New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2057943 | 113 (0.570) | 12 (0.070) | 4/244 | NT | 11.7% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 2058017 | 81 (0.470) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGG > NC_002947/2057868‑2058161 | gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTTGGATATAACAGC‑CCACAGGTGCAGTGACAGGGTGTAAAACGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:3519442/1‑150 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCGCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATACGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:1413822/1‑150 (MQ=255) gAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacc > 1:4340183‑M2/1‑147 (MQ=255) gAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacc < 1:3360024‑M2/150‑4 (MQ=255) gAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGGCAACCCCCACCAACAGTGGGAGATCACAGC‑CCACAGGTGCAGTGACACCGGGAAATCCCCGGAGGCGCGGGTTAAcc > 1:3432436/1‑150 (MQ=255) aTGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGACAATGGGCTATAACAGC‑CCGCAGGTGCAGTGACACGGTGTAAACCCCGGAGGAGCGGGTTAacccc < 1:1952448‑M2/150‑6 (MQ=255) gCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcg > 2:1709483‑M2/1‑143 (MQ=255) ccGAGGTGCCAGCGAAGACCCCGGTGCTGGGCCCGCGCTGATCCAACAGCCA‑CGGCCTCGTCGCGGGGAAACCCGCTCCTCCAGGGGGAGATCCCTGC‑CCTCAGGTGCCGTGACAGGGTGAACTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCcgcgc < 1:754388/150‑2 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 1:4493898‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:47618‑M2/1‑141 (MQ=255) gATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACAGC‑CCACAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaag < 1:3665595‑M2/150‑11 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 2:1132354‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga < 2:2277443‑M2/150‑12 (MQ=255) tgtgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagag > 2:598449‑M2/1‑138 (MQ=255) tgCATGTGAATACCCGGGTGCTGGGCCCGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTCGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 1:1324180‑M2/1‑136 (MQ=255) tgCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCccccgcgaagaggc > 1:4016775‑M2/1‑136 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACTTTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAATTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg < 2:806748/150‑1 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGCCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACGAggccgg > 2:3462933/1‑150 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCGACAATGGGATATAAAAGC‑CCGCAGGTGCAGTGTCAGGGGGAAATACGCGTAGGAGCGGGTGCACCCGCGAAGAggccgg > 1:1924189/1‑150 (MQ=255) aaGGGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCCCTGC‑CCTCAGGTGCTGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGCGGGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg < 2:3037076/150‑1 (MQ=255) aGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccggc > 1:1444809/1‑150 (MQ=255) gTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCGCCAGTGGGATATCACAGC‑CCGCCGGGGCCGGGTCACGGTGGAATCCGCGGAGGAGCGGGGTCCCCCGCCCAGAggccggcc > 1:3579005/1‑150 (MQ=255) tGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATACGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGccc > 1:1819533/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCCgg > 2:3858491/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 2:2370695/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTGCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 1:1398266/1‑150 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACATTGGGATATCAAAGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg > 1:1398466/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATAACTGC‑CCTCAGGTTCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTc > 1:3308889/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCAATGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGGGTAATCCGCGGAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 1:3669530/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 2:1924802/1‑150 (MQ=255) tggggggCCTGCGCTCATCC‑ACCGCAACCGGCCTCTTGGGGTGTAAACCGGATCATACTTGGGTTTATCACTGC‑CCACCGGTGCATTGACTGGGTCAAATCCGCTTTGGCGGGGTTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 2:3664984/146‑1 (MQ=255) cAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAccc > 2:4508432/1‑150 (MQ=255) ccAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAccc > 2:2352647/1‑150 (MQ=255) cAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAAGCAACCCa > 2:3068878/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCaa > 2:869004/1‑149 (MQ=255) aCTGCAA‑CGGCATCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACTTTGGTATATCACTGC‑CCTCTGTTGCTGTGACTGGTTTAAATCCGGGTTGGTGGGGTTTCACCCGCTAAGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATc < 2:1457287/150‑1 (MQ=255) cTGCAC‑GGGCCTGTTCGGGGTTAACCCCGCTCCCCCATTGGGTTATCACTGC‑CCTCAGGTGCTGTGAGTGGTTTAATTCGGCGTAGGAGGGGTTTCACCCGCGATGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATcc < 2:4106133/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACCAGGCCCCCCCAGGCAACCCATCCCCTACTg > 2:3576578/1‑150 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTg > 2:3576933/1‑150 (MQ=255) gcatctTCGGGGTTAACCCCGCTCATACTTGGGTTTATCAGGGC‑CCGCTGGTGCTGTGAGGGGTTTAATTCGGGGTTGGTGGGGTTTCACCCGCTAAGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTgg < 2:636594/147‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCAATGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgc > 1:2580911/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcg > 1:2358676/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcg > 2:2171790/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCCGGTGCTGTGACAGGGTGAAATCAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgagc > 2:4083989/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 2:1046485/1‑150 (MQ=255) tcgccgcgGTTAAACCGGCCCCTACATGGTTATATCCCTGC‑CCCCGGGTGCTGGGACTGGTTTAATTCGGGGTGGGCGGGGTTTCCCCCGCGACGGGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGgcgc < 2:2350011/146‑1 (MQ=255) ggggTAAACCCGCGCCAAAGTTGGTATATCCCGGC‑CCTCTGGTGCTGTGCCTGGGTCAATGCGGGGTCGGCGGGGGTTCCCCCGCGACGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTcc < 2:3079547/149‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt < 2:2657383‑M2/150‑73 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt < 1:3875659‑M2/150‑73 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt < 1:3875732‑M2/150‑73 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt < 1:3875752‑M2/150‑73 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc > 2:2890902/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc > 1:2010824/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTTacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgc < 2:1433747‑M2/150‑79 (MQ=255) aCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTTacccgcgaagaggccgttgcaggtggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgc < 2:1433740‑M2/150‑79 (MQ=255) cccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgca < 2:430339‑M2/150‑80 (MQ=255) cccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgca < 1:2082326‑M2/150‑80 (MQ=255) ccGCTCCTACTTTGGTATATCACTGC‑CCTCAGGTGCTGTGACTGGGTGAAATCCGCGTTGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc < 2:3360024/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTTacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcac < 2:1990395‑M2/150‑81 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTTacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcac < 1:4065410‑M2/150‑81 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc > 1:3895877/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc > 2:1420391/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAcc > 1:2903369/1‑150 (MQ=255) aTTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGTGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTAtt > 2:1490093/1‑150 (MQ=255) ttGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTAttt > 1:803211/1‑150 (MQ=255) gATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGcc > 2:4048076/1‑150 (MQ=255) cctgtCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTAtt > 1:1000345/5‑145 (MQ=255) cctgtCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTAtt < 2:1000345/141‑1 (MQ=255) tgtCACTGCACCTGAGG‑GCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCct > 1:1558960/3‑150 (MQ=39) tCACTGCACCTGAGG‑GCAGTGATAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgc > 2:3150096/1‑150 (MQ=39) aCTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgctg > 2:2739556/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGCAGTGACAGGGTGACATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCca > 2:1260917/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCca > 2:1260829/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgca > 1:2111326/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgca > 1:2111267/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCAACCCCTACAGGCGCCAGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATATCGCCCAGCTGGGCTCcaccgca > 1:4095126/1‑150 (MQ=39) cAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgcacc > 2:241857/1‑150 (MQ=255) aGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgcaccg > 1:1201131/1‑150 (MQ=255) aCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTcc > 1:4084667/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCAACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg > 2:1900923/1‑150 (MQ=255) tcaaaGCCGCGTCGGCGCGGGTCCCCCCGCGAAGCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc < 2:3519442/148‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc > 2:3597110/1‑150 (MQ=255) caaccccGCGTTGGGGGGGGTCCCCCCGCCACGCGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCt < 2:940340/145‑1 (MQ=255) aTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTa > 2:773685/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTa > 2:773678/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTa > 2:2900756/1‑150 (MQ=255) tCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTAc > 1:469314/1‑150 (MQ=255) tCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCGTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTAc > 1:2551563/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGGTGGGTGTCCACGCGCTAATCGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACtt < 2:2073754/150‑1 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 2:324610/1‑150 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 2:3954049/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGa > 1:1970293/1‑150 (MQ=255) ctcttcgcgggtaAacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaacgcaatggccatcatcgcctcggcaatcggc < 2:481390‑M2/144‑137 (MQ=255) tcttcgCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGac > 1:4410552/6‑150 (MQ=255) ttcgCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGacca > 2:3205725/4‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGaccac > 1:2001283/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCt > 1:1879390/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCt > 1:1879154/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCt > 1:1077992/1‑150 (MQ=255) gggTTCACCCGCTATGTGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTgg < 2:3270878/150‑1 (MQ=255) | GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAA‑CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGG > NC_002947/2057868‑2058161 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |