| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2179666 = | 199 (1.010) | 129 (0.660) | 76/274 | NT | 53.1% | intergenic (+102/‑64) | PP_5485/PP_1931 | GNAT family acetyltransferase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4459540 = | 30 (0.150) | coding (212/696 nt) | pcaI | 3‑oxoadipate CoA‑transferase subunit A | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGGTTTTCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2179815‑2179666‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTC > NC_002947/4459540‑4459688 GGGTTTTCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGG > 1:2083145/1‑150 TTTTCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTGTGGTGC > 1:1528798/1‑150 TCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCA > 1:3819006/1‑150 TCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCA > 2:1659760/1‑150 GGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTG < 2:3724766/150‑1 GGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTG < 1:1254587/150‑1 GTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTC < 2:1444514/150‑1 TCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCC > 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CAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCC > 1:2696461/1‑150 CAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCC > 1:562449/1‑150 CAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTGCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCC > 2:2597099/1‑150 AGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCG > 2:4321442/1‑150 GAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGA < 1:1740230/150‑1 AAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAG < 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TTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCG > 1:451462/1‑150 TTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCG < 2:13774/150‑1 TTTCACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCG < 2:3147768/150‑1 TTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGG > 1:2775855/1‑150 TTCACACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGG > 1:2775723/1‑150 CACACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCA > 1:4086729/1‑150 CACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATT < 2:3220836/150‑1 ACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGTACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCTACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG < 1:2198389/150‑1 ACAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG > 2:182737/1‑150 ACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG > 1:4370849/1‑150 ACAGCCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTG < 2:1017066/150‑1 CAGTCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGG > 2:2312402/1‑150 agcCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGT > 1:907052/4‑150 agcCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGT > 2:742872/4‑150 TCTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGC < 1:1438064/150‑1 CTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCG < 2:3956571/150‑1 CTGGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCG < 1:3823088/150‑1 GGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTT > 1:1929976/1‑150 GGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTT < 2:1348349/150‑1 GTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTC > 2:330048/1‑150 GGGTTTTCATCGGTGACGTAGTCGTCCAGGCACTCCGGCAGCAATGTAACCTGCGTTCGAGCCTCACCTTCGATGAATCGCTTCATGATTGTCCCCACGGTCACGACGACCAGAAGGTTAGACAACCGCGGGCGTTTTCACACAGTCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2179815‑2179666‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTC > NC_002947/4459540‑4459688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |