| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,414,219 | T→C | 5.2% | S86G (AGC→GGC) ‡ | PP_1236 ← | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,414,219 | 0 | T | C | 5.2% | 800.0 / 20.9 | 249 | S86G (AGC→GGC) ‡ | PP_1236 | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (150/84); new base C (9/4); total (159/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCGCGC > NC_002947/1414070‑1414368 | cAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCg > 1:934665/1‑150 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCgg > 1:986994/1‑150 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGATGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCgg > 2:1833589/1‑150 (MQ=255) ggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGa > 2:690022/1‑150 (MQ=255) aggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCa > 1:4521151/1‑150 (MQ=255) gtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCAGCGCGGACCaggaa < 1:1232294/150‑5 (MQ=255) tCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCg > 1:2905467/1‑150 (MQ=255) tCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCg > 1:3999238/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGa > 2:2834847/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAg > 1:2075998/1‑150 (MQ=255) aGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAggg > 2:1432527/1‑150 (MQ=255) gTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTc > 2:3796924/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCATGGAAGAACTGGCACTGCTGGTTGATGTGGTCCGGGCGGTTGGCTGCGCTCACGTAGGCCACATACGGACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGGGGACCACGTCGAGGGTCAgg < 1:2895287/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAgg > 2:4256463/1‑150 (MQ=255) tGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGc > 2:4003381/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGcc < 2:1093718/150‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGcc > 1:1055812/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGt > 1:2595514/1‑150 (MQ=255) 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gcgGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCaa > 2:177928/1‑150 (MQ=255) cgGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAg > 1:170901/1‑150 (MQ=255) ggtggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGGTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGc > 2:1469149/1‑150 (MQ=255) ggtCATGTAAGAACTGGCACAGCTGTTTTATGATGTCCGGGCGGTCGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg < 1:3951945/150‑1 (MQ=255) ggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGATGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg < 1:2518165/150‑1 (MQ=255) ggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg < 2:3424413/150‑1 (MQ=255) tCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGc > 1:1499287/1‑150 (MQ=255) agtaataaCTGGCACAGCTCGTTGTTGATGTCGGGGGGGTTGGCAGCGCTCACGTAGGCCAAATCCGGACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAgg < 1:83030/144‑1 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAggg > 2:191753/1‑150 (MQ=255) gaagacCGGGCCCAGCTCGTTGAGGATGTCCGGGCGGTCGGCCGCGCTCCCGTAGGCCACATACGGCCGGGCCGGCGGGCGCACTTCCGGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 1:1971608/150‑1 (MQ=255) 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gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGTAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgag > 1:490429/1‑150 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgag > 2:2392309/1‑150 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGAc > 1:3263240/1‑150 (MQ=255) tCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGcc > 2:2110901/1‑150 (MQ=255) tCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGcc > 1:3176405/1‑150 (MQ=255) tCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGcc > 1:908158/1‑150 (MQ=255) ggttgttGATGTCCGGGGGGTCGGCAGCGCTCCCGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCa < 1:1948987/149‑1 (MQ=255) ttGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg > 1:276320/1‑150 (MQ=255) atgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCg > 1:3224214/1‑150 (MQ=255) atgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCg > 2:4305503/1‑150 (MQ=255) tgatgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGt > 1:464682/1‑150 (MQ=255) ctgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTcc < 2:2789163/149‑1 (MQ=255) tgTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTccc > 1:4454021/1‑150 (MQ=255) gTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCa > 1:805165/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAg > 1:4435665/1‑150 (MQ=255) 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aTACGGACGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGt < 2:644427/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGtctc < 1:2615488/150‑1 (MQ=255) gAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGc > 2:4460631/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAAACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGc > 1:1566167/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTg > 2:1555219/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTgg < 2:3527309/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTgg < 2:387470/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggc > 1:3681164/1‑150 (MQ=255) ggCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCa < 1:3970708/150‑1 (MQ=255) ggCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCa > 2:3707044/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 2:397012/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 2:3070245/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa > 1:1841920/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTCCGCGATGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGAGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGa < 1:2953630/150‑1 (MQ=255) tCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCGTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg < 2:3369809/150‑1 (MQ=255) acgtGGTCCGCAGCGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg > 1:381377/4‑150 (MQ=255) acgtGGTCCGCAGCGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCAGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg > 1:549196/4‑150 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg < 2:2075998/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg < 2:2910051/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGAGTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTg > 2:3732991/1‑150 (MQ=255) gTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGac < 1:177928/150‑1 (MQ=255) gTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGac > 1:1279173/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGaccac < 1:3146414/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGaccacc > 2:2159230/1‑150 (MQ=255) gcTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACcgc < 1:1469149/150‑1 (MQ=255) tGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCgcgc > 2:3827859/1‑150 (MQ=255) tGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCgcgc > 2:3196771/1‑150 (MQ=255) | CGCCAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCGCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCACCGCGC > NC_002947/1414070‑1414368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |