New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4847095 = | 120 (0.610) | 5 (0.030) | 4/244 | NT | 5.1% | intergenic (+14/‑123) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4847188 = | 81 (0.470) | intergenic (+107/‑30) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4847042‑4847337 | gggTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAACGGTATTCCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTc < 2:1619235/150‑1 (MQ=255) ggTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTcc < 1:4072547/150‑1 (MQ=255) ccgacccccTGCAAGGCGCCGAACACCAACCGTAGCAACACCGCAAATCCCGGTGGGCGCGGGCACGCCCGCGAATGCGCTAGCTCCGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGCCGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATc < 1:617821/144‑1 (MQ=255) gAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTg < 2:2190668/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCt < 2:2282746/150‑1 (MQ=255) cccTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCCCGAATGCGATAGCTCAGGCCAAGGTCTTTCCAGGGCTGACGCAGTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGGGTTCCTATCAGCCTg > 2:2807936/1‑150 (MQ=255) ccTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCCCGCCCGCGACTGCGAGAGCGCAGGCAAAGGTATTGCCCGGGCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACCGGGGTTCCGATCGGccggc > 2:1832445/1‑147 (MQ=255) cTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATATCTCCGGCCAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGGGTTCCGATCTGCCTGAg > 1:3364592/1‑150 (MQ=255) gcCGAACACCAACCGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTg < 1:2722539/150‑1 (MQ=255) ccGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGCTGGCTCAGGCAAAGGGATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACCGGGGTTCCTATCAGCCTGAGCCGTGTCTGc > 2:2278976/1‑150 (MQ=255) gAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGccc < 2:3646941/150‑1 (MQ=255) gAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATATGCCAGAGCAGTGTCTGccc > 2:706855/1‑150 (MQ=255) acacCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGTATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGAATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTa < 2:2357981/150‑1 (MQ=255) acCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCCCGCCCGCGCATGCGCTAGCACAGGCAAAGGGATTTGCCGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACACGGTTTCCTATCTGCCGGAGCAGTGTCTGCCCGATg > 2:4202291/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGa < 1:4384948/150‑1 (MQ=255) ccAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGa < 1:3638529/150‑1 (MQ=255) cAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACCGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCCGGGTCTGCCCGATgtc > 2:3315457/1‑148 (MQ=255) cAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGGATTTCCAGGTCGGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACACGGTTTGCGATCTGCCAGAGCAGTGGCGGCCCGATGAc > 2:3862210/1‑150 (MQ=255) 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caatgCCCGGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCTATAGCTCCGCCAAAGGTATTTCCTGGTCTGCCGCCTTCGGGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCt > 1:1268692‑M1/6‑150 (MQ=255) cAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCt < 2:416108/150‑1 (MQ=255) tCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCTAATGCGATAGCTCTGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCa < 1:1585680/150‑1 (MQ=255) CCTGTGGGAGGGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTTTTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACt > 1:2708772‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCGGCTACCACTGCGCCCTg < 2:2345936‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCGAATGCGATAGCTGAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTccc < 1:34913/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTccc < 2:4066950/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTcccc > 1:4306878/1‑150 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGccc < 2:2507388‑M2/64‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcagacctggaaatacctttgcctgagctatcgcattcgcgggcgtgcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGAACCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCAc > 2:129135‑M2/74‑150 (MQ=255) 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gcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCgg < 2:25961‑M2/134‑1 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCgg > 1:3433861‑M2/17‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCAAACCTACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACAGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCACGGCAGTTCTGCTGCCCAgg > 1:2495562‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgcccccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTCTGACCCACCCGACCCCCGGCTACCCCTGCGCCCTGCCCGTCCCCCCCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCGGCCCCGGc < 1:807368‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt > 2:440648‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt > 2:4370740‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCt > 1:638516‑M2/15‑150 (MQ=255) gctcccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGt < 1:1741690‑M2/138‑1 (MQ=255) ccacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAgg > 2:1500285‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGc > 2:401621‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 2:2185260‑M2/7‑150 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 2:567984‑M2/7‑150 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg < 1:402608‑M2/144‑1 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg < 1:402560‑M2/144‑1 (MQ=255) acagggTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCg > 1:3355420‑M2/7‑150 (MQ=255) 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tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc > 2:3878492/1‑150 (MQ=255) tttCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGcc < 1:2807936/150‑1 (MQ=255) | GGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCGGCTGTCAGGCGGTGGCC > NC_002947/4847042‑4847337 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |