| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,681,709 | A→T | 6.8% | E62D (GAA→GAT) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,681,709 | 0 | A | T | 6.8% | 548.2 / 20.2 | 174 | E62D (GAA→GAT) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (92/69); new base T (7/4); total (99/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CCATTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681560‑1681857 | ccATTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGaa < 2:1348057/150‑1 (MQ=255)ccATTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTAGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGaa > 1:3455058/1‑150 (MQ=255) aTTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGCCCCGCCTTTCCGCCGCGCGCGGCGGGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGc < 2:234947/150‑1 (MQ=255) aTTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCACCTCAAGGGCAACGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGc > 1:846336/1‑150 (MQ=255) tttCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCGGGTCGAAGcc > 1:1848164/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCCACCCTTGCTGCCCCGCCTGTCCGCCGCGCGCGGCGTGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccag < 1:3270928/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCACCCTTGCGGACCCGCCTCTCCGCCGCGCGCGGCGTGCCGACCGCGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagc < 2:2465574/150‑1 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCCTCGAccagcgc > 1:2580511/1‑150 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGGGCAGAGCGAGGCCGGGCTGGACCACTGCCGGGCACGCCTGCTGCCCTACCCGCAGCTCAATGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCAACGAccaccgc > 1:910798/1‑150 (MQ=255) gCCACCCGGGCTGACCCGCCCTTCCGCCGCGCGCGGCGTCCAGCGCGCGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcca < 2:910798/150‑1 (MQ=255) cACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgccagc > 1:1868883/1‑150 (MQ=255) cACCCTGGCCGCCCCGCCTTCCCGCCGCGCGCGGCGTGCCGCCCGCGGCCCCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgccagc < 1:2854577/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCa > 2:1632380/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCa > 2:1632285/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCa > 2:1274956/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 2:3182566/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 2:4481926/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGCCTCCCCGCGGCGCGCGGCGTGCCGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTc < 1:968624/150‑1 (MQ=255) tGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCa > 2:1336603/1‑150 (MQ=255) cgACCCGCCGTTCCGCCGCGCGCGGCGTCCCGAGCGCGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCa < 1:4373392/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtc > 1:4011790/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 2:2193429/1‑150 (MQ=255) cTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGc > 2:1818714/1‑150 (MQ=255) tgccgccgcGCGCGGCGTGCCGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGa < 1:934498/147‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACt > 1:3629489/1‑150 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 1:2688677/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:1612109/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCGGGCCGCGCGCGGCCGCCCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:3437644/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATg < 1:2246167/150‑1 (MQ=255) ccgcgGCCAGCACACCGAGGCCGACCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCACCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCTCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGc < 2:1517251/149‑1 (MQ=255) gcgccgagCGCGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt < 2:3471291/145‑1 (MQ=255) cAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGcc < 1:508802/150‑1 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCa > 1:2518898/1‑150 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCAGCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGGCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGccc > 2:561885/1‑149 (MQ=255) cGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGc > 2:2865868/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACGTCGATGCCGACGGTGCCACCGc > 2:2207000/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAg < 2:4025340/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAc > 2:3026207/1‑150 (MQ=255) cTGGACCAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCCGCAGCTCACGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGACGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCCCCGTc < 2:2841836/150‑1 (MQ=255) tGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCg > 1:469603/1‑150 (MQ=255) tGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCg < 2:3700373/150‑1 (MQ=255) ggACACGCGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 1:2379123/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg > 1:3699330/1‑150 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 1:2854982/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 2:1037326/150‑1 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 1:2021257/150‑1 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 1:1789231/150‑1 (MQ=255) cAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt > 1:4341832/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTg < 1:2078324/150‑1 (MQ=255) gagCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGAAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAATCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt > 2:655209/1‑150 (MQ=255) agCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCGCCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTg < 2:2850096/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCACGCCTGCGGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 2:1370704/150‑1 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcc > 1:1457385/1‑150 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcc > 1:166549/1‑150 (MQ=255) ggCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgggggt < 1:4083295/150‑4 (MQ=255) gCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctg > 2:1698050/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGTCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTAGGCGACTTCGATGCCGACGTTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcg > 2:2775773/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCCTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGGCGGCGACTGCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcc < 2:2505993/150‑1 (MQ=255) cccTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 1:1838281/1‑150 (MQ=255) ccTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGTCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTg > 2:390544/1‑150 (MQ=255) cTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGc > 2:1223355/1‑150 (MQ=255) cTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGc > 2:4284003/1‑150 (MQ=255) cTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCACATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGc > 1:3119349/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCgg < 2:705904/150‑1 (MQ=255) cagcagCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACGTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGcc > 2:47322/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc > 1:3849974/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc > 2:2993842/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc > 1:558743/1‑150 (MQ=255) gcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGTGGCCCATGt < 2:1617350/150‑1 (MQ=255) gcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt < 1:1523428/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc > 2:3193466/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc < 2:287651/150‑1 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg < 2:1901385/150‑1 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 2:3580350/1‑150 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 1:113287/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 1:1196846/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 2:2532536/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 2:2062521/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTgg < 1:590186/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGccc < 2:946943/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGccc > 2:2580038/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGccc > 2:316046/1‑150 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCaa > 1:3030703/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 1:1632285/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCg > 2:603029/1‑150 (MQ=255) ggcgctgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa > 1:3753723/4‑150 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 2:3794536/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 1:2652651/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGAGTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 2:3099339/150‑1 (MQ=255) gcgctgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 1:1370205/3‑150 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 2:1022042/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:716058/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:3539187/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt > 2:2307574/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 1:31801/150‑1 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 1:1512252/150‑1 (MQ=255) tgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 2:4193310/1‑150 (MQ=255) tgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 1:2529018/1‑150 (MQ=255) tgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg < 2:2363633/150‑1 (MQ=255) aaGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACg < 1:1403490/150‑1 (MQ=255) | CCATTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681560‑1681857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |