New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1499465 | 59 (0.300) | 9 (0.050) | 3/230 | NT | 14.0% | intergenic (+35/‑131) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 1499502 | 61 (0.370) | intergenic (+72/‑94) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
CGCAGTTCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATG > NC_002947/1499354‑1499650 | cGCAGTTCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGt > 1:3673257‑M2/1‑149 (MQ=255) cGCAGTTCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGGGCATGGCACC‑CGCGTTGCCGGTGt < 1:723818‑M2/150‑2 (MQ=255) gTTCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgc > 2:1306689‑M2/1‑145 (MQ=255) ttCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcg > 1:261301‑M2/1‑144 (MQ=255) ttCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑CGCTTTGCCGGTGttcgcg < 2:2433534‑M2/150‑7 (MQ=255) tCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgg > 1:1520773‑M2/1‑143 (MQ=255) tCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgg > 1:4321799‑M2/1‑143 (MQ=255) tCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgg > 2:4521239‑M2/1‑143 (MQ=255) aCGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgggcacgc > 1:2621711‑M2/1‑137 (MQ=255) cGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgggcacgcc > 1:4453065‑M2/1‑136 (MQ=255) gCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGCAAAAGGCGCCGCGGGGCCTGGCCCC‑CGCGTTGGCCGTGgtggcgggccccccc < 2:471670‑M2/150‑16 (MQ=255) gCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGGGCATGGCACC‑GGCGTTGCCGGTGgtcgcgggcacgcccgctccc < 1:3767934‑M2/150‑22 (MQ=255) gCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACACGCGCCGCGGGGCATGGCACC‑CGCGTTTCCGGTGttggcgggcacgcccccgccc < 1:3767886‑M2/150‑22 (MQ=255) ggCCATTCAGAGCCTGAACGTAGCCTTGCCACCACACCAGGACTGCGGCTGCCAACGGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCTGGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGAtt < 1:1078798/150‑1 (MQ=25) ggCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAACAGGCGCCCCGGGGCAGGGCACC‑GGCGTTGCCGGTGTTCGCCGGCACGCCCGCACCCACAGACAGAtt > 2:2252251/1‑150 (MQ=255) gCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAACAGGCCCCGCGGGGGATGGCACC‑GGCTTTTCCGGTGTTAGCGGGCACCCCCGCACCCCCAGACTGATTg > 2:2811648/1‑150 (MQ=255) cATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGCGGCTGCCAACCGGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGcc < 2:1824517/150‑1 (MQ=255) agCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGc > 2:1422206/1‑150 (MQ=255) gCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCg < 2:3317108/150‑1 (MQ=255) ttaaCGAAGCCTTGGCACCACAGCTGGACTGTGGCTGCAAAAGGGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCTAAACTGGCGCGGCGGGGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTCCGGGGCCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGc < 1:1820193/148‑1 (MQ=25) ggaccGACGCGTTGCCACCCCAGCCGTAGTGCGGGTGCCAACGGGGGGGCGGGGGCGGGCCCGCCAAACCGGGGCGGGGGTGCATGGCCCG‑GGCTTGGCGGGTTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGc < 2:405704/146‑1 (MQ=255) cGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCCCAACACGCGCCGCCGGGCCAGGCACC‑CGCGTTTCCCGGGGTCGCGGGGCCCCCCCCGCCCACCGACGGGTTGCCAGTAAGCggggcgat > 2:1568448/1‑145 (MQ=255) ggCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCCAAACACGCGCCCCCGGGCATGGCACC‑CGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGCCCGCCCCCGCCCACAGACCGGTTGGCCTTAAGCGGGCCGATCGCGAccgg > 2:4213838/1‑147 (MQ=255) ggCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 2:2611401/1‑150 (MQ=255) ccacAGCAGGCCCGCGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAACAGGCGCCCCGGGGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGGGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTACGCGGGCCTATCGCTACAGTGACg < 2:3010703/150‑1 (MQ=25) aCTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGttttt < 2:2180273/150‑1 (MQ=255) tGAGGCTGCCAATCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttg < 2:3271013/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCAACCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCAGGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgttg < 2:2565420/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGGGGGGCGGGGGGGTGCCCGCGAACCCGGCGCCGCGGGGCTTGCCCCC‑GGCTGGGCCGGTGCTCGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTc < 1:3107816/150‑1 (MQ=255) ggggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACCGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGaa < 2:3473818/149‑1 (MQ=255) gggTGCGGGCGGGCCCGCGAAACAGGCGCCGGGGTGCAGGGCACG‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGCCTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAAt < 2:480281/150‑1 (MQ=38) ggcggggggGTGCCCGCGAAACTGGCGCCGCGGTGCCTGGCACC‑GGCTTTGCGGGTGTCCGCGGCCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATc < 1:3608968/145‑1 (MQ=38) ggcgggggCGTGCCCGCGACACTGGCCCCGCGGTGCATGCCACC‑GGCTTGGCCGGTGTCCGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGCCTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATc < 1:3608792/145‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATc < 2:538671/150‑1 (MQ=255) gcgggggcgggcCCGCCAACCCGGCGCGGGGGTGC‑TGGCCCCGGGCTTGGCGGGTGTGCGCGGCCCCCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCa < 1:485408/146‑1 (MQ=255) ggggggcgggcCCGCTAACCGGGCGCGGGGGGGC‑TGGCCCCGGGGTTCGGGGGTGTCCGCGGCCCCCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCAt < 1:1889055/147‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc < 2:2879644/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTcc > 2:2006347/1‑150 (MQ=255) 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ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgggcacgcccgctcccaccgtttggcagcctcagtcctgctgtggtgccaaggcttcgttcaggctctgaatggccgcatcacgggcttcagcgttgtcga < 1:433864‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgggcacgcccgctcccaccgtttggcagcctcagtcctgctgtggtgccaaggcttcgttcaggctctgaatggccgcatcacgggcttcagcgttgtcga < 1:4464755‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGttcgcgggcacgcccgctcccaccgtttggcagcctcagtcctgctgtggtgccaaggctccgttcaggctctgaatggccgcatcacgggcttcagcgttgtcga < 2:1722502‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg > 2:3882713/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg > 1:264722/1‑150 (MQ=255) 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tttGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGActt > 2:2505417/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACttcttc > 2:2898520/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACttcttc < 2:4199376/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACttcttc > 1:4390635/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACttcttc > 2:131041/1‑150 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTcc > 2:952382/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTCGCGGCCACCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTcc < 1:2433534/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCCTTAAGCGGGCCTATCGCTACCGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCa > 2:1799420/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTATGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCa > 2:2999686/1‑150 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCAt > 1:4435454/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGACCCGACTTCTTCCATg > 1:3319305/1‑150 (MQ=255) | CGCAGTTCGACAACGCTGAAGCCCGTGATGCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACC‑GGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATG > NC_002947/1499354‑1499650 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |