| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2992849 = | 172 (0.870) | 9 (0.050) | 5/262 | NT | 5.3% | coding (596/2169 nt) | vgrG‑I | type VI secretion system protein |
| ? | NC_002947 | = 4613642 | 160 (0.860) | intergenic (+636/‑1471) | hcpC‑II/PP_4084 | hemolysin‑coregulated protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
GCTGCACCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGTCTCACCG > NC_002947/2992700‑2992998 | ggaccatcaggtgcgcgaattctgcgttcaggccggtgagacggacttggcgttcatcgcccgcctggccgctgaagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtccct < 2:3284169‑M1/1‑1 (MQ=255)gcTGCACCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGt > 2:2920387/1‑150 (MQ=255) gCACCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCTAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTGGATCGCCCCCGCGGGTCGCGTGGTACAGGCCGCTGTCGGGGCCTACTGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCGCGTCTGCATGGTCgg > 2:1430722/1‑150 (MQ=17) catcaggtgcgcgaattctgcgttcaggccggtgagacggacttggcgttcatcgcccgcctggccgctgaagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGc < 1:1657479‑M1/5‑1 (MQ=255) cACCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCTGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGc < 1:3186220/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGcc > 2:3124043/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCt < 1:4287546/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTg > 2:2200561/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTg > 1:1983347/1‑150 (MQ=255) gCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGAt > 1:4146761/1‑150 (MQ=255) gCGAGCGGTGCGCACCGGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGAt < 2:1058585/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGgcgc < 1:1791348/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCAt > 2:2520745/1‑150 (MQ=255) cgcACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATgg < 1:2494923/150‑1 (MQ=255) cgcACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATgg < 2:3809948/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTg > 1:2364265/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGAt > 1:793183/1‑150 (MQ=255) tGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGCATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATc < 1:3871552/150‑1 (MQ=255) gCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCa < 2:2482813/150‑1 (MQ=255) cTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCGGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCGTGATGGCGCCATGGCTGATCAg > 2:4123112/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAgg > 2:3171537/1‑150 (MQ=255) aggccggtgagacggacttggcgttcatcgcccgcctggccgctgaagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAgg > 2:376918‑M1/121‑150 (MQ=255) gCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGcc > 1:3199772/1‑150 (MQ=255) tGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGa > 2:1738975/1‑150 (MQ=255) cggtgagacggacttggcgttcatcgcccgccttgccgctgaagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGa > 2:870811‑M1/117‑150 (MQ=255) cggtgagacggacttggcgttcatcgcccgcctggccgctgaagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGa > 1:1435573‑M1/117‑150 (MQ=255) gTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAg < 1:1330375/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGa < 2:4213112/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGa > 2:737910/1‑150 (MQ=255) gcAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGTCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACt > 1:692541/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGc > 1:3497036/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGc > 1:4071449/1‑150 (MQ=255) cggcgAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGc < 2:1606967/150‑1 (MQ=255) ggcgAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGcc < 1:4172693/150‑1 (MQ=255) aaGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATc < 2:1447123/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGt < 1:3648628/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGt > 1:1970226/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGt < 2:790157/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGt < 1:4493677/150‑1 (MQ=255) cAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGtg > 2:3655207/1‑150 (MQ=255) aGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGtga < 1:184452/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATc > 1:1048844/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATc < 2:4512212/150‑1 (MQ=255) gCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGc > 1:4373893/1‑150 (MQ=255) gCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGc < 1:1499680/150‑1 (MQ=255) gCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGc > 1:1294206/1‑150 (MQ=255) gCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGc > 1:2145402/1‑150 (MQ=255) cTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCt < 1:80158/150‑1 (MQ=255) ttGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCtt > 2:3636240/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTtg > 2:2687806/1‑150 (MQ=255) gATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTtgt < 1:3775437/150‑1 (MQ=255) gATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTtgt < 2:300932/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGc > 2:4280799/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGc > 1:3607202/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAg > 2:534771/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAg > 1:3814277/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAg > 1:914470/1‑150 (MQ=255) cACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCt > 2:3557547/1‑150 (MQ=255) aCCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCtt > 2:3612169/1‑150 (MQ=255) aagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGc < 1:2960691‑M1/31‑1 (MQ=255) aagaaggcttcgtctaccgctttgcgcacagtgaaaagctgcacaagctgatcatcaccgatcggctgcagtcccTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGc > 2:2958576‑M1/76‑106 (MQ=255) cGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCtttt < 2:2246777/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCttta > 1:2275345/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCa < 2:1937643/150‑1 (MQ=255) ttCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACtg > 1:10535/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACtgtg < 1:2634799/150‑1 (MQ=255) gCTTGGTACGGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTgc > 2:3487969/1‑150 (MQ=255) cTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTgcg > 2:1880821/1‑150 (MQ=255) cTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTgcg > 2:3462420/1‑150 (MQ=255) tGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCa < 1:4467173/150‑1 (MQ=255) ggTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCaa > 2:4017735/1‑150 (MQ=255) tACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAg > 1:3913493/1‑150 (MQ=255) gACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTa > 2:2828293/1‑150 (MQ=255) gCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGAc < 2:1810944/150‑1 (MQ=255) gCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGAc > 2:1496370/1‑150 (MQ=255) gCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGAc > 2:3057427/1‑150 (MQ=255) aGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGcc > 1:978461/1‑150 (MQ=39) gggCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCct > 2:368249/1‑150 (MQ=39) cAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAg > 1:3053105/1‑150 (MQ=38) gtcgtcATCGCCGAAACCCTCGTCTTCCTGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTGTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAg > 2:2782274/1‑150 (MQ=255) gtcgtcATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAg > 2:2782316/1‑150 (MQ=39) tcgtcATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAgg > 2:1159018/1‑150 (MQ=39) cgtcATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAggc > 2:3334860/1‑150 (MQ=39) gCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGAt < 1:3413008/150‑1 (MQ=39) ccGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATg > 2:4191164/1‑150 (MQ=38) cGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGAttt < 1:200136/150‑3 (MQ=38) cGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGa > 1:1255147/1‑150 (MQ=38) aaaCCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAAc > 1:276964/1‑150 (MQ=37) aaaCCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAAc < 2:843676/150‑1 (MQ=37) cccTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGcc < 2:3199772/150‑1 (MQ=34) cTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCaa > 2:341877/1‑150 (MQ=34) cTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCaa < 2:600984/150‑1 (MQ=34) tCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAg > 2:1660979/1‑150 (MQ=34) cTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCg < 1:2931148/150‑1 (MQ=34) ttCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGt < 1:4019066/150‑1 (MQ=34) ttCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGt < 1:2897106/150‑1 (MQ=34) cATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGtct < 1:1476601/150‑1 (MQ=34) TCGTCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTtgtg > 1:1272342‑M1/1‑68 (MQ=255) TCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTtgtg < 2:1272342‑M1/68‑1 (MQ=255) TCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGTCTCACCg > 1:2116887‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCTGCACCTGGCGAGCGGTGCGCACCTGCTCGCTGTAGCGCAAGCGGCGAAGGCAGGGTATGGCTTGATCGCCACCGCTGTTCGCTTGGTACAGGACGCTGTCAGGGCCTACAGGCTCGTCGTCATCGCCGAAACCCTCGTCTTCATGGTCGGCCTTGATGGCGCCATGGCTGATCAGGCCGAGGGACTGCAGCCGATCGGTGATGATCAGCTTGTGCAGCTTTTCACTGTGCGCAAAGCGGTAGACGAAGCCTTCTTCAGCGGCAAGGCGGGCGATGAACGCCAAGTCCGTCTCACCG > NC_002947/2992700‑2992998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |