New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4152007 | 58 (0.290) | 15 (0.090) | 6/240 | NT | 20.6% | intergenic (+40/‑357) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
? | NC_002947 | = 4152038 | 65 (0.380) | intergenic (+71/‑326) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
CGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTACCCC > NC_002947/4151858‑4152156 | cGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:3323776‑M1/150‑1 (MQ=255) cGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:4402988‑M1/150‑1 (MQ=255) agcacggagagtgccagctggctgaaggccttggggtcgaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:746990‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 1:1351654‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:584093‑M1/133‑150 (MQ=255) agcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgggcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCcgc > 2:747172‑M1/133‑150 (MQ=255) tttCTGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCgcgc < 1:2893997/150‑1 (MQ=255) tttCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCgcgc < 2:337979/150‑1 (MQ=255) tttCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCgcgc > 2:2885374/1‑150 (MQ=255) ttCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCcgcgaa < 1:2392967/150‑3 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCt < 1:4511769/150‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTTACCcgcgaaggg < 2:1532305/150‑6 (MQ=255) aaGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCaa < 1:2575831/150‑1 (MQ=255) tGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCTGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGt < 2:3811535/150‑1 (MQ=255) tGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGt < 1:2017567/150‑1 (MQ=255) gTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTg < 2:3172261/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGa < 1:756651/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGa < 2:662065/150‑1 (MQ=255) tATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACACGCGCCTGGAAATGTGa > 1:729279/1‑150 (MQ=255) aTGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGAc < 1:229467/150‑1 (MQ=255) gAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGc < 2:71195/150‑1 (MQ=255) gCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGccc < 1:453076/150‑1 (MQ=255) ccTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTc < 2:111387/150‑1 (MQ=255) aGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAg > 2:3952723‑M2/1‑149 (MQ=255) tATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCCCCAGCAAATGTTAAGTAGCCCGGCGCCGGAgcg < 1:646233‑M2/150‑4 (MQ=255) aTTCCCAATGTGCAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCgcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:1297490‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:754363‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2365346‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2259680‑M1/150‑36 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg > 1:2796354‑M2/1‑146 (MQ=255) aTTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg > 2:1164596‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcggg > 2:2706628‑M2/1‑145 (MQ=255) tcgaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑ggg > 1:3951343‑M1/97‑150 (MQ=255) tagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑ggg > 2:1958600‑M1/97‑150 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgtgccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:509942‑M1/96‑150 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:1611497‑M1/96‑150 (MQ=255) agaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGt > 2:494000‑M1/96‑150 (MQ=255) aggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcttgtgccggcccCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGttt > 2:3631863‑M1/94‑150 (MQ=255) gggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTAc > 1:1302076‑M1/92‑150 (MQ=255) catGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTGTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttac < 2:3721181‑M1/149‑42 (MQ=255) gggtggcaacgggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaatggttgcctgggccggcctCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAaga > 2:468498‑M1/83‑150 (MQ=255) gCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATGGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAagag < 2:4275831/150‑1 (MQ=255) gAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTGCAAAGGTGACGTTTCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTTACCCCGAAGAggccg > 2:2786286/1‑150 (MQ=255) cTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAAGGTGCCGTGGCCCGGCGCCGGCgcggggtgacccgcgccggggccggcc < 1:3677393‑M2/150‑28 (MQ=255) aCCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg < 2:2959841/150‑1 (MQ=255) tGGTGATGACGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCACCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTCCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAAc < 2:2415119/150‑1 (MQ=255) tgatgaAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAAGGTGGCGTAGCCCCGCGCCGGAGC‑GGGGTTAACCCCCAAGAGGCCGGCCCACGCAAccat > 1:2226331/1‑148 (MQ=255) gatgaAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCttt < 2:1095147/150‑1 (MQ=255) tgaAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCa < 2:4421372/150‑1 (MQ=255) gaaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg > 2:3573279‑M1/1‑77 (MQ=255) aaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCGCCGGCAAAGGTGGCGGAGGCCGGCGCCGGCGCGGGGTTTACCC‑CGCAGAGGGCGGCCCAGGCACCCAGTCATc > 1:3180157/1‑150 (MQ=255) tGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAACGGGACGGAGCCCGGCGCCCGAGC‑GGGTGTAACCGCGCAGAGGCCGGCCCCCGCCACCGTTCAACTGcccgg > 2:2452644/1‑148 (MQ=255) aTCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCCCCGGCAAACGGGGCGTGGCCCGTCGCAGGGGC‑GGGTTTACCCCCGCAGAGGCCGGCCCCGGCCACCAGTCAGCTGACCGGaa > 1:3649749/1‑150 (MQ=255) cctggATGGGTTGCTCCCCTTGTCGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTGCGGGGGAAAACCCGCGCCTGCAATGGTGAGGTAGCCGGTCGCTGGTGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGaaaa < 1:1004708/147‑1 (MQ=255) ccgggATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGGCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTAATCAGCCCAGaaaa > 2:1725119/4‑150 (MQ=255) gATCGGTTGCTCCCCATGTTGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGGGGGTAAACCCGCGCCTGCAATGGTGACGTCGCCCGTCGCTGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAAcgcg < 1:1802419/150‑1 (MQ=39) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg < 1:2259373‑M1/86‑36 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgg > 2:2259373‑M1/1‑51 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCAc > 2:2561420/1‑150 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCGGAAAACGCGCACATCGCAc > 2:303606/1‑150 (MQ=255) tCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTGCAAAGGTGGCGTAGCCCGTAGCAGGAGC‑GGGTTTTGCCGCGAAGGGGCCGGGCCAGGCAACCTTTCAACTGGCCAGAAAAAGCGCACAAAGCAc > 2:3425681/1‑150 (MQ=255) cATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCGCCCGCCAAGGGGAAGTAGCCCGGCGCAGGAGC‑GGGGGTAACCCCGAACAGGCCGGCCCAGGCCCCCGTTAATCAGCCCGGCAAACGCGCACAACGCCCCAAc > 2:2636383/1‑150 (MQ=255) tttgCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGGGGTTAAACCCGCGCCTGCAATGGTGAGGTAGCCGGTCGCAGTTGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCa < 1:3671433/147‑1 (MQ=255) gttggtttttCCTGTTGGGCCGGCCCCGGGGGGGGAAACCCCGCGCCTGAACTGTTTCGGTCGCCGGTCGCAGGTGG‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCa < 1:2478811/143‑1 (MQ=255) gCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGGCAAAGGTGACGTAGCCCGGCGCCGGGGC‑GGGGTTACCCGCGCAGAGGCCGGCCCAGGCCACCATTCATCTGCCCTGAAAAAGCGCCCCTAGCACCAACCCCGcc > 2:1940659/1‑150 (MQ=255) tttCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAGCCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCAcc < 2:4027960/150‑1 (MQ=255) tCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAATGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTCATCTGCCCAGAAAACGCGCACATCGCACCCACccaccccacccg > 2:1816005/1‑148 (MQ=38) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCAGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcggggttacccgcgcagaggcccgcccaagaggaaacagctacatggggagcaacccctccagggtcacgtacgtcaacaccaagg < 2:629522‑M2/150‑88 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTGCAAAGGTGTCGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCGTTAAACTGCCCTGAAAAAGCGCACAAAGCACCAAACCAGCCCCCCCTGAt > 1:3006182/1‑150 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCCCCGGCCAACGTGGCGGAGCCCCGCGCCGGGGC‑GGGGTTTCCCCCCCAGAGGCCGGCCCCCGCAACCATTAAAATGCCCCGAAAACCCGCCCAGAGCCCCCACCCACcccccccgggt > 2:390602/1‑145 (MQ=255) TTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAccccc < 2:3289917‑M1/150‑1 (MQ=255) cggggttaaccccGCtcctgcgccgggctacgtcacctttgcaggcgggggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttc < 2:3786199‑M1/144‑136 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacttttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttc < 2:3479090‑M1/150‑136 (MQ=255) gTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacatt < 2:2155313‑M2/150‑110 (MQ=255) GTAAACCCGCGCCTGCAACGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGccc > 2:776802‑M1/1‑150 (MQ=255) GTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGccc > 2:2336296‑M1/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgg > 1:1600493‑M1/1‑8 (MQ=255) aaaCCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgg > 1:1600479‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcacccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattggga > 1:951471‑M1/1‑6 (MQ=255) ACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCctct < 2:1312957‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgacggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaa > 2:2460246‑M1/1‑5 (MQ=255) cccGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaa > 2:2706628‑M1/1‑5 (MQ=255) cccGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaa > 1:1571007‑M1/1‑5 (MQ=255) cccGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaa > 1:1511125‑M1/1‑5 (MQ=255) CCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTa < 1:1887219‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGGTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTa < 2:2052058‑M1/150‑1 (MQ=255) ccccgcCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCACCCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc > 1:1690765/4‑150 (MQ=255) ccGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaat > 2:2501423‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgacggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaat < 1:793480‑M2/150‑116 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttc < 1:3573279‑M2/112‑78 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatgggga > 2:2259373‑M2/1‑35 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaat < 1:754359‑M2/150‑116 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaat < 1:2502708‑M2/150‑116 (MQ=255) CCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc < 1:3277534‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc < 2:3016732‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc < 2:224368‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc < 1:1077796‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCGGCACGGGTGCGGCCGCCGGGCGCTGGCGC‑GGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACCTCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAc > 1:2636383‑M1/1‑150 (MQ=255) CGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTAcc > 2:1627051‑M1/1‑150 (MQ=255) gCtccggcgcggggctacggccccttggcggggggggttttccccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacattgggaatac < 1:2446959‑M1/150‑149 (MQ=255) | CGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTACCCC > NC_002947/4151858‑4152156 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |