| New junction evidence | |||||||||||
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CTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCa < 2:151251‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCa < 1:2509539‑M1/150‑1 (MQ=255) CTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACa < 1:2758008‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAg > 2:3347896/1‑150 (MQ=255) aCCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACACCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAgc > 1:1029083/1‑150 (MQ=255) aCCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACACCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAgc > 1:1029196/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAgcgc > 2:871661/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCACCAGcgcg > 2:3511557/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACAccccc > 1:3429681/1‑150 (MQ=255) gatGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAg < 1:1448066/148‑1 (MQ=255) ccTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAg > 1:3286026/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGTCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAgg > 2:2673956/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAgg > 1:3541763/1‑150 (MQ=255) tGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAGGt > 1:327783/1‑150 (MQ=255) tGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAGGt > 1:4247831/1‑150 (MQ=255) gTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacga > 1:3518227‑M2/1‑3 (MQ=255) gTTggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcaaacactgtctgcgcccggaaaagtgtttatcataggcatctctttgcctggcttgcacgaacaccatgaccgagaacga < 2:3518227‑M2/118‑116 (MQ=255) ttGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAAcc < 2:3911031/79‑1 (MQ=255) ttGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAAcc > 1:3911031/1‑79 (MQ=255) | AGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTC‑AATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGCAACAGCGCGACACCCCCGAGGT > NC_002947/5203457‑5203752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |