Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,804,690 | 0 | T | G | 6.1% | 720.8 / 27.2 | 214 | intergenic (+53/‑119) | accA/tilS | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha/tRNA lysidine(34) synthetase TilS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/117); new base G (10/3); total (94/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.91e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TGCCGATCTGGTGCAGCAGCTGGACATGCTCGGCAAGTTCGACAACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCC > NC_002947/1804541‑1804839 | ccGATCTGGTGCAGCAGCTGGACATGCTCGGCAAGTTCGACAACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTc < 2:4478546/150‑1 (MQ=255) ccGATCTGGTGCAGCAGCTGGACATGCTCGGCAAGTTCGACAACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTc > 1:3195655/1‑150 (MQ=255) cGATCTGGTGCAGCAGCTGGACATGCTCGGCAAGTTCGACAACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCg > 1:4409964/1‑150 (MQ=255) 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ttgatGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTcc > 2:445879/1‑150 (MQ=255) ccgcgaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTcc > 1:3318539/8‑150 (MQ=39) gaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTgg > 2:3937826/4‑150 (MQ=255) gaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTgg > 2:3728908/4‑150 (MQ=255) gaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTgg > 1:3444407/4‑150 (MQ=255) gCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCt > 1:1410420/1‑150 (MQ=255) acACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCACTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCt > 1:1807400/2‑150 (MQ=255) aCCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTACATTGCTCa > 1:1494965/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGc < 1:571393/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGccc < 2:3148746/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGccc > 2:4139637/1‑150 (MQ=255) | TGCCGATCTGGTGCAGCAGCTGGACATGCTCGGCAAGTTCGACAACGATGCGCTACTGGCCCGTCGTTACGAGCGCCTGATGAGCTACGGCCTCTAATTCTGATTTGCCCCGGGGCCGTTTTGCGGCCCTTGTGATTGATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTATTGCGCTGCCCTTGAGGCTTGCGCCGTACGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCTTTCTGGAATCGAGCGAGGGCTAGATGATCAACCTCACTCCTTGGCTCAACGCCC > NC_002947/1804541‑1804839 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |