| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1970763 = | 107 (0.540) | 16 (0.100) | 8/236 | NT | 13.5% | intergenic (+14/‑252) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region |
| ? | NC_002947 | 1970865 = | 114 (0.680) | intergenic (+116/‑150) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region | |||||
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
TGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970614‑1970912 | gAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCG > 1:274619‑M1/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCG > 2:3082528‑M1/1‑150 (MQ=255) atgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCAcc > 2:657882‑M1/147‑150 (MQ=255) tgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCg > 1:3370585‑M1/146‑150 (MQ=255) aGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGG > 2:1325847‑M1/1‑150 (MQ=255) agttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGc > 1:1204052‑M1/144‑150 (MQ=255) cAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTC > 1:2348933‑M1/1‑150 (MQ=255) gccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTc > 2:2553901‑M1/138‑150 (MQ=255) aaCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCG > 1:1617003‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCG < 2:2939094‑M1/150‑1 (MQ=255) catggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgc < 1:296699‑M1/15‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTGCACCGGCCTCTTCGCG > 1:631662‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGG > 1:1278153‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTGCGATGTACCGCCGGCCGCCCAGATCGATGGGATCGGGCCCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCGGCCACGCTGGCGCCGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGAGTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCGCTTCGCgg < 2:2725360/150‑1 (MQ=255) atggatctgcgcgatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgactgCACCGGCCTCTTcgcg < 2:3177128‑M1/16‑1 (MQ=255) atggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgcg > 1:4473233‑M1/135‑150 (MQ=255) tggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCgg > 1:2695656‑M1/134‑150 (MQ=255) ggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTCGCggg > 1:3408482‑M1/133‑150 (MQ=255) 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cggccgACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCGTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAgg > 1:2024475/1‑150 (MQ=255) gccgACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CTCCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACTGGGa > 2:628718/1‑150 (MQ=255) aTCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCGCCCACAGGGATATCGCATg > 1:4366517/1‑150 (MQ=255) aTCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATg < 1:2676676/150‑1 (MQ=255) tCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATgg > 2:2157679/1‑150 (MQ=255) 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ccAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCCCTCCCACAGGGATATAGCAAGGCCATAGGGCCGTGGTGAAACTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagagg < 1:1378834‑M2/150‑15 (MQ=255) aaGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggcc < 2:2404639‑M2/150‑17 (MQ=255) ggtggctgttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgttttgcctgCACGGGCCTGTTCGGGGGCTGGCCCGCTCCCAGTGGGATATCGCAGGGCCTTTGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGGGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCgg > 2:805680‑M1/51‑150 (MQ=255) tGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCGTCGCCGGCTTGCCCGCGCCCCCCGGGCGAACGCATGGCCGTAGGGCCCGGGGGTACCAGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCGCCCAGGCCgggg > 1:169085/1‑148 (MQ=255) gggCTCTGCTGGTTGGCCGCACGCGCCGGCAGTGATTTGGTAGCGCCC‑CACGGGCCTCGTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACGGGGATCGCGCTGGGCCTTTGGGCCGTGGTGAACGTGTGGGGGCGGGGGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTg < 2:3909788/149‑1 (MQ=25) cTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCCCAGGGGTATCGCCAGGCCGTAGGGGCGGGGTGAACCAGTGGGGGCGGGGGCGCCCGCCCAGAGGCCCGTGCAg > 1:3823695/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGc > 2:1295839/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTAGCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatccccgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtgaggcga < 2:2527882‑M1/150‑89 (MQ=255) gTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTTATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACTGGTTTATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCGGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACa < 1:4065403/150‑1 (MQ=38) tGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaaaa > 1:4128489/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACTGGGCTATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAAc > 2:3434537/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCa > 2:4396754/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCCTGCACTTATTTTGTATCGCCC‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGTTCTCGCATGGCCTTTGGGCGGTGGTGAACGTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg < 1:2545794/150‑1 (MQ=38) cAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg > 2:2223959/1‑150 (MQ=255) cgcCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGttt < 2:2228297/150‑1 (MQ=255) gcCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACAGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTc > 2:1582235/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTTGGTACCGCCC‑CACCGCCCTCTTCGGGGGCTGGCCCGCTCCCAGTGGGATATCGCAGGGCCTACGGGCCGTGGTGACCCTGGGGGGGCGGCCGAGCCCGCGACGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc < 2:1496471/149‑1 (MQ=255) ttttGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGACGCGGCCGGTGCAGGCAATACAATAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTg > 2:2967929/1‑150 (MQ=255) tttGTAGCGCCT‑CACCGGCCTCTCCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga < 2:1946064/150‑1 (MQ=255) tGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggccggtgcaggcaatacaaaataattgcaggcgcttgcggcaaac < 1:1481534‑M2/150‑59 (MQ=255) tGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACTGGGATAAAGCATGGCCTTAGGGCCGTGGGGCACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGCACAGGCCGGTGACGGCAATACAAAAACCACGTTTCAAACGCGGCAgaga > 2:417032/1‑150 (MQ=255) gTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCAAGGCCTTAGGGCCGTGGGGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgcagaggccggtgcggcgatacacaatcagtgcaggcgcttgcggcaaacca < 2:3727172‑M2/150‑60 (MQ=255) tCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACGGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGTACCGGTGGGGGCGGGCGcgcccgcgcagaggccggtggggcgatacaaaatcagtgcaggcgcttgcggcaaaccagct < 2:2087252‑M2/150‑63 (MQ=255) cGCCT‑CCCCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAAc < 2:3940966/150‑1 (MQ=255) gCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCTGGGATATCGCATGGCCTTCGGGCCGTGGTGAACCTGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACt < 2:1697380/150‑1 (MQ=255) t‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggccggtgcaggcgatacaaaatcagtgcaggcgcttgcggcaaaccagctgagc < 2:631662‑M2/150‑68 (MQ=255) CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCa > 2:1783137‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970614‑1970912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |