggccggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTGGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACa < 2:677148/150‑1 (MQ=255) cggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGt < 2:1174400/150‑1 (MQ=255) ggccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTa < 2:4836032/150‑1 (MQ=255) gccTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTAc < 1:3604275/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATca > 2:1345262/1‑150 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATca < 2:4308788/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATca < 1:844037/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcag < 2:2953816/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcag < 2:4866838/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca < 1:1561750/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca < 2:769014/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca > 1:2147895/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagca < 2:3281570/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCAAGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATcagcag > 1:1985025/1‑150 (MQ=255) gCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGcagcca < 2:1524909/150‑1 (MQ=255) ctGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCt < 1:4925468/150‑1 (MQ=255) tGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACa > 2:1003729/1‑130 (MQ=255) tGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACa < 1:1003729/130‑1 (MQ=255) aaCCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgc < 2:4744977/150‑1 (MQ=255) cccAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcgg > 1:4032259/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcggc < 2:2147895/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcggc > 1:3551916/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcggcg < 1:2538640/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAgcggcg < 1:2331021/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGcggcgg > 1:2302475/1‑150 (MQ=255) gCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGtt > 1:603870/1‑150 (MQ=255) gCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGtt > 1:2657507/1‑150 (MQ=255) gCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGtt > 2:2219550/1‑150 (MQ=255) cTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTa < 1:5076297/150‑1 (MQ=255) tCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTAc < 2:603870/150‑1 (MQ=255) tCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTAc > 1:3366206/1‑150 (MQ=255) tCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTAc > 1:3417970/1‑150 (MQ=255) tCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTAc < 2:1268784/150‑1 (MQ=255) tCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTAc > 1:5171970/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGa > 1:3627201/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGa < 2:3627201/148‑1 (MQ=255) gcAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCa < 2:4940193/150‑1 (MQ=255) gtggCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATg > 1:1316806/1‑150 (MQ=255) gCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAg > 2:2136585/1‑150 (MQ=255) cATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAgg > 2:2319926/1‑150 (MQ=255) ggCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGGTGTAGGCcgac < 1:4095684/150‑1 (MQ=255) aGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCcgacgag > 2:5458044/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACt < 2:1599298/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTg < 1:408685/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTgg < 1:3025037/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTgg > 1:5614639/1‑150 (MQ=255) aGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAg > 1:5209335/1‑150 (MQ=255) tttCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTcgc > 2:3520257/1‑150 (MQ=255) ccgcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTc > 1:183137/6‑150 (MQ=255) ccgcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTc > 1:4650038/6‑150 (MQ=255) gCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCa > 1:5275225/1‑150 (MQ=255) gCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCa > 1:2561902/1‑150 (MQ=255) gcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAt > 2:1727676/4‑150 (MQ=255) gcaccAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAt > 2:3104070/4‑150 (MQ=255) aTCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtt > 2:3538958/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtt > 2:3983451/1‑150 (MQ=255) accAGCTCGAAGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAttt > 2:1697615/2‑150 (MQ=255) ccAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtttt < 2:4337466/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCAtttt > 1:1768250/1‑150 (MQ=255) aGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTcc < 1:3145706/150‑1 (MQ=255) aGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTcc < 1:1022513/150‑1 (MQ=255) ctctTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGaa > 2:4088313/1‑96 (MQ=255) ttCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACt < 1:390034/150‑1 (MQ=255) | TGCCCACGGCCTTGCGCAGGCTGTCGGTGTAGCTGGCCAGGTTGTTGTAGCAGGGCGTAAGGCCGGCCTGGGCGTTGCTCTGGTAACCCAGGTCGCTCATGCGCAGGCTGGTGGCATAAGGCAGGAACAGGGTTTCGGCATCCAGCTCTTCGAGCTGGTGCGGGCGGCCACGCAGGAAGCCTTTGTCCAGGGCCGGCGAGGCGCCGAACAGGTACATCAGCAGCCAGCTGTAGCGGCGGAAGTTACGAATCAGCGCGATGTAGGCCGACGACTGGTAGTCGCGGTCATTTTCCGTACT > NC_002947/297203‑297500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |