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Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
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cccGCG‑AAgaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggt < 2:262840‑M1/150‑143 (MQ=255) cccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAACCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTc > 1:263456/1‑150 (MQ=255) cccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCCGGCCTCttcgcgggtaaacccgctcccacaggtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggt < 2:184635‑M2/150‑104 (MQ=255) cccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCCGGCCTCttcgcgggtaaacccgctcccacaggtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggt < 2:2087725‑M2/150‑104 (MQ=255) cccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCCGGCCTCttcgcgggtaaacccgctcccacaggtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggg < 2:184671‑M2/150‑104 (MQ=255) ccGCG‑AAgaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggtg > 1:1287964‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCG‑AAgaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggtg > 2:2794353‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCttcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggtg < 2:3698623‑M2/150‑105 (MQ=255) ccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTc > 1:4111712/1‑103 (MQ=255) ccGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCa > 2:1655852/1‑150 (MQ=255) cgcg‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCAc > 2:335652/1‑150 (MQ=255) gcg‑AAgaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggtgaa > 2:3791356‑M1/1‑5 (MQ=255) gcg‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCAcc > 1:266222/1‑150 (MQ=255) cg‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCg > 2:377251/1‑150 (MQ=255) g‑AAgaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaagtattgtgggggcttgtattttcgtgcataggctttacggtccaggccgctcccacccacgcccttacggtctacggtgaagc < 1:79096‑M1/150‑148 (MQ=255) aaTGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCggg > 1:90793/1‑150 (MQ=255) aTGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGc > 1:3569514/1‑150 (MQ=255) | TTTACATAGTCGAAATGCCGGAAGCTGGCGGCGTAGCGGGGGGCTTCACCGTAGACCGTAAGGGCGTGGGTGGGAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AATGCGTCGGAGCAGGCAACG‑AGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGC > NC_002947/3466096‑3466394 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |