| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,170,155 | A→T | 5.1% | intergenic (+90/+598) | PP_1921 → / ← PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,170,155 | 0 | A | T | 5.1% | 615.9 / 12.4 | 180 | intergenic (+90/+598) | PP_1921/PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (79/91); new base T (3/7); total (82/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAG > NC_002947/2170008‑2170304 | ggATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCaga < 2:1263363/150‑1 (MQ=255)ggATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCaga < 1:1791169/150‑1 (MQ=255) gATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCagag < 2:1799613/150‑1 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc < 1:2213738/150‑1 (MQ=255) cAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCa > 1:4367340/1‑150 (MQ=255) cAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGAGGTGCTAGCAGAGCTAGCa > 2:2284292/1‑150 (MQ=255) agagGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCAc < 1:759166/150‑1 (MQ=255) gagGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCTCTGCTAGCAcc < 1:3713419/150‑1 (MQ=255) gagGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCAcc < 1:3699028/150‑1 (MQ=255) aaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGc > 2:162003/1‑150 (MQ=255) aaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGc > 2:2422971/1‑150 (MQ=255) aaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTAGTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGc > 1:1334064/1‑150 (MQ=255) cGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCAt < 2:3733889/150‑1 (MQ=255) gAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTTGGGCCTTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCTCTTTTTGCAtt > 2:550800/1‑150 (MQ=255) gAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCAtt > 2:3055942/1‑150 (MQ=255) gAAGAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCAtt < 2:3159547/150‑1 (MQ=255) aTAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATtgt < 2:3421481/150‑1 (MQ=255) tAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATtgtg > 2:2841136/1‑150 (MQ=255) aTCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCTCCGCTTTTGGCATTGTGtctc < 1:2533608/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCTTAGAGCTACCTAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTTTGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCg < 1:4218908/150‑1 (MQ=255) tCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCg > 1:813349/1‑150 (MQ=255) tCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCAGTGTGTCTCg > 1:4404915/1‑150 (MQ=255) tATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCggg > 1:3854321/1‑150 (MQ=255) tATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCggg > 1:553169/1‑150 (MQ=255) tttttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCa > 1:668308/1‑150 (MQ=255) ttttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCaa < 2:2342471/150‑1 (MQ=255) ggggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgc > 2:1873756/1‑150 (MQ=255) ggggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgc < 1:1688316/150‑1 (MQ=255) gggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgct > 1:3675912/1‑150 (MQ=255) gggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgct > 1:1601247/1‑150 (MQ=255) tcTTTATGCAGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATAACTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTATGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTgg > 2:1204433/2‑150 (MQ=255) cTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGt < 2:2630491/150‑1 (MQ=255) cTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGt > 2:3214640/1‑150 (MQ=255) tATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGAc < 2:2998876/150‑1 (MQ=255) gctgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCta > 1:1514983/1‑150 (MQ=255) tgcGTGCCTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGATAATTATTTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGTTGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCtata < 1:2666512/150‑1 (MQ=255) tgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCtata < 2:1734387/150‑1 (MQ=255) tgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCtata < 2:3546041/150‑1 (MQ=255) gACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGcc < 2:619358/150‑1 (MQ=255) gACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGcc < 1:225394/150‑1 (MQ=255) gACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGcc < 2:1012050/150‑1 (MQ=255) tACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaa > 2:3245585/1‑150 (MQ=255) tACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaa > 2:706030/1‑150 (MQ=255) cgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCt < 2:3722302/150‑1 (MQ=255) gaaTAGAGCTCCCGAAAAGCGCGTATTATGTAATATCTTATTTGGGGCCGTTTGTGCTTTGAATGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:3502369/148‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:4038002/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:47257/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:4443282/150‑1 (MQ=255) agagagCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGt < 2:1994229/148‑1 (MQ=255) gCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCttt < 2:4411137/150‑1 (MQ=255) cTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 1:603185/150‑1 (MQ=255) cTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 2:3734513/150‑1 (MQ=255) cTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 2:1010397/150‑1 (MQ=255) cTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 1:3006915/150‑1 (MQ=255) tACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTgg > 1:1574176/1‑150 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGACTTAAGGACTCTCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTCGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:707379/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:3939672/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:1926824/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:1422998/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:3012965/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:164850/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa > 2:1915048/1‑150 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:566966/150‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAg > 1:1888949/1‑150 (MQ=255) ccGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAg > 1:1893315/1‑150 (MQ=255) ccGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAg > 2:1453041/1‑150 (MQ=255) cGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGt > 1:643519/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTc < 1:2386786/150‑1 (MQ=255) aaaaGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCg > 2:1019708/1‑150 (MQ=255) taattaattAATATCTTATTTGGGGCCTTTTGTGCTTTTAAATTCAGATGCGTTGCTAGAATAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGTTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGaa < 1:1728518/149‑1 (MQ=255) aaTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 2:3933019/150‑1 (MQ=255) aTTACGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGAGGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATg < 2:3828232/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATg < 2:1488394/150‑1 (MQ=255) aGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTaca > 2:4050164/1‑150 (MQ=255) gTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaa < 2:2058883/150‑1 (MQ=255) tAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGTTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaac > 1:1030630/1‑150 (MQ=255) tAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaac > 1:2377557/1‑150 (MQ=255) tAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTAGAATGTacaac > 1:806307/1‑150 (MQ=255) atCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGtt < 1:3093806/150‑1 (MQ=255) ggggCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCgct < 1:1660731/150‑1 (MQ=255) gCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCgctgct < 1:1961024/150‑1 (MQ=255) gTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTcac > 2:2526632/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAg > 2:1770885/1‑150 (MQ=255) tgCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGc > 2:4007901/1‑150 (MQ=255) tgCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGc < 1:1212067/150‑1 (MQ=255) cTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg > 1:4272702/1‑102 (MQ=255) cTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 2:4272702/102‑1 (MQ=255) aaGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCa > 1:1432311/1‑150 (MQ=255) gCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTc < 2:153550/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTcc < 1:4351550/150‑1 (MQ=255) gTGCTAGCTCTGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGt > 1:314714/1‑150 (MQ=255) tGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTc > 1:40958/1‑150 (MQ=255) tGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTc > 2:779284/1‑150 (MQ=255) tAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtc < 1:2841136/150‑1 (MQ=255) aGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCCCCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtct < 1:3382148/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtctc > 2:1460964/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtctc > 2:442430/1‑150 (MQ=255) cAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCa < 1:2362278/150‑1 (MQ=255) cAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCa < 1:2105288/150‑1 (MQ=255) agagCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAg > 2:4195872/1‑150 (MQ=255) | GGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAG > NC_002947/2170008‑2170304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |