| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478264 = | 126 (0.640) | 11 (0.070) | 4/216 | NT | 10.9% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478359 = | 81 (0.530) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
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CCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCGGC > NC_002947/478210‑478508 | ccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 2:1869652/1‑150 (MQ=255) cggTGGCCTTTTTGTGGGGGGGGTGGCTGTTCCCGCCGGGTTGCGCCTTTATCGGCCTCTGCGCGGTTAAACCCGCCCCTCCGAGGGGCTGCGCCAAACCGCTGTGGTGTGCCCCCTGTTGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTa < 2:2816329/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGGCTGAGCCCAACCTCTGAGGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTa < 2:1418870/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCTTTGCGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAg < 2:3651083/150‑1 (MQ=255) gggCCTTTGTGGGGCGGGGTTTGCTTTTGACGCCGGGTGGAGCGTTTATCGGCCTCTGCGGGGGTAAACCGGCTCCTAGGACGGGCTGCGCCCAACGTGTGTTGTGGGCCCCGTGTCGGCGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGt < 2:2853401/149‑1 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTaa > 2:3254158/1‑150 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCAAAGACGGGCGGAGCCCAACCACAGATGTGTTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGGAGGGCTaa > 1:2187391/1‑150 (MQ=37) aGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAAcgcg > 2:2773770/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGACGACGGGCTGAGCCCAACCGCTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCgcgcg > 2:1850483/1‑149 (MQ=255) gggCGGGGGTTGCAGTTCCCCCCCGCTTGCCCCTGTCGGGGCCCCTCGGGGGGAACCCCCGCCCCCCCGCCGGGCTGCCCCCACCCCGTTCTGGGGGCCCCCTGTCGGCGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCt < 2:3830339/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTGCCGTTGCCGCCCGGTTGAGCGTGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTgg < 2:2691495/150‑1 (MQ=38) gcgcGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCggg > 1:3352127/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATTTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGCAGAGGCCGGGAGGTCTAACCCCGCTgg > 1:3352054/1‑150 (MQ=38) aGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCGAAGACCGGCTGAGCCCAACCACGGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGGTTAACCCCGAAGAGGCCCGTAGGTCTAACCCCGCGGGTAAGCCACGAg > 1:4430890/1‑150 (MQ=255) ttGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAGACCGGCTGAGCCCAACCGCTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAACGCGCGGGTAAGCCACGAgcg > 2:1165388/1‑150 (MQ=38) cccGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGCAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCa > 2:3518476/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGAGCCTGTAGCGGCCTCTGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGCTGAGCCCAACCTCGGTGGTGGGCCCCCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAg < 2:1055963/150‑1 (MQ=38) cTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCAACGACCGGCTGAGCCCAACCCCTGATGTGTGCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCCCGGGTAAGCCGCGAGCGCATTCAGCCCTTCACCt > 2:1254931/1‑150 (MQ=255) tGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTACTACCACGGGCTGATCCCAAACAATGTTTTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCCGTTGGTCTAAACGCGCGGGTAAGCCGCGAGCGCGTTCAGCCGGTccccct > 2:1322556/1‑148 (MQ=255) atgggCCTCTTGGGGGGTACACCGGCTCCTCCGCGGGGCTGCGCCCAACCTGTGTTGGGGGCCCCCTGTTGGTGGGGTTTTACCGGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa < 2:881520/147‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCTACGAAGGGCTGAGCCCCAACTCGGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAACCCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCGTTCAGCCCTTCACCTTTGAGTGc > 2:3430724/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTc > 2:2967859‑M1/2‑150 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCGGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAAACGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCGTTGAGTGCTTc < 2:3292514‑M1/150‑1 (MQ=255) 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AAACCCGCACCTACGACCGGCTGAGCCCAACCACTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCGCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTgccg < 2:1306760‑M1/150‑2 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAgtgccaga < 1:1328796‑M1/150‑4 (MQ=255) cccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 1:42362‑M2/77‑150 (MQ=255) cccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 2:3386197‑M2/77‑150 (MQ=255) cccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 2:2136845‑M2/77‑150 (MQ=255) 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ccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCt > 2:2042115‑M2/15‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTACACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGcgccgc > 2:3866300‑M2/14‑148 (MQ=255) gcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCg < 1:669052‑M2/138‑1 (MQ=255) aagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAg < 1:1165388‑M2/141‑1 (MQ=255) agaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAgg < 2:3910995‑M2/142‑1 (MQ=255) agaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAgg > 2:2532380‑M2/9‑150 (MQ=255) gccgGTCGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCCTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAAt > 2:2455587‑M2/5‑150 (MQ=255) gccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAAt > 1:1000180‑M2/5‑150 (MQ=255) gccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAAt > 1:1000176‑M2/5‑150 (MQ=255) ccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATc < 1:1254936‑M2/147‑1 (MQ=255) cgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCg < 2:3352127‑M2/148‑1 (MQ=255) gTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCGGc < 2:2761361/150‑1 (MQ=255) | CCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCGGC > NC_002947/478210‑478508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |