| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,823,903 | 1 | . | T | 11.1% | 809.2 / 106.5 | 216 | coding (1246/1293 nt) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (108/84); new base T (10/14); total (118/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGC > NC_002947/3823754‑3824052 | gtggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCaga < 1:1369671/150‑1 (MQ=255) tggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCaga‑g < 2:1502467/150‑1 (MQ=255) tggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCaga‑g > 1:2617147/1‑150 (MQ=255) 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ggTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGc > 1:1290646/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGccc > 1:2910989/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGccc > 1:4331043/1‑150 (MQ=255) cATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCcca > 2:3520760/1‑150 (MQ=255) cATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCcca > 1:1768084/1‑150 (MQ=255) cATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccac > 2:495194/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca < 2:1541959/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:3422380/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa > 1:2767633/1‑150 (MQ=255) aCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa > 1:3073873/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgc > 2:3981652/1‑150 (MQ=255) gAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccg > 2:4465808/1‑150 (MQ=255) gAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccg > 1:449345/1‑150 (MQ=255) aGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccgc > 2:3573135/1‑150 (MQ=255) tATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa > 1:4136008/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCTTTGCCCGGCCAGATGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaa > 2:4475561/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAGGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaaa < 2:628893/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaaa < 1:3351293/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAAc < 1:320809/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGa > 1:1720966/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGa > 2:3230749/1‑150 (MQ=255) cgcTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAg > 1:2374323/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGccc > 1:3066972/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCa < 1:349960/150‑1 (MQ=255) ccGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAgcgc > 2:4127533/1‑150 (MQ=255) aga‑gGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGACCAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCAt > 1:1976882/1‑150 (MQ=255) a‑gGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGc < 2:2111829/150‑1 (MQ=255) | GTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCAGA‑GGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGCGCCCCCATGC > NC_002947/3823754‑3824052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |