Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 1,681,713 | A→T | 6.7% | I64F (ATC→TTC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,681,713 | 0 | A | T | 6.7% | 557.6 / 22.1 | 174 | I64F (ATC→TTC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (89/72); new base T (7/5); total (97/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCTG > NC_002947/1681565‑1681862 | tCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCAt > 1:2720202/1‑150 (MQ=255) gaaaCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcc > 2:31801/3‑150 (MQ=255) tAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca > 1:1901385/1‑150 (MQ=255) tAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTCCCGCCGCGCGCGGCGTGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca < 1:4320118/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCCCCCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCGCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccag < 1:1810556/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc < 2:1716311/150‑1 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCCTCGAccagcgc > 1:2580511/1‑150 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag < 2:3073566/150‑3 (MQ=255) ccACCCTTGCTGACCCGCCTGCCCGCCGCGCGGGGCGGGCAGCGCGCGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtc < 1:4082766/150‑6 (MQ=255) cACCCTGGCCGCCCCGCCTTCCCGCCGCGCGCGGCGTGCCGCCCGCGGCCCCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgccagc < 1:2854577/150‑1 (MQ=255) cACCATAGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCCTGCAGAGCGAGGCCGATCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCAACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCACGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCAACGAccagcgccagc > 1:1868872/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCa > 2:1274956/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCa > 2:1632285/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCAt > 1:1490010/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 2:3182566/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCt > 2:2468267/1‑150 (MQ=255) tGACCCGCCTTTCCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCa < 2:695356/150‑1 (MQ=255) cgACCCGCCGTTCCGCCGCGCGCGGCGTCCCGAGCGCGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCa < 1:4373392/149‑1 (MQ=255) 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ccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCg > 2:2092667/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:1612109/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATg < 1:2246167/150‑1 (MQ=255) ccgcgGCCAGCACACCGAGGCCGACCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCACCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCTCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGc < 2:1517251/149‑1 (MQ=255) gcgccgagCGCGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt < 2:3471291/145‑1 (MQ=255) cAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGcc < 1:508802/150‑1 (MQ=255) cgcgcGGCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCAcc < 1:581449/149‑1 (MQ=255) cGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACGTCGATGCCGACGGTGCCACCGc > 2:2207000/1‑150 (MQ=255) cggCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa < 2:460800/149‑1 (MQ=255) ggCCGCGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAg < 2:4025340/150‑1 (MQ=255) 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ggACACGCGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 1:2379123/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg > 1:3699330/1‑150 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 2:1037290/150‑1 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg > 2:162656/1‑150 (MQ=255) cAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt > 1:4341832/1‑150 (MQ=255) 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agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc > 1:3849974/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc < 2:2391261/150‑1 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc > 2:2993842/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc < 2:136595/150‑1 (MQ=255) gcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCa < 2:1183190/150‑1 (MQ=255) 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aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 2:2532536/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTgg < 1:590268/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGccc > 2:2580038/1‑150 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCaa > 1:3030703/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 1:1632285/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 1:1719361/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 1:2026604/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 1:927290/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCg > 2:603029/1‑150 (MQ=255) ggcgctgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa > 1:3753723/4‑150 (MQ=255) 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gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:899441/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 1:31801/150‑1 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt > 2:2307574/1‑150 (MQ=255) tgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 2:4193310/1‑150 (MQ=255) tgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 1:2528846/1‑150 (MQ=255) 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aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCTg > 1:495276/1‑150 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCTg > 2:966685/1‑150 (MQ=255) | TCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCTG > NC_002947/1681565‑1681862 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |