| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1015867 = | 10 (0.040) | 285 (1.080) | 138/288 | 0.2 | 65.1% | intergenic (‑94/‑674) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
| ? | NC_002947 | 5406744 = | 296 (1.120) | intergenic (+1123/+45) | PP_4743/PP_4745 | hypothetical protein/transposase | |||||
Only 100 of 510 total aligned reads displayed.
GCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCA > NC_002947/1015719‑1016016 | tacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCa < 2:5749671‑M1/2‑1 (MQ=255) cacacaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACaa < 2:5281176/150‑1 (MQ=255) cacacaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACaa < 1:1473325/150‑1 (MQ=255) cgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAg > 2:2516918‑M1/147‑150 (MQ=255) tggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGaa > 2:4850289‑M1/145‑150 (MQ=255) acaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGGACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGaa > 1:648318/1‑150 (MQ=255) acaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATAGTTTACACAAGaa < 1:1203573/150‑1 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGTATTTa > 2:361601‑M1/141‑150 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 2:2762717‑M1/141‑150 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 1:1829756‑M1/141‑150 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 1:804916‑M1/141‑150 (MQ=255) cgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGc > 1:4865239‑M1/139‑150 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:367002‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:4407348‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:2648963‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa < 2:5605993‑M2/150‑5 (MQ=255) tGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaag > 2:3505095‑M2/1‑145 (MQ=255) ccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCg < 1:505447‑M1/14‑1 (MQ=255) 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aaTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat < 1:5385872‑M2/150‑14 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTAt > 1:1050457‑M1/129‑150 (MQ=255) tAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatc > 2:3664833‑M2/1‑133 (MQ=255) gcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATgcgc > 2:382673‑M1/125‑150 (MQ=255) ccGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:2915078‑M2/1‑130 (MQ=255) ctgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGAtt < 2:3417748‑M1/30‑1 (MQ=255) tgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTa < 2:3009279‑M1/31‑1 (MQ=255) tgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTa < 1:5602631‑M1/31‑1 (MQ=255) gccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTaa > 1:1716603‑M1/119‑150 (MQ=255) gccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTaa > 2:1262715‑M1/119‑150 (MQ=255) accGGTAACCAGAACTCTCATAATTCACTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattcca > 2:3367314‑M2/1‑122 (MQ=255) acgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGAt < 2:360134‑M1/37‑1 (MQ=255) aGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacc > 1:5701132‑M2/1‑112 (MQ=255) gcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAggg > 2:2397228‑M1/100‑150 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 1:5243245‑M2/150‑46 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 1:2839891‑M2/150‑46 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 1:4142591‑M2/150‑46 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 2:2955172‑M2/150‑46 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaaggga < 1:3501169‑M2/113‑9 (MQ=255) gactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGttt > 1:5913647‑M1/97‑150 (MQ=255) 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ccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAAc > 1:1553546‑M1/37‑150 (MQ=255) accttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCg < 2:1802561‑M1/116‑1 (MQ=255) tGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaa > 2:1387594‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGAATAAATTAGTGGAATCATTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacct > 2:3923162‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGAATAAATTAGTGGAATCATTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacct < 1:3923162‑M2/74‑40 (MQ=255) gtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCgg < 2:2064343‑M1/124‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgt > 1:2092082‑M2/1‑12 (MQ=255) acacAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgtg < 1:1162547‑M2/150‑140 (MQ=255) acacAAGAATTgtaagggatccagcatccccacattccaacagtacacctgattcccgatgctgtgcgcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtatacctctaccccaagcccgtg < 2:1612470‑M2/150‑140 (MQ=255) CAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCa < 2:102054‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCA > NC_002947/1015719‑1016016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |