| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,780,171 | T→C | 5.3% | intergenic (+88/+18) | PP_1587 → / ← dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,780,171 | 0 | T | C | 5.3% | 291.8 / 4.6 | 95 | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (75/11); new base C (3/2); total (81/14) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.50e-01 | |||||||||||
TGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGACCC > NC_002947/1780022‑1780320 | cctgagggcgcagcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgt < 1:1678621‑M2/1‑1 (MQ=255)cctgagggcgcagcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggccctacgcgggcgt > 2:2767740‑M2/150‑150 (MQ=255) gCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACGGCGCTGCGCTTGAAAACAGCGCTGTAACAGGGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 1:4445198/1‑150 (MQ=255) cAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 2:1052259/1‑150 (MQ=255) cAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGCGCTTGAAATAAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 2:1462889/1‑150 (MQ=255) agcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAgg < 1:3515743‑M2/12‑1 (MQ=255) agcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgCGCCCGCGAAgg < 1:189611‑M2/12‑1 (MQ=255) gcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgCGCCCGCGAAggg < 1:3461548‑M2/13‑1 (MQ=255) aCTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACAGCCCTGCGCTTGAAAACAGCGCTGTAACAGTGGGAGCGGGCGTTCCCGCGCGgggg > 2:1821883/1‑150 (MQ=38) aCTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAATGCGCTGCGCTTGCAATCAGCGCTGTAACAGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGCAgggg > 1:2833932/1‑150 (MQ=255) ggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGt < 1:1480257‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTg < 1:750586‑M2/17‑1 (MQ=255) aGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAg > 2:1425459/1‑150 (MQ=255) cTGCATAGGAGTGCGGCCACCCGGGTTTCTGGCACTTAGCCCATAACAAGGCCCTGGGGGGGCGCGCCCGCCCCCACCGGTACGGGGGGGCGCGCAAAAACAGCCGTGAACGGGTGGCCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCg < 2:3689921/150‑1 (MQ=255) tGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCGGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACGGGGTTGATCAGCgg > 2:3793500/1‑150 (MQ=255) tGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACATCGCTGCGCGTGAAATCAGCGCGGTAACAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATAAGCgg > 2:3793355/1‑150 (MQ=37) tGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACAGCGCTGCGCGTGGAATCAGCGCGGTTCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCgg > 2:3793287/1‑150 (MQ=38) tGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCCCAGGTACAGCGCGGCGCGTGGAATCAGCGCTGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCCCGAACGGGTTGATCAGCgg > 1:2901813/1‑150 (MQ=255) gagtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGCTGCGCATGAAAACAGCGCGGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGGGGATCAGCGGTGTTGcc > 2:2730181/1‑149 (MQ=37) ctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCa < 1:384322‑M2/32‑1 (MQ=255) gtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCACGTACGGCGCTGCGCGTGGAATCCGCGCGGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGGTAAGCCGGGTTGCAgg > 2:38338/1‑150 (MQ=25) tgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCGTGAAAACAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGa > 2:2546919/1‑150 (MQ=255) gCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATGAGCGGTTTTTCAGGAAGgc > 2:3629445/1‑150 (MQ=255) gggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTcc > 2:2897750‑M2/99‑150 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGTGCGCAAgcgcacggaa > 1:3754045/1‑144 (MQ=38) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAACAGCGCTGTAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGTGCGCAAgcgcacggaa > 1:3754064/1‑144 (MQ=37) tAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGGTCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTc > 2:2132875/1‑150 (MQ=255) aCCATACCACGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCTGCGATTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGAt < 2:371697/150‑1 (MQ=37) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACCTGTACAGCGCTGGGCGTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGGAGGAAGGCGCGCATTCGCTCCGCCGCGTCGATGc > 1:4038446/1‑150 (MQ=37) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGGGTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTCGATGc > 2:1844971/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGTAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGc > 2:3013047/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCACCCACCGGTACTGCGCTGCGCGTGAAAACAGCGCTGTACCAGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGGGTGATCAGCGGGTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTCCATGc > 1:4123899/1‑150 (MQ=255) tATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCAGGTACTGCGCTGCGCTTGAATTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGTTGATCAGCGGTTTTGCCGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCAt > 2:1042902/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACACGTAAATCGCTGCGCTTTAAATCAGCGCTGTAACAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTTATAAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCACCGCCGCTTAGATGCATTCGGcc > 2:3223195/1‑150 (MQ=38) accccTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACACGTACAGCGCGGCGGGTGCACACAGCGCGGTACCGGTGGGGGCGGGCGGGCCCCCGAAGGGGGTGGTCAGCCGGTTTTCAGGCAGGCGCGAATGCGCTCCGCCCCGTCGAGGCATTAGGcc > 2:480853/3‑150 (MQ=255) ggCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGGTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCCGCGGTGCAAc > 2:2519231/1‑150 (MQ=255) agctggatatgagtgaggcgaccctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAAc < 1:212031‑M2/84‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGCATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAg > 2:4194570/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAg > 2:4194591/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAAGAAGGCGCGAATGCGCACCCCCGCTTCGATGCATTAGGCCAGCGGTGCAACCAg > 1:338552/1‑150 (MQ=255) gcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTg > 2:3566007/1‑150 (MQ=255) tatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGcc < 1:2105463‑M2/91‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc < 1:3738858/90‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc > 2:3738858/1‑90 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGcc > 1:2827979/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGcc > 1:3069978/1‑150 (MQ=18) ccGCTCCCACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGcc > 1:2333873/1‑150 (MQ=18) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCa > 1:3953307/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCa > 2:264502/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATg > 2:2813817/1‑150 (MQ=255) cccACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcg > 1:2448099/1‑150 (MQ=21) cccACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcg > 1:2448115/1‑150 (MQ=21) cccACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcg > 1:4234389/1‑150 (MQ=21) cccACAGGTACAGCGCTGATTTCAAGCGCAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcg > 1:2448087/1‑150 (MQ=21) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 1:1623867/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 1:4435471/1‑150 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 1:4378038/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 2:2904521/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:4318149/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgc > 2:168418/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgc > 2:2827138/1‑150 (MQ=255) ggTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgcg > 1:1227757/1‑150 (MQ=255) gaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACgcgc > 2:2005091‑M2/48‑150 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGcc > 1:1365628/1‑150 (MQ=255) tgcgctgcgcTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCgg > 2:105885/1‑150 (MQ=255) gctgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCAc > 2:4050564/1‑150 (MQ=255) tgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCAccc > 1:261342/1‑150 (MQ=255) tgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCAccc > 1:3110387/1‑150 (MQ=255) gctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCggg > 1:3595862/1‑150 (MQ=255) ctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGt > 1:3381216/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGtt > 2:865504/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGtt > 1:3820697/1‑150 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGtt > 1:2613964/1‑150 (MQ=255) gAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCa > 1:3703866/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAc > 2:2088198/1‑150 (MQ=255) gtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcc < 1:761151‑M2/121‑1 (MQ=255) gtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcc < 1:4102935‑M2/121‑1 (MQ=255) aaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcc > 1:1325150/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGACGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcccc > 2:522044/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcccc > 2:521930/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCAt > 2:3389302/1‑150 (MQ=255) cctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATcc > 1:80683‑M2/24‑150 (MQ=255) cTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAc > 1:1887899/1‑150 (MQ=255) tACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTc > 2:2475729/1‑150 (MQ=255) aaggcccgtcgcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCa < 1:2498388‑M2/133‑1 (MQ=255) accccttcgcgggcaCGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcg > 2:2790604‑M2/16‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgc > 1:3760743/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgc > 1:3756947/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCAGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgc > 2:2905385/1‑150 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgcg > 1:915280/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa > 1:2648792/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa > 2:1496896/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAg > 1:1293581/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAg > 2:3721892/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAg > 1:2368190/1‑150 (MQ=255) gcgggcgTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGt > 2:566567‑M2/8‑150 (MQ=255) gTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGAcc > 2:2324698‑M2/2‑150 (MQ=255) tGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGAccc > 2:918181/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGACCC > NC_002947/1780022‑1780320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |