| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 95,665 | A→C | 8.8% | intergenic (+57/+15) | PP_0087 → / ← PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 95,665 | 0 | A | C | 8.8% | 418.2 / 6.8 | 132 | intergenic (+57/+15) | PP_0087/PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (104/13); new base C (2/13); total (106/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.73e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AAGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAC > NC_002947/95516‑95811 | acgCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGa < 2:3410957/148‑1 (MQ=255)aaGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGa > 1:4087571/1‑150 (MQ=255)aaGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGa > 1:4087538/1‑150 (MQ=255)aaGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGa > 1:2416154/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGc < 2:4253973/150‑1 (MQ=255) cTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGcc < 2:1090555/150‑1 (MQ=255) gagaTCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCcgc < 1:521246/150‑1 (MQ=255) agaTCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTCAGGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAAACTATGGGAGC‑GGGCGAGCCcgcg > 2:2089210/1‑150 (MQ=255) agaTCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCcgcg < 2:4220291/150‑1 (MQ=255) gaTCGTCAAGAACGGCGAGCGGGCGGGCATGGTGATTGGTAGCTGCGGGGCCGGTACCAAGGTGATTGTTTACCGCCGCGGCTATTGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCACGTCAACCTATGGTTGC‑GGGCGAGCCCGcga < 2:581560/150‑1 (MQ=255) gTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAg > 1:1940208/1‑150 (MQ=255) gTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAg > 2:3050658/1‑150 (MQ=255) gTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAg > 1:3468573/1‑150 (MQ=255) tCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAgg > 1:2366872/1‑150 (MQ=255) cAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAggg > 1:1490947/1‑150 (MQ=255) cAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAggg > 2:3075633/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGt > 1:2063695/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGt > 2:4274011/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGt > 2:1447416/1‑150 (MQ=255) gAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCa > 2:4378910/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCgg > 1:3649204/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCt > 1:2748814/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTg > 1:3229547/1‑150 (MQ=255) gATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCAt > 2:3245146/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCGGCGGTTACCACGGAGTTTTTTTCCCGCCGCGTCAACTGGGTTTGCACATGGGCGGGCTTGCGCGCCCCCACGACAACCTTGGGGTGC‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCat < 2:4501649/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCata > 1:4199934/1‑150 (MQ=255) gCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATg > 2:2846519/1‑150 (MQ=255) ccGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGaa > 1:2990654/1‑150 (MQ=255) ccGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGaa > 1:1348745/1‑150 (MQ=255) ggTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTACTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATg < 2:372606/150‑1 (MQ=255) tACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCg > 2:2411963/1‑150 (MQ=255) cAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTc > 1:1445700/1‑150 (MQ=255) aaGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTcc > 1:800675/1‑150 (MQ=255) aaGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTcc > 2:4149867/1‑150 (MQ=255) gagaTTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCa > 2:2660655/1‑150 (MQ=255) gagaTTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCa > 2:2660623/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCt > 1:1877011/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCt > 1:565588/1‑150 (MQ=255) cgGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTcaca > 1:2404281/1‑150 (MQ=255) gcttttgtgTTTGCTCATTCGCGGGGTTGCTCGCTCCCACGACAACCTCGGGGGGG‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAgg < 2:2247985/145‑1 (MQ=255) gCTATTGTGTTTGCACTTGGGGGGGGTGGCTCGCTCCAAAGTCAACCTAGGGGTGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAgg < 2:4400250/150‑1 (MQ=255) gCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAgg > 2:388519/1‑150 (MQ=255) tAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTa > 2:3291265/1‑150 (MQ=255) tAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTa > 2:4291409/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAg > 2:2100548/1‑150 (MQ=255) gtttttGCTCTTGCGGGGTTTTGCGCGC‑CCCAATGAAACCTTTGGGGGGGGGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGa < 1:1048158/147‑1 (MQ=255) gtgtTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGa > 1:3232748/1‑150 (MQ=255) ttGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAg > 1:1867799/1‑150 (MQ=255) cTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTc > 1:4005834/1‑150 (MQ=255) cTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTc > 2:1711158/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 2:888819/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 2:1196438/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAACTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 1:1282462/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATcggaagag > 1:93223/1‑143 (MQ=255) tgcgggggTTTGCTCGCTCCCATTAAAACCTTGGGGCGG‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATcc < 2:3031955/145‑1 (MQ=255) cgcgggggCTTGCGCGCTCCCACGCAAACCTCGGGGCGG‑GGGCGACCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATcc < 2:2647357/145‑1 (MQ=255) gcgGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCa > 1:1661925/1‑150 (MQ=255) gcgGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCa > 1:3853402/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCAccc > 1:4355731/1‑150 (MQ=255) gCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCg > 2:2253086/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAgg > 1:4287922/1‑117 (MQ=255) ttGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTCAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTc > 1:1257811/1‑150 (MQ=255) gctcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTg > 1:598699/1‑150 (MQ=255) ctcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTaa > 1:4176213/1‑124 (MQ=255) ctcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTaa < 2:4176213/124‑1 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 2:1313069/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 2:539171/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 1:4364154/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 1:176417/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 2:1511789/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCAATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 2:539007/1‑150 (MQ=255) cgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAg > 1:2941343/1‑111 (MQ=255) cgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAg < 2:2941343/111‑1 (MQ=255) gctcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTcc > 2:3172944/1‑150 (MQ=255) tcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcag > 1:3266437/1‑150 (MQ=255) tcCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcag > 2:1121771/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagca > 2:1575285/1‑150 (MQ=255) cAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagcag > 2:4464920/1‑150 (MQ=255) aaGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCagcagc > 2:2722658/1‑150 (MQ=255) ccccacccTTTGGGCGG‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAgcagca < 2:1845866/144‑1 (MQ=255) gTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCAc > 1:2587496/1‑150 (MQ=255) aCCTCTGGGTGC‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCt < 2:1369578/150‑1 (MQ=255) aCCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCt > 2:2693791/1‑150 (MQ=255) aCCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCt > 2:2693758/1‑150 (MQ=255) cctcggggCGC‑GGGCCCCCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTa < 2:2477486/145‑1 (MQ=255) ccTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTa > 1:3653209/1‑150 (MQ=255) ccTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTa > 1:2477486/1‑150 (MQ=255) tATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTAcc > 1:2565129/1‑150 (MQ=255) tATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTAcc > 2:2311296/1‑150 (MQ=255) tATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTAcc > 1:306519/1‑150 (MQ=255) aTGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCt > 1:2520459/1‑150 (MQ=255) ggggTGC‑GGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCtt < 2:3468573/149‑1 (MQ=255) gggcgggggCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTg < 1:704636/144‑1 (MQ=255) ggAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTgg > 1:3439084/1‑150 (MQ=255) tcgC‑GGGCTCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc > 1:512877/3‑150 (MQ=255) gAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACACGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc > 1:608184/1‑150 (MQ=255) c‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCtt > 1:3073322/1‑150 (MQ=255) gggCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCttt > 2:82107/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTa > 2:2026821/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTa < 2:2404281/150‑1 (MQ=255) | AAGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGC‑GGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAC > NC_002947/95516‑95811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |