| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1025270 = | 79 (0.400) | 10 (0.060) | 6/222 | NT | 12.5% | intergenic (‑121/+108) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1025363 = | 76 (0.480) | intergenic (‑214/+15) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACGG > NC_002947/1025121‑1025419 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTG < 2:208787‑M1/150‑1 (MQ=255)gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTG > 1:4412151‑M1/1‑150 (MQ=255)gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTG < 1:1921218‑M1/150‑1 (MQ=255)agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg > 1:902144‑M1/150‑150 (MQ=255) gctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCct < 1:1132196‑M1/5‑1 (MQ=255) tcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCctct < 2:4095970‑M1/7‑1 (MQ=255) ggTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTC < 2:771708‑M1/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTTATTACTTTCAAGGTTATAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATTGCCGGCGTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTTCCGCGGGATCGCCGGGCATAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGC < 1:2080692‑M1/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGC > 1:144739‑M1/1‑150 (MQ=255) cagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTcgcg > 2:2729‑M1/139‑150 (MQ=255) cAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCG < 2:374931‑M1/150‑1 (MQ=255) cAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCG < 1:1607034‑M1/150‑1 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGG < 2:3851368‑M1/150‑1 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGG < 1:505071‑M1/150‑1 (MQ=255) gcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCggg > 2:822632‑M1/137‑150 (MQ=255) gcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTAGCggg < 1:195509‑M1/14‑1 (MQ=255) tGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAA < 1:2386260‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCaa > 2:665545‑M1/134‑150 (MQ=255) 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cccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCgg > 2:1156534‑M1/59‑132 (MQ=255) ttGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCCCGCCCGCACGTAGGGCGCAGTGTCCGCACCGGTCGAGAGCCAGTgggagcgggcttgcccgccaagcggcc < 1:2869856‑M2/150‑28 (MQ=255) aGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCCCGCCCGCAGGGCGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGCGATCCGGGGGGGGCGGGCGTGCCCGCGCAGCGGCCgggcc > 1:2567677/1‑147 (MQ=255) ggTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCGCCGGGAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGGTCCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCCGAGGCCGGGACTgg > 2:50939/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCGCAGGGAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGATCCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGc > 1:4095970/1‑150 (MQ=255) 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ccGGGCAGAATGGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGGGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCaa < 2:1822848/150‑1 (MQ=255) aTCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCAGTCGGGATCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATAAACACTCacac > 2:758866/1‑150 (MQ=38) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACAcc > 2:3209920/1‑150 (MQ=255) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAAAAAACACTCACAcc > 2:2331852/1‑150 (MQ=255) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTTGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGACATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACAcc < 2:2801285/150‑1 (MQ=255) 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GGCCTCTTCGCGGCCAAGCCCGCTCCCTCAGTTAGGGCGCAGTTTCCCAACCTGACCACAACCTGTGGCAGCGGCATTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACgg > 2:1189287‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACGG > NC_002947/1025121‑1025419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |