Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,870,190 | A→C | 5.7% | D113A (GAC→GCC) | cobD → | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,870,190 | 0 | A | C | 5.7% | 724.8 / 21.7 | 214 | D113A (GAC→GCC) | cobD | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/99); new base C (7/5); total (108/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGGTGG > NC_002947/1870042‑1870339 | gtggtgCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGAc < 2:2852720/150‑1 (MQ=255) gtggtgCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGAc < 2:3114858/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCACTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGc < 1:1197440/150‑1 (MQ=255) cGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCgg > 2:2514242/1‑150 (MQ=255) cGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCgg < 1:3655506/150‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGaa < 1:2002253/150‑2 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAg < 2:2254288/150‑1 (MQ=255) tGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAgg < 2:3222746/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgc > 1:4105668/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcg > 2:1986379/1‑150 (MQ=255) tggtggCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcggc > 2:1077275/1‑150 (MQ=255) tggtggCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcggc > 1:3458125/1‑150 (MQ=255) tggCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGcc < 2:237553/150‑1 (MQ=255) tGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTg > 1:1294521/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTgg < 2:3127086/150‑1 (MQ=255) tCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCt > 1:2578201/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCt > 1:1119188/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAc < 1:3537548/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAc < 2:1484305/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAc < 2:3759402/150‑1 (MQ=255) ttCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCt > 1:2595912/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGt > 2:3066253/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTc < 1:1499359/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAg > 1:2362780/1‑150 (MQ=255) ccGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCcgc < 1:3577519/150‑1 (MQ=255) gTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGa > 1:3173073/1‑150 (MQ=255) tataTCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaa < 1:2121723/150‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgc > 2:4505990/1‑150 (MQ=255) ctggctggTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGa < 1:3926537/150‑1 (MQ=255) tggctggTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAg > 2:673195/1‑150 (MQ=255) gctggTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCt < 1:2308449/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc > 2:57730/1‑150 (MQ=255) tGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGa < 1:1712628/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCTTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGc < 1:2216642/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGcc > 1:3021465/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGcc > 1:2717006/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTGGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGGGCTCGTCCAGCTcgcgc < 1:4301968/150‑2 (MQ=255) ggCGCTTGACGGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCAGGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCGGGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCggg < 2:1194912/150‑2 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg > 2:4350963/1‑150 (MQ=255) gcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaag > 2:3560879/1‑82 (MQ=255) gcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGc < 1:1030330/150‑1 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 1:3517313/1‑150 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTCGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 1:3517393/1‑150 (MQ=255) aCTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAg < 2:403148/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcg > 2:3981479/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcg < 2:4208174/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcgg < 1:3796357/150‑1 (MQ=255) cgcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcggc < 1:4239156/150‑1 (MQ=255) cgcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcggc < 1:3322040/150‑1 (MQ=255) gcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc > 2:2695601/1‑93 (MQ=255) gcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc < 1:2695601/93‑1 (MQ=255) gcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGAGGCCCGAgcggcg > 2:3729937/1‑150 (MQ=255) cGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGAc > 2:827231/1‑150 (MQ=255) cGTGGGGCTGCGCAGCCGGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAAGGCCTTGCGCCAGGGCGCCCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGAc < 1:2012547/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGTGGTGGCCCGAGCGGCGAcc < 2:1032486/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGa < 1:2067835/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGa < 2:2187855/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGt > 1:2755907/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCg > 2:3467203/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGt > 1:1886662/1‑150 (MQ=255) cgcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTg < 2:223115/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc < 1:2733144/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc < 1:477955/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc > 2:3781419/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTg < 1:3762510/150‑1 (MQ=255) 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gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTg > 2:1852411/1‑141 (MQ=255) gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGc > 2:408855/1‑150 (MQ=255) gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGc > 2:1870273/1‑150 (MQ=255) aGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCa < 2:3284684/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCg > 1:4373414/1‑150 (MQ=255) tgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAg > 2:51132/1‑150 (MQ=255) gcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgt < 1:4494705/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgtgt > 1:3273964/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCAATGCCTTGAGCAAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGtt > 2:278626/1‑150 (MQ=255) tGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcg > 1:2991139/1‑150 (MQ=255) gCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgcc > 1:2482989/1‑150 (MQ=255) cAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgccgc > 1:4178918/1‑150 (MQ=255) aaTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCcgcg > 2:3477570/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgt > 1:3427471/1‑150 (MQ=255) cctccgcCAGGTCGCCCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttgtt > 2:1523844/5‑150 (MQ=255) cTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttgtt < 1:2243842/150‑1 (MQ=255) atGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGGGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTc > 2:3689446/2‑150 (MQ=255) tccgcCAGGTCGCCCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCt > 1:986139/3‑150 (MQ=255) tccgcCAGGTCGCCCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCt > 2:3053563/3‑150 (MQ=255) tccgcCAGGTCGCCCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCt > 2:1754920/3‑150 (MQ=255) tGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCt > 2:1313619/1‑150 (MQ=255) gcCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGt < 1:2940149/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGtt > 2:342527/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGtt > 1:1014979/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGGCCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGttt > 2:3824037/1‑150 (MQ=255) gggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgt < 2:2105366/150‑1 (MQ=255) gggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgt < 1:1265545/150‑1 (MQ=255) gggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGATGTTCTGGTTtgt > 2:2582037/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg > 1:4009139/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:1338160/150‑1 (MQ=255) | GTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGGTGG > NC_002947/1870042‑1870339 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |