| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 6057130 | 164 (0.830) | 5 (0.030) | 5/260 | NT | 3.1% | coding (105/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
| ? | NC_002947 | = 6057170 | 163 (0.880) | coding (145/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6056981‑6057279 | cTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA < 1:581172‑M1/150‑1 (MQ=255)cTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA < 1:3133‑M1/150‑1 (MQ=255)cTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCCCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA < 1:3474414‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAg < 2:538529/150‑1 (MQ=255) ccTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAg < 1:2437644/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGc > 1:3844391/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATc < 2:4048118/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATc < 2:2045233/150‑1 (MQ=255) cGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATTATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTTGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAg < 2:769915/150‑1 (MQ=255) cGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAg < 1:3501025/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCt > 1:1029242/1‑150 (MQ=255) gTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCt < 2:3508905/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCt > 1:4248425/1‑150 (MQ=255) 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gaAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGtt > 2:3670248/1‑150 (MQ=255) gaAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGtt > 2:2973824/1‑150 (MQ=255) aaaCGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGc < 1:257686/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGcc < 2:534900/150‑1 (MQ=255) tctAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCt < 1:1226798/150‑1 (MQ=255) 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gTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAgc < 2:4258362/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAgc < 1:4084680/150‑1 (MQ=255) ggTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatc > 2:3771753‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGATGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcc > 2:2588646/1‑150 (MQ=255) gTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatca < 1:202802‑M1/150‑145 (MQ=255) tGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgccca > 2:3719249/1‑150 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 2:10920/150‑1 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 2:728262/150‑1 (MQ=255) ccAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcattt > 1:2204279‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcattt > 1:2204275‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcat > 2:3562155‑M1/1‑3 (MQ=255) ccACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaag > 1:2354665/1‑150 (MQ=255) cacaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagc < 1:3086443/150‑1 (MQ=255) cacaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagc < 2:1162412/150‑1 (MQ=255) agttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttct > 1:1686475‑M1/1‑1 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagcc > 1:742414/1‑150 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagcc > 2:1364778/1‑150 (MQ=255) | CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6056981‑6057279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |