| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,002,896 | A→T | 5.0% | intergenic (+25/+84) | PP_5256 → / ← amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,002,896 | 0 | A | T | 5.0% | 639.5 / 10.1 | 194 | intergenic (+25/+84) | PP_5256/amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (90/92); new base T (6/5); total (97/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GTGGCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGT > NC_002947/6002747‑6003045 | aggcggacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:2801327‑M1/134‑150 (MQ=255) gcggacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:3513589‑M1/19‑1 (MQ=255) gacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCgggtaaaaacc < 1:1977209‑M1/22‑5 (MQ=255) gacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 1:1854167‑M1/22‑1 (MQ=255) gacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 2:1096152‑M1/129‑150 (MQ=255) gacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCg < 1:4067684‑M1/22‑1 (MQ=255) aaGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTAACCCG > 2:3819510‑M1/1‑150 (MQ=255) gTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCCAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCCCTTCCCCGGGGAACCCccc > 1:2459833‑M1/1‑147 (MQ=255) tGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTGGTTGTTGCAGAATCCGGCTTCAAACAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCACTTAGCGGGGAAAACCccac > 1:4384018‑M1/1‑146 (MQ=255) tGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGACAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGGTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCGCgc > 2:3215721‑M1/1‑148 (MQ=255) cctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:844461‑M1/124‑150 (MQ=255) ctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:2872926‑M1/123‑150 (MQ=255) aGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 2:1509643‑M1/150‑1 (MQ=255) aGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCACTTCGCGGGGAAAACCccaacaa > 2:497599‑M1/1‑143 (MQ=255) tgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTTAAAGCGCTCCtaa < 1:2660582‑M1/29‑2 (MQ=255) tgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:2264360‑M1/122‑150 (MQ=255) tgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:1696645‑M1/122‑150 (MQ=255) gACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:2348635‑M1/150‑1 (MQ=255) gccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 2:474326‑M1/121‑150 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:3630429/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGCAATTTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAagta < 2:2454357/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTg < 1:632843/150‑1 (MQ=255) gccaaTTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCCCGCCAACAAGTAGTGccc > 2:1990707/4‑148 (MQ=255) ttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCg < 2:861989‑M1/42‑1 (MQ=255) aaaTTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAagtaggagcggg < 1:3054758/150‑8 (MQ=255) cGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAgg < 2:1854564/150‑1 (MQ=255) cggcggCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGcgggg > 2:2596630/1‑146 (MQ=255) ggcggcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTgtgg < 1:1584208/150‑1 (MQ=255) cggcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTgtggtg < 1:1412026/150‑1 (MQ=255) gcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGTAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTAAACCGCTGCTTGAAGTATTTCACCGCCGGATATGGGTgtggttta > 2:2660582/1‑147 (MQ=255) gcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGaa < 2:697781/150‑1 (MQ=255) cAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAAc < 2:1536514/150‑1 (MQ=255) gagCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTTAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCt > 2:4191289‑M2/1‑149 (MQ=255) gagCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCt > 2:2035567‑M2/1‑149 (MQ=255) cgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCt > 2:4497965‑M1/86‑150 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 1:1714191‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGATTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 2:3837229‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAAAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 2:1963936‑M2/1‑146 (MQ=255) ctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGc > 2:1489655‑M1/78‑150 (MQ=255) ctgcggacagcgttctaggagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGc > 2:3954869‑M1/78‑150 (MQ=255) aGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagc < 2:2154814‑M1/150‑44 (MQ=255) tgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCg > 1:3386541‑M1/77‑150 (MQ=255) gTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcg < 1:1588525‑M1/150‑45 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgg < 1:3100502‑M1/150‑46 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGGACCtgtaggagcgg < 2:3319385‑M2/150‑12 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 1:854362‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 2:4451047‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 1:2134375‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC > 1:1112552‑M1/1‑98 (MQ=255) gcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCgg > 2:247409‑M1/76‑150 (MQ=255) cGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcggg < 2:4133390‑M1/150‑47 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggt > 2:3542630‑M2/1‑137 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggt > 2:1151203‑M2/1‑137 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggt > 2:646111‑M2/1‑137 (MQ=255) ttgttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtggaggagcgggtt < 2:3505792‑M2/150‑15 (MQ=255) ttgttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCAACAACAAATAGTTCAACCCCCGAGAGGGCGGTGGTGAAACagtaggagcgggtt < 1:330482‑M2/150‑15 (MQ=255) ttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttac > 2:1673806‑M2/1‑133 (MQ=255) ttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttac > 2:1642460‑M2/1‑133 (MQ=255) tgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgc > 1:1192365‑M2/1‑129 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:3651354‑M2/150‑25 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:1374295‑M2/150‑25 (MQ=255) tgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 2:3376177‑M1/61‑150 (MQ=255) aGCCGGCTTCAATCCAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:2626847‑M2/1‑123 (MQ=255) aGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:2626854‑M2/1‑123 (MQ=255) gCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAGTATTGCACCCCCGGAGAGGGCGGTGGTGAACCtggaggagcgggtttacccgcgaagagg < 2:3192291‑M2/150‑29 (MQ=255) gCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGAAAACCGCTCCGAAAAGTAGTGCACCCCCGGAGAGGGCGGTGGTGTACCagtaggagcggggttacccccgaagagg < 2:474649‑M2/150‑29 (MQ=255) aagaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCGGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaa > 2:2560981/1‑150 (MQ=255) agaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCGGAGAGGGCTGTGGTGAACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGGAGAGGCCCGTACTTacaac > 2:3571484/1‑150 (MQ=38) ggTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCATACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTTAACATGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaacacaac < 2:1659313/150‑1 (MQ=38) ttCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGTGGGCTGTGTTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAg < 2:4028851/150‑1 (MQ=255) accTGCGTGGGTGGCACAAGTGCGCCTGTGCGGGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCACCTACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGGGGTGAACGTGTAGTTGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAgg < 2:188715/149‑1 (MQ=37) gAGTTGGTTGCACATGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGTGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACt < 2:1274974/150‑1 (MQ=255) gttgCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAGTAGTGCACCGCCGGAGGGGGCGGGGGGGAACCGGGAGGCGCGGGGTTACCCCCGGAGAGGCCAGTGCGTACAACACAACCCACAGGCCCGGCCCcg > 2:4219978/1‑150 (MQ=25) acaAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTgg > 2:2986036/1‑150 (MQ=255) acaAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTAAAACTAGTGCACCCCCTGAGAGGGCTGTTGGGTAACGGTTGGGGCGGGTTTACCCGCGAACTGGCCAGTACTTACAACAAAAACCGCAGGCACTGCCCCGCGTgg > 2:1349835/1‑150 (MQ=255) aaGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGTGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTa > 2:2697959/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGGGCGGGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCGTGCCCCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGc < 2:407673/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCGGGCACCGCCTGAGTGGGCTGTGGTGAACCTGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAAcc < 2:1578541/150‑1 (MQ=255) cgggCCTCTGCGGGGGAAACCCCGCTCCTACACGTTGTCCACCGCCTGCCAGCGGTGTGTTGAACCTGTTGGTGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCg < 1:3819510/148‑1 (MQ=255) gggcCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACCggttcaccacagccctctccggcggtgcactacttgtcggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagcc < 2:4333630‑M1/149‑120 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGCGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACAGCCCCGCGTGGTACAGCGAACAACCGGAc < 2:3233302‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTCTCCGCGGGTAACCCCGCTCCTCCAggtaccccacagccctctccgggggtgcactccttgtaggcgcggtttaacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggc < 1:3008693‑M1/150‑123 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcaccggctcacgtgtgcaaccaacacaggaagccacccgtcttgattgtagccggctt > 2:4314687‑M1/1‑26 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccgcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggctt > 2:4314718‑M1/1‑26 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCCCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCACAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCggacaca < 2:2040859‑M1/150‑4 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACAGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAAACGGACTCa < 2:3139856‑M1/150‑1 (MQ=255) ggaGCGGGTTTACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATa < 1:1350499‑M1/147‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgca > 1:1298774‑M1/1‑21 (MQ=255) GCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGaa < 1:1076398‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGaa < 2:1783587‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGaa < 2:2948124‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGaa > 2:4375180‑M1/1‑150 (MQ=255) gggttAAACCCGCTCTTACATTTCGTGCACGGCTTGTGTGGGGTGTGGTTACCCTTTCGGCGGGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAAc < 1:2408170/146‑1 (MQ=255) ggtaAAACCCGCTCCTACCAGTAGTGCACGGCCTGTGCGGGCTGTGTTGACCCTTTAGGTGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACg > 1:1305239‑M1/5‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaac > 1:35907‑M1/1‑19 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcactt > 1:2460144‑M2/1‑51 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcactt < 2:2460144‑M2/96‑46 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAA‑CCGGACTCATAGAACGCTg < 1:2851084‑M1/150‑1 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAA‑CCGGACTCATAGAACGCTg < 1:587537‑M1/150‑1 (MQ=255) AAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGt < 1:2151627‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTGGCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGT > NC_002947/6002747‑6003045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |