New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1967188 = | 28 (0.140) | 13 (0.090) | 7/210 | NT | 31.6% | intergenic (+15/+104) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
? | NC_002947 | 1967284 = | 35 (0.230) | intergenic (+111/+8) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTGC > NC_002947/1967155‑1967431 | tGGCTGCGGGCTGATCGATTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGATCACCGCAACCCTCAAGGTTTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGc < 2:3186501/150‑1 (MQ=255) gggCTGCGGGCTGATCGCTTGCCGGTCCCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCACGGATTGCGCCCGGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGc < 2:3186510/149‑1 (MQ=38) cGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTACCACAGGATCACCGCAACCCACAAGGCTTGCGCCCAGCCTGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGCTGCAGGGTTAATGGGCGTTGAACGCCTGCCCGGTCACCCCTGTGCGGTGCGGc > 2:4095449/1‑150 (MQ=25) ctgcggggggTTGCCCGCCCCCCCCGCAACCCCGCAACCCTCACGGCTTGCGCCCGGCCTTTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATc < 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CCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTacac < 2:3888626‑M1/150‑1 (MQ=255) cgctcccacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACAcc > 1:1247316‑M2/76‑150 (MQ=255) CGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGATCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACAcc < 1:2135594‑M1/150‑1 (MQ=255) gctcccacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtaca < 2:4166326‑M2/67‑1 (MQ=255) gctcccacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgggggagcgggcaagcccgcgaagaggccgAGGCAGGTGTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTCCAGGTACACCg > 2:886882‑M2/75‑150 (MQ=255) 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cacaggcagggcgcaatccttgagggttgcggtgatcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 1:3183915‑M2/70‑150 (MQ=255) CACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGTGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg < 1:2418694‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg < 1:2418689‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGATAACCGCAACCCTCAAGGATTGAGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg < 1:123741‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGa < 2:3431526‑M1/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |