| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,679,155 | T→C | 6.4% | W66R (TGG→CGG) | PP_2347 → | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,679,155 | 0 | T | C | 6.4% | 639.9 / 20.5 | 200 | W66R (TGG→CGG) | PP_2347 | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/88); new base C (4/9); total (103/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TGACCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTT > NC_002947/2679006‑2679303 | tGACCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAATGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGt > 1:2155017/1‑150 (MQ=255)tGACCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGt < 2:1741475/150‑1 (MQ=255)tGACCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGt > 1:3089055/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTgg > 1:52625/1‑150 (MQ=255) cgGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGc < 1:15949/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCCGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGcc < 2:4489804/150‑1 (MQ=255) gCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCg > 2:891637/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGc < 1:3780661/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctg < 1:778659/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTTATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctgg < 1:2654460/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgg < 2:22218/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgg < 1:3054108/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGCGGCACGCCActgggc < 1:715476/150‑3 (MQ=255) cgcCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctg < 1:4393540/150‑1 (MQ=255) gcCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctgg < 2:126396/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 1:434215/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 1:3912899/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 2:674947/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGctggcctggc < 2:3786511/150‑1 (MQ=255) cGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTAtt < 2:2983527/150‑1 (MQ=255) gTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACTCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCCGCCTGGCTTGCCAGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTg < 1:1218924/150‑1 (MQ=255) gTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTg < 1:2729557/150‑1 (MQ=255) tccacggctggctGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGAt > 1:4006533/6‑150 (MQ=255) tggctggcTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTc > 2:4231736/1‑150 (MQ=255) ggctggctGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCa < 2:2914645/150‑1 (MQ=255) ggctggctGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCa < 2:611826/150‑1 (MQ=255) tgATGGCCGTGACGCGGTTTACCCGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCGCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGGGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTCTTGATCGTCcccgcccg > 2:3298466/1‑150 (MQ=255) tgATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCAccgcccg > 2:227603/1‑150 (MQ=255) tgATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCAccgcccg > 2:1914307/1‑150 (MQ=255) cGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTcc > 2:2944222/1‑150 (MQ=255) cGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTcc > 2:3038773/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTgg > 1:4136522/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTgg < 1:2634691/150‑1 (MQ=255) aCGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTggg < 2:3597604/150‑1 (MQ=255) cgcgGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGc > 1:3737863/1‑150 (MQ=255) gcgGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGcc > 1:836454/1‑150 (MQ=255) cgGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCg > 1:312366/1‑150 (MQ=255) ggTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGa < 1:1894851/150‑1 (MQ=255) 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aaaGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGc > 1:3304561/1‑150 (MQ=255) aaGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCt < 1:1947954/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGa < 2:630491/150‑1 (MQ=255) gAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAg < 2:3229789/150‑1 (MQ=255) cTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCg < 1:1578345/150‑1 (MQ=255) ttACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCgg < 1:1457293/150‑1 (MQ=255) tACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCgcg > 2:3140235/1‑148 (MQ=255) aCGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCgggg > 1:4319273/1‑150 (MQ=255) aCCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTg > 2:3982843/1‑150 (MQ=255) aCCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTg > 1:4445873/1‑150 (MQ=255) catcCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTa > 1:4144899/1‑150 (MQ=255) atcCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTAc > 2:2801450/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCt < 2:2162441/150‑1 (MQ=255) cTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTg < 1:3257948/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 1:2554637/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 2:3715516/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGa < 2:4213428/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 2:725610/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 2:725618/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 2:725374/150‑1 (MQ=255) gACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGc < 1:1015694/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCcgcg < 2:2127181/91‑1 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCcgcg > 1:2127181/1‑91 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCaaa > 1:3444481/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCaaa > 2:2845680/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCaaa > 1:445878/1‑150 (MQ=255) 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tGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAag < 2:912599/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGc > 1:1249412/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGc < 1:3745036/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGc > 1:4206688/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTAGTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGACGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTCCCTGAGCACACCCTTCCACCCCGacgcgc > 2:1205628/1‑145 (MQ=255) cGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCt > 1:3394789/1‑150 (MQ=255) gCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGc > 1:1092804/1‑150 (MQ=255) gCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGc < 2:777155/150‑1 (MQ=255) gCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGc < 2:2306434/150‑1 (MQ=255) ggATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACt > 2:4022769/1‑150 (MQ=255) aTGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgc > 1:3569124/1‑150 (MQ=255) aTGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgc > 2:4004328/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgcg > 2:1146942/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCa < 1:891637/150‑1 (MQ=255) gccaggccAGCGGCACGCCACTGGGCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgc > 1:3529168/7‑146 (MQ=255) gccaggccAGCGGCACGCCACTGGGCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTgc < 2:3529168/140‑1 (MQ=255) tGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATcc > 1:2312815/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCggg < 1:2452334/93‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAg > 2:261958/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGc > 1:735441/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGc > 1:4238571/1‑150 (MQ=255) | TGACCGCCGGCCTGCAGCGCCAGGGCTATGCCGTGGACTGGCTGGCTGATGGCCGTGACGCGGTTTACCAGGGGCAAAGCGAGCCTTACGACCTGATCATCCTGGACCTCGGCCTGCCTGGCTTGCCCGGCCTGGATGTGCTGGCCCAGTGGCGTGCCGCTGGCCTGGCCACACCGGTATTGATCCTCACCGCCCGCGGCTCCTGGGCCGAGCGCATCGAAGGGCTGAAGGCCGGGGCTGACGATTACCTGAGCAAACCCTTCCACCCCGAAGAGCTGCAACTGCGCATCCAGGCGTT > NC_002947/2679006‑2679303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |