| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5573380 = | 141 (0.720) | 10 (0.060) | 3/248 | NT | 7.4% | intergenic (+29/+112) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
| ? | NC_002947 | 5573465 = | 124 (0.700) | intergenic (+114/+27) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAA > NC_002947/5573317‑5573611 | tgGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATg < 1:3746119/150‑1 (MQ=255) ggAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCACCACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATgg > 2:2874035/1‑150 (MQ=255) gAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATggg > 2:633546/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcg > 1:2204333/1‑150 (MQ=255) ggCCCGTCACGGAGCTCATTCGCGCCCAGCCTCAGCGCATGCGCCATCGTTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcgc < 1:274790/150‑1 (MQ=25) cccGTCACGGAGCTCAATCGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACCGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCtt < 1:1504017/150‑1 (MQ=255) cGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGt < 2:4506949/150‑1 (MQ=255) gTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTa < 1:1673698/150‑1 (MQ=255) aCGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAAt < 2:1908940/150‑1 (MQ=255) cGGAGCTCAATCGCGACCAGCCTCAGAGCATGTGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAAtt < 2:3778177/150‑1 (MQ=255) ggAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTg > 2:2762733/1‑150 (MQ=255) gAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGc < 1:3496477/150‑1 (MQ=255) aGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCCTCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCg < 1:1255611/150‑1 (MQ=255) aGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCg < 2:3584820/150‑1 (MQ=255) tCAATCGCGACCAGCCTCCGAGCATGCGCCATCCTTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCa < 1:3888651/150‑1 (MQ=255) tCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGt < 2:2158365/148‑1 (MQ=255) tCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCa > 2:4431209/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCAct > 1:2221044/1‑150 (MQ=255) 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cTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa < 1:1925498/150‑1 (MQ=255) agCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGa < 2:3481273/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTg > 2:198397/1‑150 (MQ=255) gcgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTg < 2:513511/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTg > 2:2617076/1‑150 (MQ=255) 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cTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGtgtg > 1:3571182/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAAtt > 2:4508554/1‑58 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAAtt < 1:4508554/58‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 2:3571396/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 2:2537848/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 2:4270298/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAg < 1:3302035/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGc < 2:3329629/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGc < 2:3247799/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCa < 2:2899613/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGACCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACa > 2:3530698/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc < 1:2148403/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc > 1:28993/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc < 2:3928669/150‑1 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTg > 2:3169989/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc < 1:633546/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc > 1:443576/1‑150 (MQ=255) cgcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGcc < 2:3295617‑M2/136‑1 (MQ=255) cccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCtt < 2:1847562‑M2/144‑1 (MQ=255) cccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCtt < 2:1684937‑M2/144‑1 (MQ=255) ccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTg > 1:2798639‑M2/6‑150 (MQ=255) cacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGa > 2:3430592‑M2/5‑150 (MQ=255) | TGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAA > NC_002947/5573317‑5573611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |