Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,131,148 | C→T | 5.5% | intergenic (+32/+35) | PP_5376 → / ← PP_5377 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,131,148 | 0 | C | T | 5.5% | 651.5 / 16.2 | 201 | intergenic (+32/+35) | PP_5376/PP_5377 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/104); new base T (4/7); total (90/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CTCGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCTGCCGGCATA > NC_002947/6130999‑6131297 | cTCGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGcc > 2:1850992/1‑150 (MQ=255) cTCGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGcc > 2:1621580/1‑150 (MQ=255) cTCGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGcc < 1:118285/150‑1 (MQ=255) cGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCtt < 2:3201072/150‑1 (MQ=255) cccGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTaaa < 1:227648/150‑1 (MQ=255) ccGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTaaaa < 1:653569/150‑1 (MQ=255) gggAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAgcg < 2:3760732/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGCAAACGGCGCTTTTAAGGCGCCGt < 2:78200/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGt < 2:136648/150‑1 (MQ=255) tgtgACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAATCGCCGTTTg > 2:4503007/1‑150 (MQ=255) tgACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCg > 2:3931935/1‑150 (MQ=255) tgACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCg > 1:1161739/1‑150 (MQ=255) tggTGATGCCTGCGAAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACTTTCTCGAATACGGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACTAAAACGGCGGTTTTAAGGCGCCGTTTTCGtt < 1:71327/148‑1 (MQ=255) aCGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGtt < 1:2632800/150‑1 (MQ=255) cGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTg < 2:4320089/150‑1 (MQ=255) cGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTg < 2:2438770/150‑1 (MQ=255) gTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCTTTTAAGGCGCCGTTTTCGtttg < 1:55281/150‑3 (MQ=255) gTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTgg < 2:180488/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGt < 2:152373/150‑1 (MQ=255) gcgcAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGt < 2:696715/150‑1 (MQ=255) cgcAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTg < 1:4055784/150‑1 (MQ=255) gcAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTgg < 1:3958156/150‑1 (MQ=255) gcAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTgg < 1:378618/150‑1 (MQ=255) aaaTGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGt > 2:1714325/1‑150 (MQ=255) gACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGt < 1:1605408/150‑1 (MQ=255) aCCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTg < 2:1997403/150‑1 (MQ=255) ccTATGAACACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTgg < 2:1152260/150‑1 (MQ=255) cTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGc > 2:1467140/1‑150 (MQ=255) tATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGcc > 1:1615911/1‑150 (MQ=255) aTGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCt < 1:2516317/150‑1 (MQ=255) tGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTg < 1:389451/150‑1 (MQ=255) aCTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATaa > 1:3570186/1‑149 (MQ=255) tCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATActc < 2:3457087/150‑1 (MQ=255) tCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATActc > 2:2067758/1‑150 (MQ=255) tCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATActc < 1:4220949/150‑1 (MQ=255) ccGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATActc < 2:1228616/149‑1 (MQ=255) gACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTg < 1:175064/150‑1 (MQ=255) aCAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGc < 2:2555636/150‑1 (MQ=255) aGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCaa > 2:263540/1‑150 (MQ=255) aGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCaa < 1:2147325/150‑1 (MQ=255) aGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCaa > 1:2921353/1‑150 (MQ=255) aGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCaa < 1:3418170/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAAc < 2:1829870/150‑1 (MQ=255) cTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTc > 1:106356/1‑150 (MQ=255) tCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCa > 1:2385011/1‑150 (MQ=255) aaCATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATc < 2:4360247/150‑1 (MQ=255) aaCATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATc < 1:3691851/150‑1 (MQ=255) aTTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCg > 2:1609826/1‑150 (MQ=255) tcGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCg > 1:3303380/1‑150 (MQ=255) tcGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCg > 2:391656/1‑150 (MQ=255) gAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTGAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGct < 1:2814979/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCttgtt > 1:489101/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCttgtt < 2:493583/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTgaga < 2:1111462/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGAc > 1:823309/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCCGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGAc < 1:2226650/150‑1 (MQ=255) gCATCACTTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCATAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATg > 2:662906/1‑150 (MQ=255) cATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGa > 2:10897/1‑150 (MQ=255) aTCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGAc > 1:1000775/1‑150 (MQ=255) cAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCt < 1:1480594/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCGGAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTg < 1:861798/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGt > 2:3804382/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGt > 1:1661203/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATg < 1:946511/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGAGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATg < 2:3711965/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGATCGATGACCTGGTATGc > 1:1128416/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGc < 1:2067758/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCa < 2:3621724/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCa < 2:2822351/150‑1 (MQ=255) gCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAACAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATga < 1:4305694/150‑1 (MQ=255) gCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATga < 2:3434687/150‑1 (MQ=255) gCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATga > 2:3302218/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATgaga < 2:574712/150‑1 (MQ=255) cAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATgaga > 1:3254210/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATgaga < 2:54520/150‑1 (MQ=255) aaTTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGac < 2:2921353/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGaca < 1:3931935/150‑1 (MQ=255) gCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATc > 1:801357/1‑150 (MQ=255) ctctGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATcc > 2:2418458/1‑150 (MQ=255) tctGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCa > 2:4084783/1‑150 (MQ=255) tctGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCa > 2:3415836/1‑150 (MQ=255) tctGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCa > 2:1745535/1‑150 (MQ=255) tGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACt < 2:211711/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCa > 1:120358/1‑150 (MQ=255) cTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATa < 1:1830812/150‑1 (MQ=255) tGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATAc < 1:2998495/150‑1 (MQ=255) tCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCt > 2:2567582/1‑150 (MQ=255) cAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTgg > 2:4128476/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGgag < 2:838849/150‑1 (MQ=255) aCGCAAACGGCGCTTTTAAGGCGCCGTTTTCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTcc > 1:1337971/1‑87 (MQ=25) aCGCAAACGGCGCTTTTAAGGCGCCGTTTTCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTcc < 2:1337971/87‑1 (MQ=25) aCGACAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCAGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGgaga < 1:1933358/150‑1 (MQ=255) aCGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGgaga < 1:483986/150‑1 (MQ=255) gAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGc > 2:1915855/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGa < 1:107144/58‑1 (MQ=255) aaaCGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCt < 2:2280732/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCTGc < 1:895945/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCTGcc < 1:3612900/150‑1 (MQ=255) ggCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATAACTGGAGAGCCTGCCg > 2:2974068/1‑150 (MQ=255) cTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCTGCCGGCATa < 2:3837941/150‑1 (MQ=255) | CTCGACCCGGGGAAGCTGTGACGTGATGCCTGCGCAAATGACCTATGAAGACTCGACAGGCAAGCTCAACATTCTCGAATACCGCGCAGCTGGCATCAATTGCCGCGGCCAAAATTGAGCTCTGAATGCTGTCCAAACGAAAACGGCGCCTTAAAAGCGCCGTTTGCGTTGGGAAAACGGTGGGTCAGTGGCCTGGATACTCTGCAACCACTTCATCCCGTCCGCTCTTGTTGAGACCGATGACCTGGTATGCATGAGAGACACCATCCACTTCCATACCTGGAGAGCCTGCCGGCATA > NC_002947/6130999‑6131297 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |