| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,383,367 | T→G | 7.5% | intergenic (+31/+56) | oprF → / ← cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,383,367 | 0 | T | G | 7.5% | 557.7 / 31.5 | 187 | intergenic (+31/+56) | oprF/cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (95/78); new base G (6/8); total (101/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CCAGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCG > NC_002947/2383218‑2383515 | aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:3319854/1‑150 (MQ=255) cGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGGAAAACCCGGCCTCGGcc < 2:22170/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGcc < 1:3982798/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGcc < 2:1796442/150‑1 (MQ=255) gtTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCggg < 2:127347/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGttt > 2:611090/1‑150 (MQ=255) aCTCGGTTGGCTCCGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGtttt < 2:3348860/150‑1 (MQ=255) tCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTc > 1:894081/1‑150 (MQ=255) cGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTca < 1:1609432/150‑2 (MQ=255) ggTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTcat < 1:4311518/150‑3 (MQ=255) gTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCttt < 1:4235478/150‑1 (MQ=255) gTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTcatg < 1:4408248/150‑4 (MQ=255) ttGTCTACGGAGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAAAGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTAAACCGTCTCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTg < 1:4033858/150‑1 (MQ=255) tGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGc < 1:2165857/150‑1 (MQ=255) gCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCt > 2:2453963/1‑150 (MQ=255) cTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTAGAAGCTCAGGTAGACGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTg < 1:73267/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg > 2:3510168/1‑150 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg > 1:3334131/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTggg > 2:278279/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGt < 1:1204648/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGttt < 1:3510168/150‑1 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa < 1:2220624/150‑1 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa < 1:4518109/150‑1 (MQ=255) aCCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAAcc > 1:4101565/1‑150 (MQ=255) ccGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCgg < 2:2141545/150‑1 (MQ=255) gTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc < 1:2929803/150‑1 (MQ=255) gTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc > 2:2521379/1‑150 (MQ=255) tCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGccc < 2:750/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGaa < 1:3433478/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGaa < 1:2975130/150‑1 (MQ=255) tGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAgg < 1:3105444/150‑1 (MQ=255) gCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGc < 2:4118482/150‑1 (MQ=255) aaCGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCTTCAGGGCCggtta < 1:2400074/150‑5 (MQ=255) aaCGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTcc > 2:1201695/1‑150 (MQ=255) aCGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCt < 1:857625/150‑1 (MQ=255) gCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGc > 1:3231294/1‑150 (MQ=255) ccACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg < 1:3056869/150‑1 (MQ=255) ccACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGATTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg < 1:1338563/150‑1 (MQ=255) cACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCgg > 2:1840059/1‑150 (MQ=255) ngaagaaGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCa > 1:2630646/2‑150 (MQ=255) aagaagGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGc < 2:1889164/150‑1 (MQ=255) gaagGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCt > 2:1300148/1‑150 (MQ=255) gaagGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCt > 2:1300115/1‑150 (MQ=255) agGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgc < 1:493391/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcg > 2:4506580/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgat > 2:2842943/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgat < 1:2028844/150‑1 (MQ=255) cTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgattgcga < 2:2310246/150‑1 (MQ=255) tCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATcc > 2:1683404/1‑150 (MQ=255) aaCCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGc > 2:3752023/1‑150 (MQ=255) cGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcccc > 1:3280163/1‑150 (MQ=255) cGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcccc > 1:2343870/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCGTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATAGCGATCCGCCCCa > 1:3043283/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATa < 1:99011/150‑1 (MQ=255) gcgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTGGTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCCGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAg > 2:1137465/1‑150 (MQ=255) cgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCATGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGc < 1:4150384/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctgctg < 1:1102575/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTc > 2:218219/1‑150 (MQ=255) cAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTcc > 2:1364940/1‑150 (MQ=255) cAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTcc > 1:3160532/1‑150 (MQ=255) aGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAac < 2:2373592/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTc > 1:1170109/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTcc > 1:855929/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCCGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTcc > 1:3864724/1‑150 (MQ=255) aGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTccc > 2:3674579/1‑150 (MQ=255) ccAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCaa < 1:2329113/150‑1 (MQ=255) cAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAAt > 2:2962445/1‑150 (MQ=255) cAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAAt < 2:2681241/150‑1 (MQ=255) cAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCCGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAAt < 2:3864724/150‑1 (MQ=255) aaGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATc < 1:647318/150‑1 (MQ=255) aaGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATc > 2:302180/1‑150 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCa < 1:4065922/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAgg > 1:4135808/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCCTAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGa > 1:87757/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGAtt > 1:2438771/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGAtt > 1:2100618/1‑150 (MQ=255) tttGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTg > 1:442296/1‑150 (MQ=255) gAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCg < 2:3135781/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTAc < 1:1554572/150‑1 (MQ=255) tGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGca > 1:2517023/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 2:2423035/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 2:1261055/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 2:3367295/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCACCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 1:1937997/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTGGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATCGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCACTCACCAGGAGTGCCGGGCGCCGcac > 2:3367502/1‑149 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcac > 2:2972452/1‑149 (MQ=255) aaaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaa > 2:1801494/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac > 2:4201207/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac < 2:894081/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac > 1:3148405/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaacc > 1:4182769/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaacc > 1:614662/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTCCGcaaaccaa > 2:3762874/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaa > 1:2774844/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaa > 1:981512/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac < 1:3899391/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac > 2:4081713/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac > 2:1807821/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCACACCAAACg > 1:52077/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGc < 1:617848/150‑1 (MQ=255) | CCAGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCG > NC_002947/2383218‑2383515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |