New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5573393 | 133 (0.680) | 7 (0.040) | 6/248 | NT | 5.4% | intergenic (+42/+99) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
? | NC_002947 | = 5573450 | 124 (0.700) | intergenic (+99/+42) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGC > NC_002947/5573302‑5573599 | tGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAc > 1:1184891‑M2/1‑149 (MQ=255) atccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAc > 1:2738571‑M1/79‑150 (MQ=255) tccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACg > 2:651879‑M1/78‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggccctTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 2:2658187‑M1/77‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggccctTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 2:2657906‑M1/77‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 2:852233‑M1/77‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 2:1675967‑M1/77‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 2:1158035‑M1/77‑150 (MQ=255) ccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc > 1:2140843‑M1/77‑150 (MQ=255) tGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcc < 1:3329629‑M2/150‑5 (MQ=255) gcgcGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgccc > 1:3211733‑M2/1‑145 (MQ=255) cgcgAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccg < 1:3952086‑M2/150‑7 (MQ=255) gAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctc < 2:2802214‑M2/150‑10 (MQ=255) 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gcgccGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTGACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCaaa > 1:165530/4‑150 (MQ=255) cACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAAc > 2:73355/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACa > 1:2940640/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACa < 1:35691/150‑1 (MQ=255) cGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAgt < 1:937311/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAgtgt > 1:1123701/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAgtgt < 1:2393915/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGtgtg > 1:3571182/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 2:3571396/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGc < 2:3247956/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGc < 2:3329629/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTGGTAGTGGAAGTTGGGCATTTCCCAGTGGCCGCGGCTTGCCAACAGGCGCACCAGGACGCCGCCCCCCGGGGTGAGCAACa > 2:3134487/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGACCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACa > 2:3530698/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc < 2:3928669/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc > 1:28993/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGc < 1:2148327/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCAAACAGGCGCACCAGGTAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCt < 1:2566731/150‑1 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTg > 2:3169989/1‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGtt < 1:1826535/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc < 2:2221044/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc < 1:633389/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc > 1:443576/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGC > NC_002947/5573302‑5573599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |