| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1330943 = | NA (NA) | 7 (0.040) | 6/266 | NT | NA | coding (162/1644 nt) | PP_1157 | acetolactate synthase |
| ? | NC_002947 | 1330987 = | NA (NA) | coding (206/1644 nt) | PP_1157 | acetolactate synthase | |||||
GGACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1331096‑1330943‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cagccTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCATG > NC_002947/1330987‑1331135 tGACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCTGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGC < 2:2978200/149‑1GGACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGC > 2:1929284/1‑150 GACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCA < 2:982771/150‑1 GACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCA < 2:982691/150‑1 GACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCA < 2:2909331/150‑1 ACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAG > 1:1646271/1‑150 ACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAG > 1:740853/1‑150 CTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGC < 2:2033008/150‑1 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC > 1:1065228/1‑150 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC > 2:2721376/1‑150 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC > 2:1069214/1‑150 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC < 2:1047296/150‑1 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC < 2:1047116/150‑1 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC > 1:1028927/1‑150 TTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC < 1:107441/150‑1 TTCTTGATCGGCATCTGCCAGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC > 2:2812948/1‑150 ACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAA > 2:3148568/1‑150 CAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAG > 1:4395193/1‑150 CAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAG > 1:4395129/1‑150 AGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGA > 1:619382/1‑150 GCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAG > 1:2914057/1‑150 CGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACC‑‑‑GGCGTCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTCCCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCA > 2:2711664/1‑150 GCGACCGTAGGTGGCAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATC < 2:619382/150‑1 CAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGG < 1:2886495/150‑1 CAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGG < 1:3699873/150‑1 CAGCCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGG < 1:3700299/150‑1 CCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCAT < 1:4522462/150‑1 CCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCAT > 1:200447/1‑150 CCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCAT > 2:3013728/1‑150 CCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCAT > 2:3013731/1‑150 CCTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCAT < 1:790169/150‑1 CTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCTCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATTATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAATAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCATG < 1:2091944/150‑1 CTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTTAAGTGTGCGGCATt > 1:556757/1‑149 CTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCATG < 1:3665308/150‑1 GGACTTCTTGATCGGCTTCTGCCCGGTGATCATCATCATCGGCATGCCGCCCAGGTAGGCGTAGGCGCTGGCGGTCACCAGGTTGGTGGCACCAGGGCCGAGGGTCGACAGGCTGACGCCGGTCTTGCCGGTCAGGCGACCGTAGGTGGCAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1331096‑1330943‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cagccTGTCGACCCTCGGCCCTGGTGCCACCAACCTGGTGACCGCCAGCGCCTACGCCTACCTGGGCGGCATGCCGATGATGATGATCACCGGGCAGAAGCCGATCAAGAAGTCCAAGCAGGGTCGCTTCCAGATCATTGACGTGTGCGGCATG > NC_002947/1330987‑1331135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |