New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 746964 | NA (NA) | 225 (0.850) | 107/290 | 1.3 | 91.8% | intergenic (‑88/‑706) | PP_0638/PP_5448 | transposase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1015874 | 20 (0.080) | intergenic (‑101/‑667) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
Only 100 of 528 total aligned reads displayed.
AGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCAAGGTCAG > NC_002947/1015725‑1016023 | tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGTATTTa > 2:361601‑M1/141‑150 (MQ=255) tgcgccacgtccaggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 2:5248460‑M1/141‑150 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:5933074‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:367002‑M2/1‑146 (MQ=255) tGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaag > 2:3505095‑M2/1‑145 (MQ=255) cTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaaggga < 2:4917753‑M2/150‑9 (MQ=255) gtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccggagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCATGAATTTAGCCGtttt > 2:4341554‑M1/133‑150 (MQ=255) gtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGtttt > 2:5733149‑M1/133‑150 (MQ=255) cAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTAAACAAGAAATgtaagggatcaa < 1:4047113‑M2/150‑13 (MQ=255) aaTGTAACCTCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATGAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat > 2:4605295‑M2/1‑137 (MQ=255) aaTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat < 1:5385872‑M2/150‑14 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTAt < 2:679410‑M1/22‑1 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTAt > 1:1050457‑M1/129‑150 (MQ=255) 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tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 2:1185778‑M2/150‑46 (MQ=255) gactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTCTGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGttt < 2:1247673‑M1/54‑1 (MQ=255) gactacgaagccctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttcgcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGttt < 2:2114511‑M1/54‑1 (MQ=255) actacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTa > 1:1392254‑M1/96‑150 (MQ=255) aTTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatg < 2:1075684‑M2/150‑51 (MQ=255) 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tacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCg > 2:5183712‑M1/4‑150 (MQ=255) acaAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgtgga < 1:4225962‑M2/150‑142 (MQ=255) acaAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgtgga < 1:982866‑M2/150‑142 (MQ=255) acaAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtacacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctagctctaccccaagcccgtgga < 1:2600194‑M2/150‑142 (MQ=255) aaGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccc > 1:2476256‑M2/1‑7 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |