| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 838,010:1 | +C | 5.9% | intergenic (‑43/+37) | pth ← / ← rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 838,010 | 1 | . | C | 5.9% | 833.6 / 42.8 | 187 | intergenic (‑43/+37) | pth/rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (89/87); new base C (7/4); total (96/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTCA > NC_002947/837864‑838159 | gcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACt > 2:4403348/1‑150 (MQ=255) gcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACt < 1:4039709/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGt > 1:1315091/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCGTTCAACGAACAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTa < 2:1787902/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTaa > 1:4168319/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAcc > 2:2543423/1‑150 (MQ=255) gCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCCACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGa < 2:2657511/150‑1 (MQ=255) cGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGATCGGGTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAAcccac < 2:1603954/150‑3 (MQ=38) gTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATc > 2:198188/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGC‑GGGTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAAccca > 2:4466155/1‑142 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGc > 1:2499313/1‑150 (MQ=255) cGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGcc > 1:1002666/1‑150 (MQ=255) gAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGAACAACGCCg > 1:789311/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGc < 1:1573425/150‑1 (MQ=255) ccccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGa < 1:1885973/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt < 2:284781/150‑1 (MQ=255) cTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTg > 1:1680773/1‑150 (MQ=255) gCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa < 1:1870507/150‑1 (MQ=255) gTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGAtt > 2:1284706/1‑150 (MQ=255) ttATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTa > 1:3566132/1‑150 (MQ=255) gggTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa > 1:1959199/1‑150 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACACAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGccat > 2:3994472/1‑148 (MQ=255) tCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc < 2:1599243/150‑1 (MQ=255) tCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc > 1:1052122/1‑150 (MQ=255) tCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc > 1:4510596/1‑150 (MQ=255) tATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgc < 1:2671721/150‑1 (MQ=255) ttCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgctt > 1:1394019/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgctt < 2:3478539/150‑1 (MQ=255) tcgttggCCTGGGTAACCCCGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgctt > 1:1467155/6‑150 (MQ=255) tCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttc < 1:251249/150‑1 (MQ=255) gttggCCTGGGTAACCCCGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACATTT‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGAGCcttattcttct > 1:3976574/4‑150 (MQ=255) cGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttct < 2:873985/150‑1 (MQ=255) cGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttct < 2:1770923/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttctg > 2:1111060/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAg < 1:3247114/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAg > 1:4036760/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGc > 2:2185523/1‑150 (MQ=255) gggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAc < 2:1461203/150‑1 (MQ=255) tACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGt < 1:3081871/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTgg < 2:3606049/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGa > 1:4459278/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGa > 2:2427356/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGa > 2:2896193/1‑150 (MQ=255) aGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGc < 1:2865790/150‑1 (MQ=255) gCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGt < 2:4072744/150‑1 (MQ=255) gCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGt > 1:4502729/1‑150 (MQ=255) ccAACGATCCACGGGCTGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTGACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTg < 2:3126954/150‑1 (MQ=255) cAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGa > 2:1386298/1‑150 (MQ=255) cAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGa > 2:342848/1‑150 (MQ=255) cAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGa > 2:903434/1‑150 (MQ=255) ccGATCAACTGGATGGTGGTCCCGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GGACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAAc < 1:2253633/149‑1 (MQ=255) tCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTgg < 1:1226167/97‑1 (MQ=255) tCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 1:1807021/150‑1 (MQ=255) cAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTgg > 2:2484326/1‑150 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGc > 1:265301/1‑150 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGc > 2:2274994/1‑150 (MQ=255) aCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTAATCGGCAGCGCCGTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCa > 1:4153472/1‑150 (MQ=255) gggATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAAc < 2:294905/149‑1 (MQ=255) ggATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACa < 2:1183189/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACa > 1:2944780/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCATTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACa < 2:3363135/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCATTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACa < 2:1751854/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGc < 1:2896193/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGCGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 1:2346903/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 2:4048068/150‑1 (MQ=255) ggTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGt > 2:133926/1‑150 (MQ=255) gTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGtc < 1:2278812/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCAc > 2:1954546/1‑150 (MQ=255) ggggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTg > 2:2056086/1‑150 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 2:2313267/150‑1 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCCGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 2:3741543/150‑1 (MQ=255) ctctTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTAAAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGcc > 1:987590/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCaga < 1:3831957/150‑1 (MQ=255) tCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCagag < 2:3922726/150‑1 (MQ=255) cTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcg > 1:2926517/1‑150 (MQ=255) ttGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcga > 1:2801960/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcgac < 1:1378288/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcgacga > 2:3906977/1‑150 (MQ=255) ttGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAAct > 2:645640/1‑150 (MQ=255) gt‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTa < 2:1064058/150‑1 (MQ=255) gt‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTa < 1:3648169/150‑1 (MQ=255) gt‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTa > 1:3396369/1‑150 (MQ=255) gt‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGAGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTa > 1:3993588/1‑150 (MQ=255) t‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTAc < 2:2732624/150‑1 (MQ=255) ggTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGc > 1:3305040/1‑150 (MQ=255) ggTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGc < 2:194141/150‑1 (MQ=255) gTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGcc > 1:2146070/1‑150 (MQ=255) ttACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCt > 1:1609779/1‑150 (MQ=255) tACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCtt > 2:795209/1‑150 (MQ=255) tACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCtt > 1:302472/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGCGC‑‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTc > 2:330099/1‑150 (MQ=255) cAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTc < 1:692050/150‑1 (MQ=255) cAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTc < 1:796563/150‑1 (MQ=255) cAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTc < 1:2012330/150‑1 (MQ=255) aGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCg < 1:2518312/150‑1 (MQ=255) tG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGa < 2:1369689/150‑1 (MQ=255) gcg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCttt < 1:3906977/150‑1 (MQ=255) gcg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCttt < 2:1680773/150‑1 (MQ=255) cg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTc < 2:1913189/150‑1 (MQ=255) cg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTc < 1:404418/150‑1 (MQ=255) | GCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTCA > NC_002947/837864‑838159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |