Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 798,667 | T→G | 8.2% | intergenic (+19/+8) | fklB‑I → / ← PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 798,667 | 0 | T | G | 8.2% | 641.5 / 32.0 | 226 | intergenic (+19/+8) | fklB‑I/PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (113/91); new base G (3/17); total (116/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGTCG > NC_002947/798519‑798816 | cTGATGAACGCTGGCAGCAAAGGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGc < 1:4080536/150‑1 (MQ=255) tgatgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGcc < 1:1305612/150‑1 (MQ=255) gatgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCg > 2:2937764/1‑150 (MQ=255) atgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGACGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCgg > 2:951849/1‑150 (MQ=255) tgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGc < 2:2656592/150‑1 (MQ=255) tgaACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGc < 1:2315341/150‑1 (MQ=255) aaCGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCt < 2:4207488/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTc > 1:1009591/1‑150 (MQ=255) gCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCaa < 2:1729564/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCaa < 1:379510/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTcca < 1:1124411/150‑3 (MQ=255) gCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTcca < 2:3764565/150‑3 (MQ=255) cTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTccag < 1:1522566/150‑4 (MQ=255) tGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAtt > 1:1482062/1‑150 (MQ=255) gcagcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTcc > 1:4487993/1‑150 (MQ=255) cagcaATTGGCGCGTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCATGGCTTTGGCAGCATCCCGCCGCACTGCTTTCTGTTGTTCTACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCa < 1:2582075/150‑1 (MQ=255) cagcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACTTCGAGCTGCTCGACTTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCa < 1:2993688/150‑1 (MQ=255) cagaaATTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGTGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCTTTGGCAGCATCCCGCCGCACCGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGCGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCa < 1:2993557/150‑1 (MQ=255) agcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAg > 2:3295147/1‑150 (MQ=255) gcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCCATTCCAGt > 2:3657838/1‑150 (MQ=255) caAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTc > 1:65259/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGt > 2:393110/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTccc > 2:1269863/1‑150 (MQ=255) 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gACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa < 2:2543091/150‑1 (MQ=255) gACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa > 1:3424580/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGaa > 2:1984842/2‑150 (MQ=255) aCGTCGAGCAGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAAt > 1:3574338/1‑150 (MQ=255) cGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAAtt < 2:1460059/150‑1 (MQ=255) tCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCa > 1:961025/1‑150 (MQ=255) agcagcTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGcc > 1:4472271/1‑150 (MQ=255) gctgctCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGccc > 1:2547444/1‑150 (MQ=255) tgctCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGc < 1:3711518/150‑1 (MQ=255) ctCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTc > 2:2784159/1‑150 (MQ=255) ctaCGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCACAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCAt < 2:130201/148‑1 (MQ=255) cGACGTTATGTAATCCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCATCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCAt < 1:4428838/150‑1 (MQ=255) tCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAg < 2:3327657/150‑1 (MQ=255) tGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGt < 2:1962976/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGGTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCt > 2:4427774/1‑150 (MQ=255) cccggACGCCGGCCCCCCCGGCCACAATACCAGTCTGTCCCCCCACGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCCgg < 1:2048006/147‑1 (MQ=255) aattgAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTgg > 1:2483112/5‑150 (MQ=255) cTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGt > 1:1973515/1‑150 (MQ=255) attgAGGCCGGCAGGGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGc < 2:3128620/63‑1 (MQ=37) ttgAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTc > 1:3313237/3‑150 (MQ=255) ggAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCa > 2:3446573/1‑150 (MQ=255) gccggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCa > 2:964882/1‑150 (MQ=255) gccggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCa > 2:1049618/1‑150 (MQ=255) ccggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAg < 2:1009591/150‑1 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGt > 1:4180087/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTtcgt > 2:1621968/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTtcgtcg > 2:732077/1‑150 (MQ=255) | GCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCTGTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGCATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGTCG > NC_002947/798519‑798816 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |