| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4151990 = | 70 (0.360) | 18 (0.110) | 9/240 | NT | 22.2% | intergenic (+23/‑374) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| ? | NC_002947 | 4152057 = | 65 (0.380) | intergenic (+90/‑307) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
AGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTT > NC_002947/4151841‑4152131 | aGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCC < 1:1004101‑M1/150‑1 (MQ=255) tacgcgggtgacggtagcacggtgtgtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCtt > 2:2224283‑M1/148‑150 (MQ=255) cAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTC > 2:4105455‑M1/1‑150 (MQ=255) cAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTC > 2:4148933‑M1/1‑150 (MQ=255) aagcgggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTc < 2:3689101‑M1/4‑1 (MQ=255) aaGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCG > 1:2174122‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC < 2:2129803‑M1/150‑1 (MQ=255) gggtgacggtagcacgcagcgtgccagctggctgaaggccttggggtataggggcggcgggggtggcaacctgatcacggtgggcttggttggtgcgatgtgcgcgttttcaggtcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCgg > 1:507719‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCgg > 2:2762825‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCgg > 2:4223141‑M1/143‑150 (MQ=255) gACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 2:125097‑M1/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 2:124989‑M1/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGG < 1:1177676‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGT < 1:4351321‑M1/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACC < 2:3341078‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCC > 1:3689101‑M1/1‑150 (MQ=255) tagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcg < 2:2273525‑M1/17‑1 (MQ=255) cGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:4402988‑M1/150‑1 (MQ=255) agcacggagagtgccagctggctgaaggccttggggtcgaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:746990‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 1:1351654‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 1:1308621‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:584093‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagggccagctggctgacggccttggggtagcggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:747165‑M1/133‑150 (MQ=255) gTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCcgcg < 2:3093724/150‑1 (MQ=255) tttCTGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCgcgc < 1:2893997/150‑1 (MQ=255) tttCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAACCCcccc > 1:2451335‑M1/1‑146 (MQ=255) tttCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCgcgc < 2:337979/150‑1 (MQ=255) aaggagagtgccagcgggctgacggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggctggcctCTTCGCGGGTTTAcccgcgaa > 1:4453217‑M1/130‑148 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCt < 2:4236199/150‑1 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCt < 2:4394501/150‑1 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCt < 1:4511769/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCcgcgaagg < 1:4082548/150‑5 (MQ=255) gagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGc < 2:562416‑M1/24‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCcgcgaaggg < 2:1532305/150‑6 (MQ=255) gAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAACCCGCGCCTGCa > 2:146134/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCaa < 1:2575831/150‑1 (MQ=255) gCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAg < 2:4490179/150‑1 (MQ=255) tGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCTGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGt < 2:3811535/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGa < 2:662065/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGa < 2:2401661/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGa < 1:756651/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACACGCGCCTGGAAATGTGa > 1:729279/1‑150 (MQ=255) aTGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGAc < 1:229467/150‑1 (MQ=255) 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aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:754363‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2502708‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2365346‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg > 2:1164596‑M2/1‑146 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg > 1:2796354‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcggg > 1:1571007‑M2/1‑145 (MQ=255) ttCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCGTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcggg > 2:2460246‑M2/1‑145 (MQ=255) tcgaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑ggg > 1:3951343‑M1/97‑150 (MQ=255) tagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑ggg > 2:1958600‑M1/97‑150 (MQ=255) tCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGGTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggt > 1:951471‑M2/1‑144 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgtgccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:509911‑M1/96‑150 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:1611497‑M1/96‑150 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:494000‑M1/96‑150 (MQ=255) gaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGtt > 2:2824211‑M1/95‑150 (MQ=255) ccAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggttt > 1:1600493‑M2/1‑142 (MQ=255) ccAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggttt > 1:1600479‑M2/1‑142 (MQ=255) catGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTGTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttac < 2:3721181‑M1/149‑42 (MQ=255) aaTGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttac < 2:2155313‑M1/150‑42 (MQ=255) ggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgtgccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTAcc > 2:923031‑M1/91‑150 (MQ=255) gAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAAGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcg < 2:3479090‑M2/150‑16 (MQ=255) gggtggcaaccgtatcagggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttctgggcagatgaaaggttgccggggcgggcctCTTGGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAATGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAaga > 2:2723833‑M1/83‑150 (MQ=255) cTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAAGGTGCCGTGGCCCGGCGCCGGCgcggggtgacccgcgccggggccggcc < 1:3677393‑M2/150‑28 (MQ=255) aCCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg < 2:2959841/150‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg < 2:2959035/150‑1 (MQ=255) tcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCgg > 1:4199821‑M1/69‑76 (MQ=255) cTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCCCCAGCAAAGGTGACGTATCCCCTCGCAGGAGC‑GGGGTTAACCCCGAAGAGGCCCGCCCACGCa > 1:651943/1‑150 (MQ=255) tGGTGATGACGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCACCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTCCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAAc < 2:2415119/150‑1 (MQ=255) gatgaAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCttt < 2:1095147/150‑1 (MQ=255) tgaAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCa < 2:4421372/150‑1 (MQ=255) gaaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:3573279‑M1/112‑36 (MQ=255) gaaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg > 2:3573279‑M1/1‑77 (MQ=255) gaaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGGAGCCCCGCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAACAGGCCGGCCCAGGCAACCATTCaa > 2:3172885/1‑149 (MQ=38) aaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCGCCGGCAAAGGTGGCGGAGGCCGGCGCCGGCGCGGGGTTTACCC‑CGCAGAGGGCGGCCCAGGCACCCAGTCATc > 1:3180157/1‑150 (MQ=255) tGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAACGGGACGGAGCCCGGCGCCCGAGC‑GGGTGTAACCGCGCAGAGGCCGGCCCCCGCCACCGTTCAACTGcccgg > 2:2452644/1‑148 (MQ=255) aTCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCCCCGGCAAACGGGGCGTGGCCCGTCGCAGGGGC‑GGGTTTACCCCCGCAGAGGCCGGCCCCGGCCACCAGTCAGCTGACCGGaa > 1:3649749/1‑150 (MQ=255) cctggATGGGTTGCTCCCCTTGTCGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTGCGGGGGAAAACCCGCGCCTGCAATGGTGAGGTAGCCGGTCGCTGGTGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGaaaa < 1:1004708/147‑1 (MQ=255) ccgggATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGGCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTAATCAGCCCAGaaaa > 2:1725119/4‑150 (MQ=255) ggATCGGTTGCTCCCCTTTTTGGTTTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGGGGGAAAACCCGCGCCTCAAATGGTGACGACGCCCGTCGCTGTTGG‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAAcgc < 1:2155952/150‑1 (MQ=255) gATCGGTGGCTCCCCATGTAGCTGTTACCTCTTGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAACCCCGCGCCTCCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGTAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAAcgcg < 1:1810631/150‑1 (MQ=39) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg > 2:2259373‑M1/1‑51 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2259373‑M1/86‑36 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCAc > 2:2561420/1‑150 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCGGAAAACGCGCACATCGCAc > 2:303606/1‑150 (MQ=255) ccccATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCCCCAGCACAGGGGCCCGAGCCCCTCCCAGGAGC‑CGGGTGACCCCCGAAGAGGCCCGCCCCCGCCACCAGTCATCAGCCCAGAAAACGCCCACAACGCAcc > 2:3841819/1‑150 (MQ=255) cATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCGCCCGCCAAGGGGAAGTAGCCCGGCGCAGGAGC‑GGGGGTAACCCCGAACAGGCCGGCCCAGGCCCCCGTTAATCAGCCCGGCAAACGCGCACAACGCCCCAAc > 2:2636383/1‑150 (MQ=255) tttgCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGGGGTTAAACCCGCGCCTGCAATGGTGAGGTAGCCGGTCGCAGTTGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCa < 1:3671433/147‑1 (MQ=255) gCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAAGGTGACGTAGCCCGGCGCCGGGGC‑GGGGTTACCCGCGCAGAGGCCGGCCCAGGCCACCATTCATCTGCCCTGAAAAAGCGCCCCTAGCACCAACCCCGcc > 2:1940659/1‑150 (MQ=255) tCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAATGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTCATCTGCCCAGAAAACGCGCACATCGCACCCACccaccccacccg > 2:1816005/1‑148 (MQ=38) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCAGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcggggttacccgcgcagaggcccgcccaagaggaaacagctacatggggagcaacccctccagggtcacgtacgtcaacaccaagg < 2:629522‑M2/150‑88 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTGCAAAGGTGTCGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCGTTAAACTGCCCTGAAAAAGCGCACAAAGCACCAAACCAGCCCCCCCTGAt > 1:3006182/1‑150 (MQ=255) ctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCAGCAAAGGTGGCGTAGCCCGTCGCCGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCACGCCACCTTTCATATGCCCAGAAAAAGCGCACAACGCACCAACCCACcccccccggata > 2:2666412/1‑144 (MQ=25) gCCGGCCCCTTCGCGGTTAAACCCGCGCCTGCAATGTTTACTTCCCCCGGCGCTGGAGG‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGtt < 1:1968866/150‑1 (MQ=255) | AGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTT > NC_002947/4151841‑4152131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |