New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1015874 | 21 (0.050) | intergenic (‑101/‑667) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
TCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/746817‑746964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTTTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATAC < NC_002947/1015874‑1015727 TCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACA < 2:5263431/149‑1 CGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAA < 2:5391172/149‑1 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TGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGC < 1:1599628/149‑1 GGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCG < 1:8321111/149‑1 GGGCTGAGGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCAGGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGG < 1:278893/149‑1 GGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGG < 1:1901569/149‑1 GGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGG < 1:8397742/149‑1 GATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTT < 2:2714697/149‑1 GATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTT > 2:5062628/1‑149 ATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTA > 2:1192027/1‑149 ATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACAT < 2:3463828/149‑1 TGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATT < 1:1327273/149‑1 GATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGG < 1:6134036/149‑1 GATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGG < 2:5023443/149‑1 GATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGG < 2:4746027/149‑1 ATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGA > 2:873248/1‑149 CCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAG < 2:6943018/149‑1 CTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTC > 1:3349548/1‑149 TTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCA > 1:7673910/1‑149 TTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCA > 1:2890596/1‑149 TTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTAGGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCA > 1:5605558/1‑149 ACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATA < 2:1468588/149‑1 CAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATAC > 2:6317442/1‑149 TCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/746817‑746964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTTTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATAC < NC_002947/1015874‑1015727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |