| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2101925 = | 55 (0.280) | 14 (0.090) | 8/230 | NT | 22.3% | intergenic (‑71/‑134) | PP_1875/PP_1876 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator/AAA family ATP/GTP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 2102020 = | 52 (0.320) | intergenic (‑166/‑39) | PP_1875/PP_1876 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator/AAA family ATP/GTP‑binding protein | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GCTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAGTCGTCATGGACGCTCGCTTGA > NC_002947/2101776‑2102074 | gCTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGG < 1:1707493‑M1/150‑1 (MQ=255)gCTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGCCCCCGCTTGG < 2:3473601‑M1/150‑1 (MQ=255) ccagtgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcgc > 1:844556‑M1/149‑150 (MQ=255) cTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGCCCCCGCTTGGC < 1:2746094‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGCCCCCGCTTGGC < 1:2694599‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:1094800‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:3703993‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:3746284‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGCCCCCGCTTGGCGa < 2:1476193‑M1/150‑2 (MQ=255) tGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTCGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGC < 2:3704007‑M1/150‑1 (MQ=255) agtgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcgcgc > 2:808496‑M1/147‑150 (MQ=255) agtgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcgcgc > 1:977796‑M1/147‑150 (MQ=255) agtgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcgcgc > 2:3214714‑M1/147‑150 (MQ=255) agtgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcgcgc < 1:2900680‑M1/4‑1 (MQ=255) tgtggtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGccc > 2:2159744‑M1/145‑150 (MQ=255) aTGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGAGCGCCAAGCGGCCCCCGCTTGTCGatca < 2:4025466‑M1/150‑5 (MQ=255) tGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATGTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGgtcaa < 2:483125‑M1/150‑6 (MQ=255) gACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTC > 1:1541168‑M1/1‑150 (MQ=255) gtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTcc > 2:1530161‑M1/141‑150 (MQ=255) gtgccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccaagacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTcc > 2:4443951‑M1/141‑150 (MQ=255) aCAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCGCC > 1:952639‑M1/1‑150 (MQ=255) gccccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCcgc < 2:3948361‑M1/12‑1 (MQ=255) gCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GG < 2:3652040‑M1/150‑1 (MQ=255) cccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑gg < 1:1179555‑M1/14‑1 (MQ=255) ccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑ggg > 2:3013280‑M1/136‑150 (MQ=255) ccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑ggg < 1:259958‑M1/15‑1 (MQ=255) ccagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgagtcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑ggg > 1:4424042‑M1/136‑150 (MQ=255) cGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGG < 2:4511203‑M1/150‑1 (MQ=255) cagtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGc > 2:608623‑M1/135‑150 (MQ=255) ttGGTTAACTTGATATCCATGTGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTT < 1:2844553‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGAAAGCATAGCCTAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTTTTCATTTCAGTTGATCGCCATGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTT < 1:1375602‑M1/150‑1 (MQ=255) gtcgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGCtt > 2:705547‑M1/133‑150 (MQ=255) cgatgtgcgggcgttgtgccggcaacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑c > 1:2180447‑M1/131‑150 (MQ=255) gTGAACTTGTTATCGTTGAGTCCCGCGCCGGTTTCCGTTTCCTTGGTCTGCGCCAGCATAGCCGAATAGCCCGGGCTGCTGGTGGGTATGTCTGTTCATTTCAGTTTATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑C < 2:2398635‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctc > 2:713863‑M1/1‑147 (MQ=255) cTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTc > 2:522263/1‑150 (MQ=255) cTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTc > 1:3779738/1‑150 (MQ=255) cTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTGG‑C‑CCGgtc > 2:1774608‑M1/1‑147 (MQ=255) cTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCACTGCGCAAGCATAGACGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCACCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGttg > 2:259958/1‑149 (MQ=255) atatCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCcac < 1:2958080/150‑1 (MQ=255) atCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGCTCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctcccacag < 2:349455‑M1/150‑10 (MQ=255) atCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTGCCCCAg > 2:291567/1‑150 (MQ=255) tCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAgg < 2:2906932/150‑1 (MQ=255) tCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCACCGC‑GGGCGTT‑C‑CCGgtaccacaag > 1:706995‑M1/1‑140 (MQ=255) aGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATCGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGc < 1:4468117/150‑1 (MQ=255) caacaggggttcaaggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGCTCCCACAGGTACGGCTTa > 1:1031072‑M1/109‑150 (MQ=255) cGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCACGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑g < 1:1572492/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGttcccacagggcttgcgttcagcctgg < 2:3664770‑M1/150‑28 (MQ=255) ccctgtCCTTGCGCGGCGCACGCATCGCCGATGCGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCTGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGaa < 1:4285948/145‑1 (MQ=38) aggcgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGaa < 2:2624605‑M1/55‑1 (MQ=255) ccGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCGTG‑C‑CCGGTCCCCCAGGGACAGCATAGCCCCC‑CGCTGAAc > 2:2683917/1‑150 (MQ=255) cgcgccagtaccgattcggcgcggtccagaaaagcgatcaagcgagcgtccatgacgactcctaacaatctcagttttttgggggccgctgcGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGCTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGc > 2:2310843‑M1/93‑150 (MQ=255) tCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCaa < 2:1541168/150‑1 (MQ=255) tCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCaa < 2:3229188/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGGGGG‑C‑CCGGTCCCACCGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCGGAACGCAAg > 1:3382816/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCC‑GGCTGAACGCAAGc < 1:3684274/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGGTACCACAAGTACAGCGTAGCCCCA‑GGCGGAACGCCAGcc > 2:2140654/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCGTGGCGCCCCACCGC‑GGGGTTG‑C‑CCCGTACCCCAGGGGCAGCGTATCCCCA‑CGCGGAAACCAAGcc > 1:1476596/1‑150 (MQ=255) 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aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg < 1:2936446‑M1/150‑53 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg < 2:2019971‑M1/150‑53 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgg > 2:1323205‑M2/1‑147 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgg > 1:522263‑M2/1‑147 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgg > 1:4432479‑M2/1‑147 (MQ=255) aGCATAGCCGAATAGCCCCGGCGGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCCGTTGATCGCCACGGGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacgg < 1:4160090‑M1/150‑53 (MQ=255) gCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGctcccacagggcttgcgttcagcctggggctaagctgtacctgtgggaacggg < 2:4272460‑M1/150‑54 (MQ=255) cGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTT‑C‑CCCTTACCACACGGAAACCATAGCCCCA‑GGCTGGAAGCCAGCCCAGTGGGGGcgggccagccc < 2:1544771‑M2/150‑12 (MQ=255) aGCCCCGGCTGCGGGTGGGTCGGTCTGTTCTTTTCAGTTTATCGCCAAGGGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGcgggcaagcccgcgga > 2:1762802‑M2/1‑134 (MQ=255) ccccGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCGTG‑C‑CCGGTACCACACGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCGGGTCCCAAGCCCAGGGGGGGcgggcaaacccgccgcgg < 2:2045982‑M2/150‑19 (MQ=255) cGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCACCGC‑GGGCGTT‑C‑CCCGACACACACGTAGAGCATAGCCCCA‑CGGGGTACGCAAACCCCGAGGGGGCGGGCCAACCCGCGGCggggg > 2:3440157/1‑149 (MQ=255) tgctgGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGGTCCCACACGTAAAGCGTAGCCCCA‑CGCTGAAAGCCACCCCCGTGGGAGCGGGCAACCCCGCGGCGGGgcgcgc > 2:2900680/1‑150 (MQ=255) tctgtTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCGTG‑C‑CCCTTCCCACACGTACAGCATATCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCAGTTGGAGCGGGCCACCCCCCGGAGGGGCGCGCCGC‑GGCCCCCcaaa > 2:1445454/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGTTGACCCCCACGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTGG‑C‑CCGTTCCCCCAGGAACAGCTTCGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTga < 2:3372788/149‑1 (MQ=38) aTTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGGGTGCC‑CCGTACCCACCGG‑ACCGCGTTTGCCCA‑CGCGGCACGCACGCCCCGGGGGTGCGGGGGAGCCCCCCGGGGGGGGGGCCCC‑CGCCCCCcaaaaaaagag > 2:173744/1‑145 (MQ=255) tttCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGCGGGGGTGG‑C‑CCGTGCCC‑CACGTTAAGGGTATCCCCACGGGGGAACCCAA‑CCCGGGGGGTGCGGGCCAGCCCCCGGGCGGGGGCGCCCCGGGCCCCCaaaaaaagagg > 2:65152/1‑145 (MQ=255) tggATCGCCACGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCGGC‑GGGCTTG‑C‑CGGTTCCCACCGGTACTGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTa < 2:3360933/148‑1 (MQ=39) cgggggggCGGGTTGGGGCCCGGCCGG‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCCCAGTTACAGCTTAGCCCCC‑GGCTGAACGCACGCCGGGTGGTTGGGGGAAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAGTCGTCa < 2:1827687/147‑1 (MQ=255) ggCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCCTTCCCACACGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAATCCCTGTGGGAGCCGGCCAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACAGTGATTGTTAGGAGTCGGCATGGAcg > 2:1864633/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGc > 1:1000872/1‑51 (MQ=255) gggCGCCCCCCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACCGGTACAGCTTAGCCCCT‑GGCTCAACGCACGCCCTGTGGGAGCGGGAAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAGTCGTCATGGACGCTCGCtt < 2:1748647/149‑1 (MQ=255) GCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCTTTCCAACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAGTCGTCATGGACGCTCGCTTGa > 2:4096270‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCTTGTATGACAGGCGATTGGTGAACTTGATATCCATGAGTCCCGAGCCGGTTTCCCGTTCCTTGCGCTGCGCAAGCATAGCCGAATAGCCCCGGCTGCTGGTGGGTCTGTCTGTTCATTTCAGTTGATCGCCAAGCGGGGGCCGCTTGGCGCCCCTCCGC‑GGGCTTG‑C‑CCGTTCCCACAGGTACAGCTTAGCCCCA‑GGCTGAACGCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGGAGGGGCGCGCAGC‑GGCCCCCAAAAAACTGAGATTGTTAGGAGTCGTCATGGACGCTCGCTTGA > NC_002947/2101776‑2102074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |