| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,348,787 | C→A | 9.1% | intergenic (‑247/+507) | galP‑I ← / ← PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,348,787 | 0 | C | A | 9.1% | 493.8 / 28.4 | 153 | intergenic (‑247/+507) | galP‑I/PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/71); new base A (7/7); total (75/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTACG > NC_002947/1348639‑1348936 | gTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACaa > 2:3072006/1‑150 (MQ=255) aCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCATCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTAt < 2:1203883/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGCAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGTTTGTTAGGTGTTGTCGTACACCTATg > 1:1225266/1‑150 (MQ=255) gcgcgGTACCCGGGCGCTACGTACTGGCAGGAGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCACCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACGATgg > 2:2476179/1‑150 (MQ=255) gcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATgg < 1:1159021/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATgg > 2:3670045/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACGGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGAttatta < 2:3555122/150‑1 (MQ=255) gcTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAg < 1:105661/150‑1 (MQ=255) gcTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAg < 2:1853277/150‑1 (MQ=255) gcTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAg > 1:1096596/1‑150 (MQ=255) cTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAgt < 1:3400546/150‑2 (MQ=255) tACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCACCAGGTGCGGGTGCAGCGGGAGGGGTGTCGACAGGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGGGATTATTAGCACggg > 2:3722294/1‑150 (MQ=255) tACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg < 1:3364962/150‑1 (MQ=255) tACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg > 1:788572/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCTCGGGTTGTTGTTTTTTTTATGTGTTGTCGTTATACTATGTGTGATTTTTATCAATTGGAAGATg > 2:3469688/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATg > 1:4104721/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 2:489214/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 1:49342/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 1:49349/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt < 1:281288/150‑1 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGAGGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 2:1269690/1‑150 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc < 1:1757627/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc < 1:2702704/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc < 1:1935544/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa < 1:2597781/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGc > 1:293205/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGc > 2:3537221/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCt < 2:2484797/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCt < 2:2484756/150‑1 (MQ=255) cGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGCGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTg > 2:55343/1‑150 (MQ=255) aaGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAc < 1:1642538/90‑1 (MQ=255) aaGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAc > 2:1642538/1‑90 (MQ=255) agagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaata < 2:4285966/150‑1 (MQ=255) gagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaataa > 2:3893032/1‑150 (MQ=255) agGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATaaa < 2:1247463/150‑1 (MQ=255) ggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTc < 2:2336956/150‑1 (MQ=255) gggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGCGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTcc < 1:55343/150‑1 (MQ=255) ggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCa < 1:2950717/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:941358/150‑1 (MQ=255) acAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:2159758/149‑1 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAg > 1:4052579/1‑150 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAg > 1:4052914/1‑150 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAg < 1:3469688/150‑1 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAg < 1:3614973/150‑1 (MQ=255) aCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGa > 1:1665868/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAc < 2:2189497/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAc > 2:1643083/1‑150 (MQ=255) gggTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAAt > 2:2410382/1‑150 (MQ=255) gggTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAAt > 2:2078991/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc > 1:3197259/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc < 1:1856617/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg > 2:2832460/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 1:1056189/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 1:3670045/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 1:2476179/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCgg < 1:3392213/150‑1 (MQ=255) ctgCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCggg < 2:3842245/148‑1 (MQ=255) gCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCt > 2:216659/1‑150 (MQ=255) gggATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTCTGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGc < 1:89455/150‑1 (MQ=255) gATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAg < 2:3062687/150‑1 (MQ=255) gATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATACGGGCTGCAg > 2:3413827/1‑150 (MQ=255) ggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGc < 1:2737993/150‑1 (MQ=255) ggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGc < 1:2027428/150‑1 (MQ=255) gtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGctct < 1:455590/150‑1 (MQ=255) tCGACTTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTg < 2:3293216/150‑1 (MQ=255) tCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTg > 1:2896040/1‑150 (MQ=255) tCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTg > 1:2511709/1‑150 (MQ=255) tCGACAGGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTg < 1:4317413/150‑1 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc < 2:788572/150‑1 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc < 1:4106493/150‑1 (MQ=255) aCATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCg > 1:2759055/1‑150 (MQ=255) cATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt < 1:1984421/150‑1 (MQ=255) cATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt > 1:3455359/1‑150 (MQ=255) cATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt < 1:789640/150‑1 (MQ=255) tGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTgg < 1:3597371/150‑1 (MQ=255) cGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTg < 1:1095122/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTa < 1:148646/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTa > 1:4388745/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAg < 2:251514/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGa < 2:4467016/150‑1 (MQ=255) gCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACa < 1:4507440/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAt < 2:2157670/150‑1 (MQ=255) gttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtact > 2:570847/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 2:1358765/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 2:1358827/1‑150 (MQ=255) tttttGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGa > 2:498960/1‑150 (MQ=255) ttttGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGAc > 2:2011764/1‑150 (MQ=255) ttGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTg > 1:1399294/1‑150 (MQ=255) gTTATGTGTTGTCGTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTggg > 1:3759189/1‑150 (MQ=255) tATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGc > 1:4231898/1‑150 (MQ=255) gtgtTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGctct > 1:3125859/1‑150 (MQ=255) gtgtTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGctct > 1:3126163/1‑150 (MQ=255) gttgtCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcg < 1:3072006/150‑1 (MQ=255) gttgtCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcg > 1:650675/1‑150 (MQ=255) ttgtCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcgc > 1:1794126/1‑150 (MQ=255) ttgtCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcgc > 1:1554445/1‑150 (MQ=255) ttgtCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcgc > 1:3723991/1‑150 (MQ=255) gTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGt > 2:402345/1‑150 (MQ=255) gTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGt > 2:2673547/1‑150 (MQ=255) cAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTAcg < 1:3893032/150‑1 (MQ=255) | GGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTACG > NC_002947/1348639‑1348936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |