New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5683319 = | 116 (0.590) | 8 (0.050) | 6/230 | NT | 9.6% | intergenic (‑63/+145) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
? | NC_002947 | 5683434 = | 54 (0.330) | intergenic (‑178/+30) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGC > NC_002947/5683296‑5683583 | tcttGCTTATGTTTTCTTTTTTTGTGGCAGCGCCCTTGTGTCCCCAATGGGGCGCCACGGGGCCCCAGGTTTTCATTCCCACTCCA‑TTACCCGCCGGGCCTGCGGCCCACCCCTACCGCGACACACGCCCGCTCCCACTCCAGAccacca < 2:367713/147‑1 (MQ=255) tGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGCAGCGGCCCCAGGCGTTCATTGCCACTGCA‑ATAACCGCCGGGGCTGCGGCGCAGCCCTAGCGCGACACAAGGCCGCACCCACACCAGACCACCAGGccca > 2:2217339/1‑149 (MQ=25) tGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTTTGTCGCGAAAGGGGCGCCAATCGGCCCCAGGCATTAAATGCCACAGCA‑AGAAACGCCCGGGCTGCTGCGCAGCCCAAAACCCACCCAAAGCCGCTCCCACACCACAACACCACGCCCAgcc > 2:3969418/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTTTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCACGCTTTCATTTCCACAGCA‑ATAACCGCCCGGGCTGCTGCGCCGCCCCAAAGCGACACAACGCCGCTCCCCAACCACACCACCAAGCCCAgcgc > 2:3219386/1‑150 (MQ=18) ggCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGCAAGGGGCGCGAATCGGCCCCAGGCTTTAATTTGCACGTCA‑TGTAACCCCGGGGGGGCTGCGCCCCCCAATACCGCCACCACGCCGCGCCCACACCCCACCACCCCGCCCAgcgc > 2:2751118/1‑150 (MQ=12) ttggTTCTTTGGGGGTGCGGGCTTTTGCCGCGAACGGGGCGCGACGCGCCCCCCGGCTTTCTTGGCCACTCCA‑TCAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTACCGCCACAAACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTc < 2:3594693/147‑1 (MQ=255) tttttttttGTGGTTGCGGCTTTGTGTCGCTAATGGGGGGCGAAGCGGCCCCTGGTTTAATTTGCAACTGCA‑TCAACCGCGGGGGCTGCTGCGCACCCATACCCCCAAAAACGCCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTca < 2:2853508/144‑1 (MQ=255) tttGTGGGAGCGGCCATGTGTCCCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCACGCGTTAATTGCCACAGCA‑AGAACCGCCCGGGCTGCGGCGCCGCCCGAAAGCGCCACAACGCCGCACCCACCCCAGACCACCCCGCCCAGCCGCACACAACCt > 2:3571413/1‑150 (MQ=16) ggctgtgtgTCGCGATGGGGGCGCGACGCGGCCCCTGGCTTACATGGCCCCTGCA‑TCACCCGGGGGGGCTGCGGCGCAGCCCTATGGCGACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCa < 2:335037/145‑1 (MQ=255) ggCTTTGTGGCGCCATGGGGGCGCGAGGGGGCCCCTGGCTTAATTTGCAAGTGAA‑TCACCCGCGGGGGCGGGTGCGCAGCCATATCGCCAAAAACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCa < 2:2141329/150‑1 (MQ=255) CCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCGCCCCCTCCAGACCACCACGCCCTGCGCCTCACATCCTAAACAAGGTCAgg < 1:2675117‑M1/150‑1 (MQ=255) CTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCGCACATCCAAACCAACGTCAGGt < 1:3205777‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGtt < 2:2597327‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGGCACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCGGCGCCGCACAACCTAACCAAGGTCAGGtt < 1:595903‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCAGACCACCACGCCCAGCGCCTCACAACCGAACCAAGGTcagggt < 1:404581‑M1/150‑3 (MQ=255) TGTGTCGCGATAGGGGCGCTACGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCTACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTg > 2:1799444‑M1/1‑150 (MQ=255) gttgcgcgATGGGGGCGCGCGGCGCCCCCGGGTTTTCTTGGCACCTGAT‑TGACCGGGGGGGGCGGCGGCGCAGCCCTATCGCCACACACGCCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc < 2:856815/146‑1 (MQ=255) tgtcgcgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCa > 2:4328306‑M2/101‑150 (MQ=255) GTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAg < 2:749468‑M1/150‑1 (MQ=255) gtcgcgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAg > 2:3278079‑M2/100‑150 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:1047443‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:4308134‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:1047436‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:612797‑M1/150‑1 (MQ=255) tcgcgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa > 1:3847300‑M2/99‑150 (MQ=255) GCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACCTCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc < 2:1276362‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc < 2:4142603‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc < 2:3303867‑M1/150‑1 (MQ=255) cgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATcc > 1:2550580‑M2/96‑150 (MQ=255) gatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGatcag > 1:556789‑M2/95‑148 (MQ=255) ataGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCTTTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCTGCCCTATCGCTACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCcgc < 2:2623148/148‑1 (MQ=255) gcgcGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGGTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCGCCCACGCCAGACCACCCCGCCCGGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACg > 1:2276546/1‑150 (MQ=39) gcgcGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACg > 2:1602300/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCa > 2:773063/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCCCCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATACGCGTCACGCa > 2:3830877/1‑150 (MQ=255) gCCCCTGGCTTTCATTGCCACTGAA‑TGAACCGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCtt < 2:2166443/150‑1 (MQ=255) gCCCCTGGCTTTAATTGCCAC‑GCATTGAACCGCGGGGGCTGCTGCGAAGCCCTAGCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCtt < 2:3981428/150‑1 (MQ=255) cccAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAATGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCAAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTc > 2:2851172/1‑150 (MQ=255) 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cccAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTAACGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCACACCACCAGGCCCTGCGCCTCACAACCGAACCAACGTCAGGGTGCAGATCCGCGTCACGCCCCAGCCATTc > 1:607657/1‑150 (MQ=38) ggCTTTCATTGCCACGGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCTCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAAt < 2:3741541/150‑1 (MQ=255) gCTTTCATGCCCACGGCT‑TCACCCGCGGGGGGGGCGGCGCACCCCTACCCCCACACCCCGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATg < 1:2217339/150‑1 (MQ=255) tttCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCAGCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCg > 2:3763723/1‑150 (MQ=255) ttggCCACTGCT‑TTAACGGGGGGGGGTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACATGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCa < 2:2476938/147‑1 (MQ=255) 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tGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCAATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAccc > 2:160349/1‑150 (MQ=255) gAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcg > 2:689427/1‑150 (MQ=255) aagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcgcg > 1:1312818‑M2/50‑150 (MQ=255) aagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcgcg > 1:1312875‑M2/50‑150 (MQ=255) aagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcgcg > 1:1312901‑M2/50‑150 (MQ=255) aCCGCCGGCGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCcgcg > 2:3549945/1‑150 (MQ=255) ccgccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCCACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCgcgc < 2:364932/150‑1 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAc > 1:3636282/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGc > 2:1552250/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGc > 1:1784896/1‑150 (MQ=255) 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gcgcAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccca > 2:1739134/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccca > 2:3659003/1‑150 (MQ=255) gcAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcacccacc > 1:2393684/1‑150 (MQ=255) gcAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcacccacc > 1:1780586/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTATCGCGACACAAGGCCACTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc < 1:207605/80‑1 (MQ=255) cAGCCCTATCGCGACACAAGGCCACTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc > 2:207605/1‑80 (MQ=255) ccTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCAc > 1:3186594/1‑150 (MQ=255) aTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCGAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGc > 1:2943420/1‑150 (MQ=255) aTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGc > 1:836942/1‑150 (MQ=255) gcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGc > 1:264757‑M2/22‑150 (MQ=255) cgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGcc > 2:2566047‑M2/21‑150 (MQ=255) gacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCa > 2:4229632‑M2/20‑150 (MQ=255) acaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCt > 1:91211‑M2/17‑150 (MQ=255) acaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCt > 1:3104826‑M2/17‑150 (MQ=255) caaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTc > 1:4401214‑M2/16‑150 (MQ=255) caaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTc > 1:791306‑M2/16‑150 (MQ=255) aggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCa > 1:786912‑M2/14‑150 (MQ=255) aggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCa > 1:1542789‑M2/14‑150 (MQ=255) cccgcccccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAAc < 1:1143440‑M2/139‑1 (MQ=255) gctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTg > 2:4286512‑M2/9‑150 (MQ=255) gctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTg > 2:1247369‑M2/9‑150 (MQ=255) tcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCGAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGcc < 2:2943420‑M2/144‑1 (MQ=255) ccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCa > 1:3610600‑M2/5‑150 (MQ=255) ccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCa > 2:670816‑M2/5‑150 (MQ=255) cacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGTTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAg > 2:2885114‑M2/4‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:3868628/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:3868452/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:458595/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:458718/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:458743/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 1:4393332/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 2:2198277/1‑150 (MQ=255) | TGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCA‑TGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGC > NC_002947/5683296‑5683583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |