| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 6105810 | 209 (1.060) | 3 (0.020) | 3/264 | NT | 1.4% | coding (665/855 nt) | PP_5353 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 6105836 | 223 (1.180) | coding (691/855 nt) | PP_5353 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GGCAGCCCGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCGAGA > NC_002947/6105661‑6105959 | gcAGCCCGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGAt > 2:1747990/1‑150 (MQ=255) aGCCCGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATaa > 2:4288488/1‑150 (MQ=255) gCCCGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAAc > 1:2859217/1‑150 (MQ=255) ccGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCt > 2:2982154/1‑150 (MQ=255) tAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTGCCTACATCGATAACCTGGa > 1:4322881/1‑150 (MQ=255) tAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCTATAACCTGGa < 2:3411/150‑1 (MQ=255) aaCCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGaa < 2:1145649/150‑1 (MQ=255) aCCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAg > 2:1217310/1‑150 (MQ=255) cACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTg > 2:1465501/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGc > 1:4415299/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAAc < 1:861159/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGa > 2:1490577/1‑150 (MQ=255) cGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACg < 2:2832531/150‑1 (MQ=255) gCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATAAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCTTTAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCATTCTCCCTACATCGATAACCTGGACGTGCAACGGGACgg > 1:2390224/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGgt < 1:1465557/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGATTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGgt > 1:4068483/1‑150 (MQ=255) cagcagcaCTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGtc > 2:1162070‑M2/1‑148 (MQ=255) agcagcaCTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGtcg < 1:3503089‑M2/150‑4 (MQ=255) 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tGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACcgc > 1:49269/1‑150 (MQ=255) ggATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCgcgc > 1:3427846/1‑150 (MQ=255) ggATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCgcgc < 1:1768106/150‑1 (MQ=255) tGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGa < 1:2744423/150‑1 (MQ=255) gCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGAc > 1:1860775/1‑150 (MQ=255) tGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCAc < 1:713865/150‑1 (MQ=255) aCAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTa < 1:1055526/150‑1 (MQ=255) cAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTAc > 1:3833177/1‑150 (MQ=255) cAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTAc > 2:381809/1‑150 (MQ=255) cAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTAc > 1:2826195/1‑150 (MQ=255) 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ttCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATg < 1:1318615/150‑1 (MQ=255) ctacctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTcgcg < 2:188068/150‑1 (MQ=255) ctacctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTcgcg < 2:4308998/150‑1 (MQ=255) cctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGtcgatgtaggtagactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccag < 1:3620460‑M2/150‑115 (MQ=255) cctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGccc < 1:1377351/150‑1 (MQ=255) ctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCa > 2:2269733/1‑150 (MQ=255) ctacATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCa > 2:541066/1‑150 (MQ=255) cATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAgg > 1:3746601/1‑150 (MQ=255) cATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAgg < 1:2982154/150‑1 (MQ=255) cATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAgg < 1:1490577/150‑1 (MQ=255) ctCGATACCCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGGGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGc < 2:3695097/149‑1 (MQ=255) aTCGAcaccgtccagttgcacttccaggttatcgatgtaggtagactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccagtgctg > 2:3094894‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCGAcaccgtccagttgcacttccaggttatcgatgtaggtagactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccagtgctg > 2:4441362‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCGAcaccgtccagttgcacttccaggttatcgatgtaggtagactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccagtgctg > 2:3861462‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGc > 1:780258/1‑150 (MQ=255) tCGAcaccgtccagttgcacttccaggttatcgatgtaggtagactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccagtgctgc < 2:3712832‑M1/150‑147 (MQ=255) tCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCg > 1:1728598/1‑150 (MQ=255) tCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCg < 1:876465/150‑1 (MQ=255) cGAcaccgtccagttgcacttccaggttatcgatgtaggtcgactggaagccatcacccagctcagcacgctcacgcttgaggaactcaagcatttgcggggtaacgaactcgctgatcttgtccatttcattggcatcccagtgctgct < 1:613074‑M1/150‑148 (MQ=255) gATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCgag < 1:4288488/150‑1 (MQ=255) gATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCgag < 1:2275253/150‑1 (MQ=255) aTAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCgaga < 2:2144829/150‑1 (MQ=255) | GGCAGCCCGTAACCACTTCCAGTCGCTGCAGCAGCACTGGGATGCCAATGAAATGGACAAGATCAGCGAGTTCGTTACCCCGCAAATGCTTGAGTTCCTCAAGCGTGAGCGTGCTGAGCTGGGTGATGGCTTCCAGTCTACCTACATCGATAACCTGGAAGTGCAACTGGACGGTGTCGATGACCGCGCCGACCGCACCGACGCTACCCTGACCTTCCGTGGCGTGTCGAAGAATTCGCGCTTCGACCAGGGCGAAGTGTTCAGCGAAAGCTGGCACATGGTTCGCGCCCAAGGCGAGA > NC_002947/6105661‑6105959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |