| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5818849 | 74 (0.380) | 13 (0.080) | 8/240 | NT | 15.3% | intergenic (+57/+72) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
| ? | NC_002947 | = 5818876 | 80 (0.470) | intergenic (+84/+45) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5818727‑5819025 | cggggcggcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcaca > 1:1294603‑M1/106‑150 (MQ=255) cACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtac > 2:25642‑M2/1‑147 (MQ=255) cTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacct > 1:2717383‑M2/1‑145 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCGCCCACAGGTAGCGCGGCGCGCGCGCGCGCAGCTCACAaaccgg < 1:2187164‑M2/150‑7 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 1:1342189‑M2/1‑143 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 2:2673976‑M2/1‑143 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 2:2674192‑M2/1‑143 (MQ=255) gggtggggatgctgacgatggtgggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg > 1:4269298‑M1/98‑150 (MQ=255) cggtggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg > 2:1632387‑M1/98‑150 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 1:721835‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:2989909‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:1371388‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 1:2795649‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 2:2072152‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 1:2550052‑M2/1‑142 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 2:3943331‑M2/1‑141 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCGTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 2:2705851‑M2/1‑141 (MQ=255) ggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg > 1:2914093‑M1/97‑150 (MQ=255) gaggggatgctgacgagggagggggcggtgcggaggctgagggagcgagggttgatcacaggcttgtagtacctgctaaggccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTggg > 2:2804163‑M1/96‑150 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTACGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCGTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga > 2:3442986‑M2/1‑139 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga > 2:3133826‑M2/1‑139 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga > 2:3133944‑M2/1‑139 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga > 2:64921‑M2/1‑139 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTAGCGCGGCGCTCGCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcggg < 2:4002121‑M2/150‑17 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcggg > 2:2839812‑M2/1‑134 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggc > 1:2038335‑M2/1‑133 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCCGCTCCCAgaccggtgggagcgggcg < 2:374437‑M2/150‑19 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACACGTAGCGCGTGGCGGAAGCGCCCAGCTCAAAaaacagggggagcgggcg < 1:367110‑M2/150‑19 (MQ=255) 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gAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAGGGAGCGCGTCGCGCTCGCCCGCCGCGCACCAACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAggg > 2:2709669/1‑150 (MQ=255) gccgcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTg < 2:3826707/147‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACCCCCGCTCCCCCCGGGAGCGCGGCGCTCGCGCGCGCCGCGCACCTAACGGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCGTTGccg > 2:460869/1‑148 (MQ=255) gcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGta < 2:323127/150‑1 (MQ=255) tGATTCTGGCCAAGCTTTAAGCTTATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCTGCTCAAATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGtact < 1:2063504/150‑1 (MQ=38) 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aGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCGTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 2:1237573/150‑1 (MQ=255) gCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGAt < 2:3754926/150‑1 (MQ=255) aaGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGTAGCGCGTCGCTCGCGCGCGCAGCTCACATCCCGGGGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAcc < 1:100913/150‑1 (MQ=255) cTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTc < 1:2860366/150‑1 (MQ=255) tGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCg < 2:1826414/150‑1 (MQ=255) 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TCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCAtcccca < 1:2629015‑M1/150‑2 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac < 1:3486008‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac < 1:3673449‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac < 1:2874869‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttg > 1:2153912‑M2/1‑36 (MQ=255) CCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc < 2:208380‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCAACGTCAGCATCCCCTcc < 1:3124770‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg < 2:591660‑M1/150‑1 (MQ=255) caGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgta < 2:2138031‑M2/150‑118 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtg < 2:493952‑M2/150‑121 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtg < 2:119080‑M2/150‑121 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgcccccc > 1:4371678/1‑148 (MQ=255) tCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTg < 1:1678554/150‑1 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGccgc > 2:4080262/1‑147 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCAGCATc > 2:2022385/1‑150 (MQ=255) ctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCa < 1:3291714/150‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCAc < 1:4001786/150‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCAc < 1:4002121/150‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCACGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCAc > 1:3155904/1‑150 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa < 1:1482282/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:2793130/150‑1 (MQ=255) gCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACaa < 1:553496/150‑1 (MQ=255) gCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCATCGTCAGCAACCCCACCGCCGCCCCGCCCAGCATCACTGAAGACaa > 1:2350372/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCCCCCGGCATCACTGAAGACAACt > 1:4138460/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCCCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACt > 2:111438/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTACGCCGCCCCGCCCTGCCTCACTGACGACAACt > 2:2365395/1‑150 (MQ=255) aTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCAGCATCACTGAAGACAACAgcgc > 1:1834291/1‑150 (MQ=255) | AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5818727‑5819025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |