| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5872267 | 63 (0.320) | 10 (0.060) | 7/218 | NT | 16.6% | intergenic (+50/+84) | PP_5144/ptsP | hypothetical protein/phosphoenolpyruvate‑dependent regulator |
| ? | NC_002947 | = 5872302 | 51 (0.330) | intergenic (+85/+49) | PP_5144/ptsP | hypothetical protein/phosphoenolpyruvate‑dependent regulator | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GCTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTCATGGC > NC_002947/5872154‑5872451 | caactggccctgaagaaccttgggttggcgcggatgattgggcctggggctaataaaaccctgtgagggtgatgctgtttgtgccGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTgg > 2:3148976‑M1/86‑150 (MQ=255) cTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgt > 1:800239‑M2/1‑148 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGTGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 1:698289‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 2:279223‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTCGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGCGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta < 2:716220‑M2/150‑4 (MQ=255) ggTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtag > 1:1647839‑M2/1‑146 (MQ=255) ggTTGAGCGCAGTTGCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtag > 1:1648034‑M2/1‑146 (MQ=255) tggccctgaagaaccttgggttggcgcggatgattgggcctggggctaataaaaccctgtgagggtgatgctgtttgtgccGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAgg > 1:3406330‑M1/82‑150 (MQ=255) tggccctgaagaaccttgggttggcgcggatgattgggcctggggctaataaaaccctgtgagggtgatgctgtttgtgccGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAgg > 1:242180‑M1/82‑150 (MQ=255) ttGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtagga > 1:2940329‑M2/1‑144 (MQ=255) cctgaagaaccttgggttggcgcggatgattgggcctggggctaataaaaccctgtgagggtgatgttgtctgttcgGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑Cg > 2:4502302‑M1/78‑150 (MQ=255) aGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCTTTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGTACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcg > 1:8793‑M2/1‑141 (MQ=255) aGCGCAGTTTCGGGCCTTGTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGATTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcg > 1:2815541‑M2/1‑141 (MQ=255) gcgcAGTTTGGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGTGAAATTGTGTTGTTGGTCTGATTATTTGATGTTGTCTTTTCTGGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTGGTACAACGGCCTGGGTCCAACACCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑Cgg < 1:1231873/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGTCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:1679721‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 2:3877749‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 2:1602738‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 2:1602660‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:933660‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:1822275‑M2/1‑140 (MQ=255) cgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcggg > 2:2271714‑M2/1‑139 (MQ=255) tttCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcac > 1:3692928‑M2/1‑134 (MQ=255) cGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCCGATGTGGGTACGTGgtaggagcgggttcacccg < 2:3674364‑M2/150‑20 (MQ=255) 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ttttGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGGGGACCCCCCCCGACAAAGCCCAGGGTCCAACCCCCCAAGTGTGTACCGGGTTGGAG‑CCGGGTGACCCCCCAaga > 1:591318/1‑150 (MQ=255) ggAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGTAGCCGGTGGTACAACGGGCTGGGTGCTACCCCAGTTGTGTGTTGGTGGTTGGTG‑GGGGTTGACCCGCGTAGATGGCGGGACAAAAAGCAt > 2:1704690/1‑150 (MQ=255) gAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCAACAAACGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGGGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCCTAAcccac > 2:3985051/1‑148 (MQ=38) ttgttgGTCTGTTTTTTTGTTTTTGTCTGTTGGGGCCTCTTGGGGGTTTAACCGGCTCTACCACCGGCGTGGGTCAAACCCCTTTGGTGTTTAGTTGGTTGGAG‑GGGTTTCACCCGCGAAGTGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTcaca < 2:2535495/150‑1 (MQ=255) gTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAAACCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGttt > 2:1077318/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) cAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc < 2:2639975/148‑1 (MQ=255) cAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCt > 2:1546179/1‑150 (MQ=255) aGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTg > 1:415977/1‑150 (MQ=255) gttgtgttTTCGTGGTTGGAG‑GGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGc < 2:3112723/148‑1 (MQ=255) aTGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCg > 1:3309937/1‑150 (MQ=255) 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GCTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAG‑CGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTCATGGC > NC_002947/5872154‑5872451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |