| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 5,508,456 | T→G | 10.7% | M438R (ATG→AGG) | PP_4839 → | iron‑regulated membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,508,456 | 0 | T | G | 10.7% | 304.0 / 2.6 | 141 | M438R (ATG→AGG) | PP_4839 | iron‑regulated membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/64); new base G (5/13); total (58/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GGGCTGGTGATGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTA > NC_002947/5508308‑5508605 | gggCTGGTGATGTGGTGGATGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGAtg < 2:1612689/150‑1 (MQ=255)gggCTGGTGATGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGAtg < 2:3888109/150‑1 (MQ=255) cTGGTGATGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTgg < 2:1542091/150‑1 (MQ=255) 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aTGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTg < 2:1593528/150‑1 (MQ=255) aTGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTg < 2:1004567/150‑1 (MQ=255) gtggtgGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGTCCTGCCACGCTGGATGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGa < 1:285371/150‑1 (MQ=255) gtggtgGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGGGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGa < 2:666143/150‑1 (MQ=255) tggtggAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGAt < 1:2139028/150‑1 (MQ=255) 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ggggggTGCTGGTCCCGCGGGGGGGGGTGGCGCGGGGGGTGAGGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAgg < 2:3650751/149‑1 (MQ=37) gggggTGATCGTCCCGCGGGTGGGGGCGGCGCCGGTGGTGATGTGGGGGGTGGAGAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAggg < 2:3412584/150‑1 (MQ=38) gggggCGAGGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGAGGGCGGTGAGGTGGGGGGGGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAggg < 2:3412566/150‑1 (MQ=38) gTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACcg > 2:1634326/1‑150 (MQ=255) gATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGAGGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCAACCAGGGCCcccg > 1:902593/1‑150 (MQ=255) cccccccGCGGGCGGGGGCGCCGACGGCGGCGACGCGGCGGGGGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGtt < 1:4065219/146‑1 (MQ=37) tCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGGAAAACCCCACCAACCAGGGACCCCGTTGTa > 1:1930428/1‑150 (MQ=255) gcccGCGGGGGGGGGGGTCGCTGGGGGGGCGGGGGGGGGTGGAGAGTTGGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGAGGGACCGCGTTGTa < 2:2902817/149‑1 (MQ=37) cccGCGGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGCTGGGGGGGGGGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAg < 2:3119574/150‑1 (MQ=255) gtggGGGTCTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGCGGAGAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCggg < 2:2367876/150‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGCTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCAAAGAGGGACCGCGGTGTAGGAGCGGGTGTGCCcgcgc > 1:3143906/1‑149 (MQ=38) tgtgGGGGCTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTCGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGCGGTCCCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGccagca < 2:4518886/150‑5 (MQ=14) | GGGCTGGTGATGTGGTGGAAGCGCCGTCCTGAAGGCGGCCTGGGCGTACCGCCTTTGCGTCATGACCTGCCACGCTGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTA > NC_002947/5508308‑5508605 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |