| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,897,249 | 0 | T | A | 6.3% | 589.1 / 21.1 | 174 | intergenic (‑60/+84) | PP_mr24/rdgC | mini‑ykkC regulatory region/recombination‑associated protein RdgC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (83/80); new base A (3/8); total (86/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GGATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCAA > NC_002947/1897100‑1897397 | ggATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGtt < 1:384020/150‑1 (MQ=255) atgatCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAc < 2:163726/150‑1 (MQ=255) tgatCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAcc < 1:2740814/150‑1 (MQ=255) 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ttACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCaa < 2:3155850/150‑1 (MQ=255) ttACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCaa < 1:1309007/150‑1 (MQ=255) | GGATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGC‑‑CTT‑GCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCGGCAA > NC_002947/1897100‑1897397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |