New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 917754 = | 183 (1.010) | intergenic (‑185/+14) | PP_0798/opdC | GGDEF domain‑containing protein/histidine‑specific outer membrane porin D |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
CGATATTCTAGGGAAGCGGGCATTGTCGGACAAGATTTGTCCGACGGAAGCACGGTGTACCGTACTTTTCGATTTGCCGTGGACCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCGAAGCCTTCTTCGCGGGTAACCGCTCCTACACTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCTTGAGGTCACCT > NC_002947/917605‑917903 | tatTCTAGGGAAGCGGGCATTGTCGGACAAGATTTGTCCGACGGAAGCACGGTGTACCGTACTTTTCGATTTGCCGTGGACCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCGAAGCCTTCTTCGCGGGTAACCGCTCCTACACTgg < 2:792908/150‑1 (MQ=255) ttCTAGGGAAGCGGGCATTGTCGGACAAGATTTGTCCGACGGAAGCACGGTGTACCGTACTTTTCGATTTGCCGTGGACCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCGAAGCCTTCTTCGCGGGTAACCGCTCCTACACTGgca > 1:1200128/1‑150 (MQ=255) ttCTAGGGAAGCGGGCATTGTCGGACAAGATTTGTCCGACGGAAGCACGGTGTACCGTACTTTTCGATTTGCCGTGGACCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCGAAGCCTTCTTCGCGGGTAACCGCTCCTACACTGgca < 1:3699282/150‑1 (MQ=255) 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cgctcctacaCTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCtt < 2:1916236‑M2/140‑1 (MQ=255) cgctcctacaCTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCtt > 2:1957820‑M2/11‑150 (MQ=255) cgctcctacaCTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCtt < 1:3815141‑M2/140‑1 (MQ=255) gctcctacaCAGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGAGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGAAGCATAAACCTGGCTGACGCGGTGGGTGACATAGAGTACCAGCACCGACAGGTcctag > 2:2345032‑M2/10‑148 (MQ=255) tcctacaCTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCTTGAg > 2:1749442‑M2/8‑150 (MQ=255) 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aCTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCTTGAGGTCAcc > 1:2462634‑M2/2‑150 (MQ=255) | CGATATTCTAGGGAAGCGGGCATTGTCGGACAAGATTTGTCCGACGGAAGCACGGTGTACCGTACTTTTCGATTTGCCGTGGACCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCGAAGCCTTCTTCGCGGGTAACCGCTCCTACACTGGCAGCAAAAGATCAGAACACGTTCAGTGGGTAATCGACGATTACCCGCAGTTCATCGTTGTCGCTGTTGCTGTCGATCGACGCATAACCCTGGCTGCCGCGGTGGGTGGCATAGCGTACCAGCACCGACAGGTCCTTGAGGTCACCT > NC_002947/917605‑917903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |